孤立性Ebstein畸形中与心肌发育通路相关的遗传变异

该数据集包含47例孤立性Ebstein畸形(一种先天性心脏缺陷)病例的基因组变异数据,数据模态涵盖基因分型微阵列检测的拷贝数变异和靶向测序获得的基因序列信息,主要用于探究Ebstein畸形的遗传病因、心肌发育相关通路(如BMP、NOTCH信号通路)在疾病发生中的作用,以及罕见变异与三尖瓣畸形之间的关联,为先天性心脏病遗传机制研究和心肌发育分子通路分析提供关键数据支持。

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2016-11-01 更新
浏览 31
NOTCHRare sequence variantsnovel pathwayheart diseasecopy number variantsGenetic Variantsheart defectgenome-wide searchtricuspid valveEA genesheart defect phenotypesIsolated Ebstein Anomaly Implicated
Genetic Variants in Isolated Ebstein Anomaly Implicated in Myocardial Development Pathways

基本信息

大小
0.000744581 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2016-11-01
版本
v1

资源简介

孤立性Ebstein畸形中与心肌发育通路相关的遗传变异

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Genetic Variants in Isolated Ebstein Anomaly Implicated in Myocardial Development Pathways》。配套论文《Genetic Variants in Isolated Ebstein Anomaly Implicated in Myocardial Development Pathways》发表于 PLOS ONE(2016),DOI:10.1371/journal.pone.0165174。源站首次发布:2016-10-27。

【数据内容】

源站原始描述:Ebstein anomaly (EA) is a rare heart defect in which the tricuspid valve is malformed and displaced. The tricuspid valve abnormalities can lead to backflow of blood from the right ventricle to the right atrium, preventing proper circulation of blood to the lungs. Although the etiology of EA is largely unresolved, increased prevalence of EA in those with a family history of congenital heart disease suggests EA has a genetic component. Copy number variants (CNVs) are a major source of genetic vari…

【数据结构与技术规格】

文件数 10 个,合计 744.58 KB。S1 Fig.PDF:application/pdf,195.79 KB。S2 Fig.PDF:application/pdf,206.46 KB。S3 Fig.PDF:application/pdf,226.79 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0165174。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Genetics、Pharmacology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签:NOTCH、Rare sequence variants、novel pathway、heart disease、copy number variants、Genetic Variants、heart defect、genome-wide search、tricuspid valve、EA genes。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Genetics、Pharmacology、Environmental Sciences not elsewhere classified、Ecology、Biological Sciences not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Genetic_Variants_in_Isolated_Ebstein_Anomaly_Implicated_in_Myocardial_Development_Pathways/4123569

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Sicko, Robert J.; Browne, Marilyn L.; Rigler, Shannon L.; Druschel, Charlotte M.; Liu, Gang; Fan, Ruzong; et al. (2016). Genetic Variants in Isolated Ebstein Anomaly Implicated in Myocardial Development Pathways. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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源站:https://figshare.com/articles/dataset/Genetic_Variants_in_Isolated_Ebstein_Anomaly_Implicated_in_Myocardial_Development_Pathways/4123569

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数据说明

该数据集针对孤立性Ebstein畸形(一种罕见的先天性心脏缺陷,特征为三尖瓣畸形和移位)开展遗传变异研究。数据集包含47例孤立性Ebstein畸形病例的基因组数据,通过基因分型微阵列进行了全基因组范围的拷贝数变异(CNV)系统筛查,并利用定制的HaloPlex面板对3个已知Ebstein畸形相关基因及47个候选基因进行了测序。研究共识别出35个候选CNV(涉及24例病例)以及罕见序列变异(涉及11例病例),其中多个变异位于与心肌发育或功能相关的基因(如BMP信号通路、NOTCH信号通路中的HEY1等)。基因集富集分析进一步揭示了组蛋白修饰、心肌细胞分化以及核糖体RNA加工等通路在Ebstein畸形发病机制中的潜在作用。该数据集为探究Ebstein畸形的遗传基础、心肌发育异常与三尖瓣发育缺陷的关联提供了重要数据支持,主要应用于先天性心脏病遗传学、心肌发育分子机制及疾病病因学研究。

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