Rab28参与内皮细胞中NF-κB核转运的研究数据

研究以大鼠腹主动脉缩窄作为高血压动物模型,利用 FX-4000 周期性应变加载系统模拟高血压下血管细胞的力学条件,通过免疫荧光和免疫共沉淀鉴定 Rab28 与 NF-κB 的分布及相互作用

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2023-06-01 更新
浏览 8
蛋白质分类rab28endothelialcells
Involvement of Rab28 in NF-κB Nuclear Transport in Endothelial Cells

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.011804624 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-06-01
版本
v1

资源简介

Rab28参与内皮细胞中NF-κB核转运的研究数据

Involvement of Rab28 in NF-κB Nuclear Transport in Endothelial Cells

本数据集来自 plos.figshare.com,围绕 Rab28 在内皮细胞 NF-κB 核转运中的作用,包含 6 个文件,包括 Figure_S1.tif 至 Figure_S5.tif 及 Text_S1.doc。研究以大鼠腹主动脉缩窄作为高血压动物模型,利用 FX-4000 周期性应变加载系统模拟高血压下血管细胞的力学条件,通过免疫荧光和免疫共沉淀鉴定 Rab28 与 NF-κB 的分布及相互作用。数据可用于心血管系统疾病、主动脉缩窄及高血压相关内皮细胞机制研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Involvement of Rab28 in NF-κB Nuclear Transport in Endothelial Cells》发表于 PLoS ONE(2013),DOI:10.1371/journal.pone.0056076。源站首次发布:2013-02-14。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):我们之前的蛋白质组学分析揭示了大鼠动脉中 Rab28 的表达。然而,Rab28 在哺乳动物细胞中的功能及其在血管中的作用仍不清楚。采用大鼠左肾动脉上方腹主动脉缩窄作为高血压动物模型。使用 FX-4000 周期性应变加载系统在体外模拟高血压期间血管细胞所受的力学条件。采用免疫荧光和免疫共沉淀(Co-IP)鉴定 Rab28 与核因子 kappa B(NF-κB)的分布及相互作用。高血压大鼠颈动脉中 Rab28 表达显著增加。高周期性应变通过血管平滑肌细胞(VSMCs)的旁分泌控制诱导内皮细胞(ECs)中 Rab28 表达,这至少部分通过血管紧张素 II(Ang II)介导。Rab28 敲低降低了 ECs 的增殖,同时增加

【数据结构与技术规格】

文件数 6 个,合计 11.80 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0056076。

【主题与分类】

源站学科分类:Physiology、Biochemistry、Cell Biology、Biophysics。主题标签:rab28、endothelial、cells。本站分类:心血管系统疾病/主动脉缩窄。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Physiology、Biochemistry、Cell Biology、Biophysics。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Involvement_of_Rab28_in_NF_B_Nuclear_Transport_in_Endothelial_Cells__/157032

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Jiang, Jun; Qi, Ying-Xin; Zhang, Ping; Gu, Wen-Tian; Yan, Zhi-Qiang; Shen, Bao-Rong; et al. (2016). Involvement of Rab28 in NF-κB Nuclear Transport in Endothelial Cells. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Figure_S1.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/485897"
curl -L -o "Figure_S2.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/485898"
curl -L -o "Figure_S3.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/485899"
curl -L -o "Figure_S4.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/485901"
curl -L -o "Figure_S5.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/485905"
curl -L -o "Text_S1.doc" "https://ndownloader.figshare.com/files/485907"

文件清单

  • Figure_S1.tif(792.36 KB)
  • Figure_S2.tif(300.05 KB)
  • Figure_S3.tif(1.79 MB)
  • Figure_S4.tif(6.41 MB)
  • Figure_S5.tif(2.44 MB)
  • Text_S1.doc(70.14 KB)

文件总体积 11.80 MB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

我们之前的蛋白质组学分析揭示了大鼠动脉中Rab28的表达。然而,Rab28在哺乳动物细胞中的功能及其在血管中的作用仍不清楚。采用大鼠左肾动脉上方腹主动脉缩窄作为高血压动物模型。使用FX-4000周期性应变加载系统在体外模拟高血压时血管细胞所受到的机械条件。免疫荧光和免疫共沉淀(Co-IP)用于鉴定Rab28与核因子κB(NF-κB)的分布及相互作用。高血压大鼠颈动脉中Rab28表达显著增加。高周期性应变通过血管平滑肌细胞(VSMCs)的旁分泌控制诱导内皮细胞(ECs)中Rab28的表达,这至少部分是通过血管紧张素II(Ang II)介导的。Rab28敲低减少了ECs的增殖,同时增加了凋亡和迁移。免疫荧光显示,Ang II刺激Rab28和NF-κB从细胞质共转位至细胞核。Rab28敲低减弱了NF-κB的活化。NF-κB p65与Rab28的Co-IP表明它们之间存在相互作用。

我们的结果揭示,Rab28作为一种新型的NF-κB核转运调节因子,可能参与了内皮细胞稳态的紊乱。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0056076(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Involvement_of_Rab28_in_NF_B_Nuclear_Transport_in_Endothelial_Cells__/157032)。

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