腹主动脉缩窄手术小鼠肥厚心肌的环状RNA测序数据集

该数据集包含通过腹主动脉缩窄手术建立的C57B/L小鼠心肌肥厚模型中的环状RNA测序数据,涉及假手术组和手术组各4个心室心肌样本,共鉴定出9780个环状RNA分子,其中30个差异表达分子可用于研究心肌肥厚的分子机制,主要应用于心血管疾病的非编码RNA研究、生物标志物发现和治疗靶点探索等研究方向。

Mendeley Data
2024-04-30 更新
浏览 30
心肌肥厚环状RNA测序
CircRNA sequencing in hypertrophic myocardium from abdominal aortic coarctation surgical mice

基本信息

大小
9.020541684 GB
创建/更新时间
2024-04-30
版本
v1

资源简介

腹主动脉缩窄手术小鼠肥厚心肌的环状RNA测序数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《CircRNA sequencing in hypertrophic myocardium from abdominal aortic coarctation surgical mice》。源站首次发布:2024-04-25。

【数据内容】

源站原始描述:Pathological cardiac hypertrophy is a maladaptive cardiac remodeling in variable clinical diseases involving Hypertension, Cardiomyopathy and so on, which was still a major public healthcare problem with high morbidity and mortality in the worldwide.There is an unmet need to detect underlying heart failure sensitively and to reverse myocardial enlargement and fibrosis effectively. Several stimuli and signaling mechanisms have been postulated in pathological cardiac hypertrophy on genome and tran…

【数据结构与技术规格】

文件数 5 个,合计 9.02 GB。数据集 DOI:10.17632/hy5pmx39g5.1。

【获取与许可】

源站页面:https://data.mendeley.com/datasets/hy5pmx39g5

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源站:https://data.mendeley.com/datasets/hy5pmx39g5

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集是一个研究病理性心肌肥厚的环状RNA测序数据集。通过腹主动脉缩窄手术在C57B/L小鼠中建立压力超负荷诱导的心肌肥厚模型,分别收集假手术组和手术组各4个心室心肌样本进行环状RNA测序。数据集中共鉴定出9780个环状RNA,其中5个分子表达上调、25个分子表达下调。该数据集为研究心肌肥厚、心力衰竭等心血管疾病的分子机制提供了重要资源,可用于非编码RNA在心血管疾病中的作用研究、生物标志物发现和潜在治疗靶点探索。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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