大规模鉴定人脑血管蛋白质：组织间与脑内血管蛋白质多样性
该数据集来自 plos.figshare.com，配套论文发表于 PLOS ONE（2017），围绕人脑血管系统蛋白质的大规模鉴定
基本信息
资源简介
大规模鉴定人脑血管蛋白质：组织间与脑内血管蛋白质多样性
Large-scale identification of human cerebrovascular proteins: Inter-tissue and intracerebral vascular protein diversity
该数据集来自 plos.figshare.com，配套论文发表于 PLOS ONE（2017），围绕人脑血管系统蛋白质的大规模鉴定。研究利用 Human Protein Atlas 的表达数据，筛选 20,158 个蛋白质，识别出 346 个与人脑血管相关的表达模式，并在不同脑样本中验证了其中 51/52 的分布；约 40% 的蛋白质呈内皮细胞富集表达。数据含 4 个文件（S1 Fig.pdf、S2 Fig.pdf、S3 Fig.pdf、S1 File.xlsx），主题涉及血脑屏障、脑内皮标志物、平滑肌细胞与血管平滑肌细胞等，可用于脑血管蛋白质表达模式的分析与分类研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Large-scale identification of human cerebrovascular proteins: Inter-tissue and intracerebral vascular protein diversity》发表于 PLOS ONE（2017），DOI：10.1371/journal.pone.0188540。源站首次发布：2017-11-30。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：人脑血管系统负责调节依赖需求的灌注并维持血脑屏障（BBB）。此外，人脑血管的缺陷会导致卒中、脑出血、血管畸形和血管性认知障碍。本研究的目的是利用 Human Protein Atlas 的表达数据发现人脑血管系统的新蛋白质，该大型项目允许公众访问人体组织的免疫组织化学分析。我们在 HPA 中筛选了 20,158 个蛋白质，并鉴定出 346 个与人脑血管相关的表达模式。独立实验表明，这些分布中有 51/52 可以在不同脑样本中实验重复。一些蛋白质（40%）表现出内皮细胞（EC）富集表达，而其他蛋白质则表达主要
【数据结构与技术规格】
文件数 4 个，合计 1.35 MB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0188540。
【主题与分类】
源站学科分类：Biophysics、Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。主题标签：HRC、cerebrovascular system、346 expression patterns、brain EC markers、calcium binding protein、SMC、muscle cells、VSMC、BBB、Human Protein Atlas。本站分类：心血管系统疾病/中枢神经系统血管畸形。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Large-scale_identification_of_human_cerebrovascular_proteins_Inter-tissue_and_intracerebral_vascular_protein_diversity/5650813
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Jung Lee, Soo; Kwon, Soonhyung; Gatti, John R.; Korcari, Ejona; Gresser, Ty E.; Felix, C.; et al. (2017). Large-scale identification of human cerebrovascular proteins: Inter-tissue and intracerebral vascular protein diversity. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01，引用时请注意版本时效。
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数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Large-scale identification of human cerebrovascular proteins: Inter-tissue and intracerebral vascular protein diversity
- DOI：10.1371/journal.pone.0188540
- 发布日期：2017-11-30
- 文件数：4 个
- 文件总体积：1.35 MB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/Large-scale_identification_of_human_cerebrovascular_proteins_Inter-tissue_and_intracerebral_vascular_protein_diversity/5650813
命令行下载
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curl -L -o "S2 Fig.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/9866128"
curl -L -o "S3 Fig.pdf" "https://ndownloader.figshare.com/files/9866131"
curl -L -o "S1 File.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/9866137"
文件清单
S1 Fig.pdf（108.43 KB）S2 Fig.pdf（127.66 KB）S3 Fig.pdf（99.97 KB）S1 File.xlsx（1.01 MB）
文件总体积 1.35 MB（源站 API 实测）。
数据说明
人脑血管系统负责调节依赖需求的灌注并维持血脑屏障（BBB）。此外，人脑血管的缺陷会导致中风、脑内出血、血管畸形和血管性认知障碍。本研究的目的是利用人类蛋白质图谱（Human Protein Atlas）的表达数据发现人脑血管系统的新蛋白质，该图谱是一个大规模项目，允许公众访问人体组织的免疫组织化学分析。我们在HPA中筛选了20，158种蛋白质，并鉴定出346种与人脑血管相关的表达模式。独立实验表明，这些分布中的51/52可以在不同脑样本中实验重现。一些蛋白质（40%）表现出内皮细胞（EC）富集表达，而其他蛋白质主要在血管平滑肌细胞（VSMC；18%）中表达；39%的这些蛋白质在两种细胞类型中均有表达。大多数脑EC标志物是组织寡特异性的；也就是说，它们在平均9个受检器官中的4.8个的内皮中表达。
尽管大多数在脑内皮细胞中表达的标志物存在于所有脑毛细血管中，但相当一部分（21%）仅在每个脑样本内的一部分脑毛细血管中表达。在脑VSMC中发现的蛋白质中，几乎所有也都在外周VSMC和非血管平滑肌细胞（SMC）中表达。只有一种可能是脑特异性的：VHL（Von Hippel-Lindau肿瘤抑制因子）。HRC（富含组氨酸钙结合蛋白）和VHL仅限于VSMC，在子宫或肠道等非血管组织中未发现。总之，我们定义了一组可能与理解人脑血管系统独特生理学和病理生理学相关的脑血管蛋白质。这组蛋白质定义了血管系统中器官间的分子差异，并证实了脑内血管细胞的广泛异质性。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0188540（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Large-scale_identification_of_human_cerebrovascular_proteins_Inter-tissue_and_intracerebral_vascular_protein_diversity/5650813）。
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