色氨酸相关特征基因数据集
该数据集包含来自颈动脉斑块的转录组数据（包括批量RNA测序和单细胞RNA测序），聚焦于色氨酸代谢相关基因，识别出TPH1、MAOB等六个关键差异表达基因，并构建了预测模型用于评估颈动脉斑块形成风险。其主要研究方向为通过基因表达分析探究色氨酸代谢在动脉粥样硬化发生发展中的作用，为心血管疾病的生物标志物发现和机制研究提供数据支持。
基本信息
资源简介
色氨酸相关特征基因数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Tryptophan-related signature genes.》。配套论文《Identification and characterization of tryptophan metabolism-related genes in carotid artery plaques》发表于 PLOS One（2026），DOI：10.1371/journal.pone.0341122。源站首次发布：2026-02-02。
【数据内容】
源站原始描述：Cardiovascular and cerebrovascular diseases, often caused by atherosclerosis, are the stern cause of death worldwide, and carotid plaque play a crucial role in the development of these diseases. Tryptophan metabolism is an important pathway involved in the regulation of immune response, inflammation and vascular health. In this study, we analyzed bulk and scRNA data from carotid plaque to investigate the relevance between tryptophan metabolism and plaque formation. We identified 446 differential…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个，合计 10.54 KB。pone.0341122.s004.xlsx：application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet，10.54 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pone.0341122.s004。
【主题与分类】
源站学科分类：Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Physiology、Pharmacology、Chemical Sciences not elsewhere classified。主题标签：xlink "> cardiovascular、logistic regression model、important pathway involved、carotid plaque play、carotid plaque formation、manage carotid atherosclerosis、assess plaque risk、regulating tryptophan metabolism、carotid plaque、plaque formation。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Microbiology、Genetics、Molecular Biology、Physiology、Pharmacology、Chemical Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_p_Tryptophan-related_signature_genes_p_/31233790
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Jia, Xiaodong; Wang, Zhen; Bai, Lin; Wei, Jianmei; Wang, Xizi; Song, Zhaona; et al. (2026). Tryptophan-related signature genes.. PLOS ONE. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
源站：https://figshare.com/articles/dataset/_p_Tryptophan-related_signature_genes_p_/31233790
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数据说明
该数据集是一个医学研究数据集，旨在探究色氨酸代谢与颈动脉斑块形成之间的关联。数据集包含了来自颈动脉斑块的批量转录组（bulk RNA-seq）和单细胞转录组（scRNA-seq）数据，通过分析这些数据，研究人员识别出446个差异表达基因，这些基因在免疫和色氨酸相关通路中富集。其中，重点关注色氨酸代谢途径，筛选出六个关键色氨酸相关差异表达基因：TPH1、MAOB、TDO2、KMO、KYNU和CYP1B1。基于这六个基因构建的逻辑回归模型（AUC为0.75）可用于预测颈动脉斑块形成的风险。该数据集的主要研究方向包括心血管疾病生物标志物发现、色氨酸代谢在动脉粥样硬化中的作用机制以及免疫炎症反应的调控，为颈动脉粥样硬化的风险评估和靶向治疗提供潜在依据。
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