颈动脉粥样硬化样本的原始批量RNA-seq计数数据集
该数据集包含来自颈动脉内膜切除术患者的颈动脉粥样硬化样本的原始批量RNA-seq计数数据，数据模态为基因表达计数矩阵，并附有患者临床元数据；主要用于研究动脉粥样硬化的转录组特征、斑块稳定性相关的分子标志物，以及探索颈动脉疾病的发病机制和潜在治疗靶点。
基本信息
资源简介
该数据集是一个人类颈动脉粥样硬化样本的批量RNA-seq计数矩阵数据集。数据来源于慕尼黑血管生物库，样本采集自诊断为颈动脉狭窄并接受颈动脉内膜切除术（CEA）的患者。手术切除的斑块样本在采集后立即保存于预冷的PBS中，并选取最不稳定（晚期）区域以及可用的最轻微病变区域进行分析。样本经RNALater保存，总RNA提取后使用Illumina NovaSeq平台进行链特异性RNA-seq测序，产生101bp双端读长，测序深度在2000万至1.4亿读长之间。原始数据经过STAR比对至hg19基因组，并通过HTSeq-count进行基因计数，过滤低表达基因。数据集包含原始计数矩阵、患者元数据及变量说明文件，适用于动脉粥样硬化分子机制、斑块稳定性生物标志物、心血管疾病转录组学等研究方向。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Zenodo 公开直链）
源站：https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.17454208
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数据说明
该数据集是一个人类颈动脉粥样硬化样本的批量RNA-seq计数矩阵数据集。数据来源于慕尼黑血管生物库，样本采集自诊断为颈动脉狭窄并接受颈动脉内膜切除术（CEA）的患者。手术切除的斑块样本在采集后立即保存于预冷的PBS中，并选取最不稳定（晚期）区域以及可用的最轻微病变区域进行分析。样本经RNALater保存，总RNA提取后使用Illumina NovaSeq平台进行链特异性RNA-seq测序，产生101bp双端读长，测序深度在2000万至1.4亿读长之间。原始数据经过STAR比对至hg19基因组，并通过HTSeq-count进行基因计数，过滤低表达基因。数据集包含原始计数矩阵、患者元数据及变量说明文件，适用于动脉粥样硬化分子机制、斑块稳定性生物标志物、心血管疾病转录组学等研究方向。
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