颈动脉粥样硬化样本的原始批量RNA-seq计数数据集

资源简介

该数据集是一个人类颈动脉粥样硬化样本的批量RNA-seq计数矩阵数据集。数据来源于慕尼黑血管生物库，样本采集自诊断为颈动脉狭窄并接受颈动脉内膜切除术（CEA）的患者。手术切除的斑块样本在采集后立即保存于预冷的PBS中，并选取最不稳定（晚期）区域以及可用的最轻微病变区域进行分析。样本经RNALater保存，总RNA提取后使用Illumina NovaSeq平台进行链特异性RNA-seq测序，产生101bp双端读长，测序深度在2000万至1.4亿读长之间。原始数据经过STAR比对至hg19基因组，并通过HTSeq-count进行基因计数，过滤低表达基因。数据集包含原始计数矩阵、患者元数据及变量说明文件，适用于动脉粥样硬化分子机制、斑块稳定性生物标志物、心血管疾病转录组学等研究方向。