三七皂苷R1与柴胡皂苷B2协同抗动脉粥样硬化:靶向PI3K/Akt/mTOR通路与巨噬细胞自噬的新策略

本数据集来自 doi.org,围绕三七皂苷 R1(NGR1)与柴胡皂苷 B2(SSB2)协同抗动脉粥样硬化(AS)的作用及机制研究

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蛋白质预测FOS: Basic medicinePharmacologyCardiovascular pharmacologyCardiovascular medicine
Synergistic effects of notoginsenoside R1 and saikosaponin B2 in atherosclerosis: a novel approach targeting PI3K/Akt/mTOR pathway and macrophage autophagy

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.074026748 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-08
版本
13

资源简介

三七皂苷R1与柴胡皂苷B2协同抗动脉粥样硬化:靶向PI3K/Akt/mTOR通路与巨噬细胞自噬的新策略

Synergistic effects of notoginsenoside R1 and saikosaponin B2 in atherosclerosis: a novel approach targeting PI3K/Akt/mTOR pathway and macrophage autophagy

本数据集来自 doi.org,围绕三七皂苷 R1(NGR1)与柴胡皂苷 B2(SSB2)协同抗动脉粥样硬化(AS)的作用及机制研究。研究采用网络药理学方法,从 TCMSP 等数据库筛选出 NGR1、SSB2 与 AS 的 113 个共同靶点,包括 mTOR 和 CASP3,并构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,开展 GO 与 KEGG 富集分析,聚焦 PI3K/Akt/mTOR 通路与巨噬细胞自噬。数据可用于心血管药理学、天然产物机制预测及动脉粥样硬化相关靶点与通路研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Zero v1.0 Universal 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):动脉粥样硬化(AS)是全球心血管疾病及相关死亡的重要诱因。传统治疗主要使用他汀类药物,但这类药物常伴有肝功能障碍和肌肉损伤等副作用。近期研究强调,来源于传统草药的皂苷类化合物,如三七皂苷 R1(NGR1)和柴胡皂苷 B2(SSB2),在对抗 AS 方面具有潜在保护作用。然而,这些化合物抗动脉粥样硬化的综合效应及其潜在机制仍未被充分理解。首先,我们采用网络药理学分析,从 TCMSP 等数据库中鉴定出 NGR1、SSB2 与动脉粥样硬化(AS)的 113 个共同靶点,包括 mTOR 和 CASP3。我们构建了蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并进行了 GO 和 KEGG 富集分析

【主题与分类】

主题标签:Pharmacology、Cardiovascular pharmacology、Cardiovascular medicine。本站分类:循环系统疾病。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.ffbg79d5q

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.ffbg79d5q

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 74.0 MB。

数据说明

动脉粥样硬化(AS)是全球心血管疾病及相关死亡率的重要诱因。传统治疗主要采用他汀类药物,但这类药物常伴随肝功能障碍和肌肉损伤等副作用。近期研究凸显了源自传统草药的皂苷化合物,如三七皂苷R1(NGR1)和柴胡皂苷B2(SSB2),在对抗AS方面的潜在保护特性。然而,这些化合物抗动脉粥样硬化的综合效应及其深层机制仍未被充分理解。首先,我们运用网络药理学分析,从TCMSP等数据库中识别出NGR1、SSB2与动脉粥样硬化(AS)共有的113个靶点,包括mTOR和CASP3。我们构建了蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行了GO和KEGG富集分析,揭示了涉及PI3K/Akt、炎症和自噬的关键信号通路。通过喂养“西方饮食”的ApoE-/-小鼠建立动脉粥样硬化模型,随后分别以NGR1、SSB2或NS组合进行治疗。

采用苏木精-伊红(HE)染色、油红O(ORO)染色和/或CD68免疫荧光等组织学检查,评估ApoE-/-小鼠主动脉根部以及肝脏和肾脏的病理状况。我们的结果表明,NS联合用药可改善ApoE-/-小鼠的脂质水平、脂质转运和不稳定斑块形成,且不会对肝肾功能产生不良影响。最后,使用氧化低密度脂蛋白(ox-LDL)培养RAW264.7巨噬细胞,建立体外泡沫细胞模型。采用CCK-8检测、油红O染色、免疫荧光分析、流式细胞术、RT-PCR和Western blot分析等方法,评估NS联合用药对脂质摄取、炎症反应、细胞凋亡、PI3K/Akt/mTOR信号通路和自噬的影响。结果表明

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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