csgA基因在帕金森病患者中表达变化的研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT07175922

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：帕金森病（PD）。帕金森病（PD）是一种神经退行性疾病，传统上认为其运动和非运动症状与神经系统内多巴胺能神经元的丢失有关。近期研究突出了两种主要的进展模式：身体优先型和脑优先型PD。在脑优先型中，PD始于大脑中的α-突触核蛋白（aSyn）病理，特别是在黑质或嗅球等区域，之后可能累及外周系统。相反，在身体优先型亚型中，病理性aSyn聚集体被认为起源于肠神经系统或外周自主结构，如肠道和心脏结构，然后通过迷走神经扩散至大脑。在该PD亚型中，肠道菌群失调和细菌淀粉样蛋白可触发肠神经系统中aSyn的错误折叠，启动一系列病理过程，并通过迷走神经逆行扩散至大脑。肠道微生物组对PD发生和进展的潜在影响为开发针对微生物组的疗法提供了可能。

csgA编码curli的主要蛋白亚基，curli是一种由大肠杆菌等特定肠道细菌产生的功能性淀粉样蛋白组装体。Curli蛋白有助于建立细胞外生物膜，其与人类淀粉样蛋白（如aSyn）的结构相似性提示它们可能参与PD的病理过程。因此，CsgA蛋白可能是治疗的潜在靶点。为开发此类干预措施，了解csgA在个体患者微生物组中的流行率和变异性至关重要，因为这些信息将有助于指导开发检测方法以评估潜在疗法的药效学效应。因此，本研究聚焦于研究csgA在PD人群中的流行率以及个体间和逐周变异性。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。