PRJNA429310:心肌梗死后心绞痛与健康状态结局相关的基因组变异

黑人心肌梗死(MI)患者的结局比白人患者更差,包括死亡率更高、心绞痛更多以及生活质量更差。TRIUMPH研究旨在检验社会经济、临床、遗传、代谢、生物标志物或治疗特征方面的种族差异是否介导了观察到的结局差异

ena
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基因组预测心肌梗死心绞痛健康状态结局基因组变异种族差异TRIUMPH研究
PRJNA429310: Genomic variants associated with angina and health status outcome after MI

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-27

资源简介

PRJNA429310:心肌梗死后心绞痛与健康状态结局相关的基因组变异

PRJNA429310 数据集聚焦于心肌梗死(MI)后心绞痛与健康状况结局相关的基因组变异,来源于 ebi.ac.uk,在本站归类为循环系统疾病 / 其他。该数据集所依托的研究关注一个明确的临床差异现象:黑人心肌梗死患者的结局比白人患者更差,表现为死亡率更高、心绞痛更多以及生活质量更差。为解释这一差异,TRIUMPH 研究系统收集了社会经济、临床、遗传、代谢、生物标志物及治疗等多方面特征,以检验这些因素是否介导了观察到的种族间结局差异。数据集因此同时具有基因组变异信息与心肌梗死结局表型的双重属性,可用于探索遗传因素与心梗后心绞痛及健康状态之间的关联。

【数据集背景】

黑人心肌梗死患者在结局上处于劣势,包括死亡率更高、心绞痛发生更多以及生活质量更差。为探究这一差异的来源,TRIUMPH 研究被设计用于检验社会经济、临床、遗传、代谢、生物标志物或治疗特征方面的种族差异是否介导了观察到的结局差异。该数据集即围绕心肌梗死后心绞痛与健康状况结局相关的基因组变异而建立,属于循环系统疾病领域的遗传关联研究资源。

【数据内容】

数据集英文名称为“PRJNA429310: Genomic variants associated with angina and health status outcome after MI”,其核心内容是心肌梗死后心绞痛及健康状况结局相关的基因组变异。结合研究设计,数据涉及遗传数据与代谢数据,并配有患者详细的病史、住院诊疗过程记录以及基线访谈信息。遗传与代谢数据分别在出院时获得,覆盖的患者数量分别为 2979 人(69%)和 3013 人(69%)。此外,在部分患者中还于 1 个月时采集了血液和尿液样本。

【采集与来源】

数据来自美国 24 个中心开展的前瞻性研究。2005 年 6 月 1 日至 2008 年 12 月 31 日期间,共前瞻性筛查 31567 名心肌梗死患者,其中 6152 人符合心肌梗死入选标准,最终 4340 人(71%)被纳入研究。知情同意患者接受了详细的病历摘录,涵盖其病史与住院诊疗过程,并辅以详细的基线访谈。遗传与代谢数据在出院时采集,1 个月时的血液和尿液样本仅在部分患者中获得。数据来源站为 ebi.ac.uk。

【适用场景】

该数据集适用于心肌梗死后结局的遗传关联研究,尤其是围绕心绞痛与健康状况结局的基因组变异分析;也适用于检验遗传、代谢等因素是否介导种族间结局差异的研究场景。由于同时具备临床、社会经济与生物标志物等多维信息,还可用于心肌梗死后结局影响因素的综合分析。

【使用方法】

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【质量与限制】

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【引用与许可】

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使用方式

数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJNA429310

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

黑人心肌梗死(MI)患者的结局比白人患者更差,包括死亡率更高、心绞痛更多以及生活质量更差。TRIUMPH研究旨在探讨社会经济、临床、遗传、代谢、生物标志物或治疗特征方面的种族差异是否介导了观察到的结局差异。2005年6月1日至2008年12月31日期间,前瞻性筛查了31567例MI患者,其中6152例符合MI入选标准,最终从美国24个中心入选4340例(71%)。同意参与的患者其病史和住院诊疗过程均进行了详细的病历摘录,并辅以详细的基线访谈。分别有2979例(69%)和3013例(69%)患者在出院时获得了详细的遗传和代谢数据。在部分患者中,于1个月时采集了血液和尿液样本(27%的存活者中采集),于6个月时采集了血液样本(19%的存活者中采集……(更多内容见dbGaP研究页面。)

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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