阵发性家族性心室颤动——基因-疾病关联
该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含 1 个 ZIP 文件,与兔心室颤动模拟研究相关,涉及双心室三维高分辨率几何结构、各向异性与各向同性电导率以及四种不同恢复动力学的细胞动作电位模型,主题标签涵盖 rabbit、cardiac arrhythmia、filament

基本信息
资源简介
阵发性家族性心室颤动——基因-疾病关联
Data_Sheet_1_Effect of Heart Structure on Ventricular Fibrillation in the Rabbit: A Simulation Study.ZIP
该数据集来自 frontiersin.figshare.com,包含 1 个 ZIP 文件,与兔心室颤动模拟研究相关,涉及双心室三维高分辨率几何结构、各向异性与各向同性电导率以及四种不同恢复动力学的细胞动作电位模型,主题标签涵盖 rabbit、cardiac arrhythmia、filament dynamics、fibrillation、phase mapping 和 model。数据可用于研究心室颤动中螺旋波与细丝动力学,并支持心脏电生理计算模型的构建与验证(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
配套论文《Vortex filament dynamics in computational models of ventricular fibrillation in the heart》发表于 Chaos: An Interdisciplinary Journal of Nonlinear Science(2008),DOI:10.1063/1.3043805。源站首次发布:2019-05-20。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):心室颤动(VF)是一种致命性疾病,影响全球数百万人。VF 的机制是围绕称为细丝(filaments)的线旋转的不稳定折返电波。这些复杂的时空模式可以通过实验和数值方法进行研究。计算机模拟提供了独特的见解,包括整个心脏的高分辨率动力学以及对纤维取向和细胞动力学等量的系统控制,这些在实验中是不可行的。在这里,我们使用两种双心室三维高分辨率兔心脏几何结构研究细丝动力学,一种具有详细的精细结构,另一种没有精细结构。我们使用各向异性和各向同性电导率以及四种具有不同恢复动力学的细胞动作电位模型研究细丝动力学。在各向同性二维中观察到的螺旋波动力学
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 25.29 MB。数据集 DOI:10.3389/fphys.2019.00564.s001。
【主题与分类】
源站学科分类:Animal Physiology - Biophysics、Animal Physiology - Cell、Animal Physiology - Systems、Comparative Physiology、Physiology not elsewhere classified、Reproduction。主题标签:rabbit、model、cardiac arrhythmia、filament dynamics、fibrillation、phase mapping。本站分类:循环系统疾病。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Animal Physiology - Biophysics、Animal Physiology - Cell、Animal Physiology - Systems、Comparative Physiology、Physiology not elsewhere classified、Reproduction。
【获取与许可】
源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Effect_of_Heart_Structure_on_Ventricular_Fibrillation_in_the_Rabbit_A_Simulation_Study_ZIP/8153672
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Galappaththige, Suran K.; Pathmanathan, Pras; Bishop, Martin J.; Gray, Richard A. (2019). Data_Sheet_1_Effect of Heart Structure on Ventricular Fibrillation in the Rabbit: A Simulation Study.ZIP. Frontiers. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-05-31,引用时请注意版本时效。
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使用方式
数据集获取(Figshare)
- 源站标题:Data_Sheet_1_Effect of Heart Structure on Ventricular Fibrillation in the Rabbit: A Simulation Study.ZIP
- DOI:10.3389/fphys.2019.00564.s001
- 发布日期:2019-05-20
- 文件数:1 个
- 文件总体积:25.29 MB
- 源站页面:https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Effect_of_Heart_Structure_on_Ventricular_Fibrillation_in_the_Rabbit_A_Simulation_Study_ZIP/8153672
命令行下载
curl -L -o "Data_Sheet_1_Effect of Heart Structure on Ventricular Fibrillation in the Rabbit: A Simulation Study.ZIP" "https://ndownloader.figshare.com/files/15193916"
文件清单
Data_Sheet_1_Effect of Heart Structure on Ventricular Fibrillation in the Rabbit: A Simulation Study.ZIP(25.29 MB)
文件总体积 25.29 MB(源站 API 实测)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
心室颤动(VF)是一种致命性疾病,影响全球数百万人。VF的机制在于不稳定的折返电波围绕称为细丝(filaments)的线旋转。这些复杂的时空模式可通过实验和数值方法进行研究。计算机模拟提供了独特的见解,包括整个心脏的高分辨率动力学以及对纤维取向和细胞动力学等量的系统性控制,这些在实验中是不可行的。在此,我们使用两个双心室三维高分辨率兔心脏几何模型研究细丝动力学,一个具有详细的精细结构,另一个没有精细结构。我们使用各向异性和各向同性电导率,以及四种具有不同恢复动力学的细胞动作电位模型来研究细丝动力学。在各向同性二维薄片中观察到的螺旋波动力学不能预测整个心脏中的行为。在二维中,四种细胞模型表现出稳定的折返、蜿蜒的螺旋波和螺旋波破碎。
在具有精细结构的完整心脏中,所有模拟结果均表现出复杂的动力学特征,令人联想到实验中观察到的颤动。在无精细结构的完整心脏中,尽管与有结构的心脏相比丝状物数量减少,但各向异性起到了破坏丝状物动力学稳定性的作用。此外,在无结构的各向同性心脏中,两种在二维中表现出蜿蜒螺旋波的细胞模型稳定为8字形表面模式。我们还研究了丝状物动力学对计算机系统配置和初始条件的敏感性。在较长的模拟时间后,不同系统配置之间有时会出现不同的宏观结果,这可能是由于缺乏逐位可重复性所致。研究结论对初始条件扰动不敏感,然而,丝状物随时间的精确数量及其趋势因这些变化而改变。总之,我们呈现以下新结果。首先,我们提供了一种新的细胞模型,该模型在定性和定量上均与兔心脏VF的表面模式相似。其次
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.3389/fphys.2019.00564.s001(source: https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/Data_Sheet_1_Effect_of_Heart_Structure_on_Ventricular_Fibrillation_in_the_Rabbit_A_Simulation_Study_ZIP/8153672)。
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