新型抗肌萎缩蛋白缺陷大鼠模型：模拟DMD外显子45缺失患者的外显子跳跃

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE308065

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数据说明

抗肌萎缩蛋白（DMD）基因的突变可导致肌肉消耗性疾病，范围从较轻的贝克型肌营养不良（BMD）到更严重的杜氏肌营养不良（DMD）。外显子45缺失是全球DMD患者中最常报道的单外显子缺失。在本研究中，我们利用CRISPR/Cas9技术构建了一种新型的外显子45缺失大鼠模型。DmdΔ45大鼠再现了DMD的关键临床和分子特征，包括进行性骨骼肌变性、肌肉和心脏功能受损、认知缺陷、循环肌肉损伤生物标志物升高以及整体寿命缩短。转录组学分析证实了外显子45的缺失，并揭示了与抗肌萎缩蛋白缺乏一致的基因表达模式。在骨骼肌中，RNA-seq图谱显示从6个月时的早期应激反应和再生能力转变为12个月时的慢性炎症、纤维化和代谢功能障碍。同样，心脏转录组从早期的炎症和应激反应状态转变为以纤维化重塑和代谢损伤为特征的状态。

尽管存在这些病理特征，DmdΔ45大鼠的表型仍比其他DMD大鼠模型更为轻微。这种减轻可能归因于自发的外显子44跳跃，其部分恢复了阅读框，并导致回复性抗肌萎缩蛋白阳性纤维随年龄增长而增加。进一步分析显示剪接体相关基因下调，提示该模型中存在驱动外显子跳跃的潜在机制。总之，DmdΔ45大鼠是研究表型变异的分子决定因素及外显子跳跃内源性机制的有价值模型。这些发现为开发个性化外显子跳跃疗法提供了重要启示，尤其对外显子45缺失的DMD患者具有重要意义。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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