2022年提交至USGS国家野生动物健康中心的两只赤狐和一只渔貂的高致病性禽流感H5N1流行病学与诊断数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.3886/e232054

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集包含两只赤狐（Vulpes vulpes）和一只渔貂（Pekania pennanti）的流行病学、临床症状、大体与微观病理学以及病毒学数据。这些动物被提交至USGS-国家野生动物健康中心进行死因判定，并经USDA国家兽医服务实验室确认为高致病性禽流感（HPAI）H5N1阳性。狐狸为来自北达科他州的幼体，渔貂为来自威斯康星州的成体。临床症状包括神经功能障碍，如共济失调、嗜睡或瘫痪。大体与微观病变包括心肌苍白、肺和肝充血、脑膜脑炎、间质性肺炎、心肌坏死和肝坏死。通过PCR在拭子和/或器官组织中检测到高致病性禽流感H5N1 2.3.4.4；在狐狸中鉴定出基因型B3.1，在渔貂中鉴定出B3.2。三只动物的死亡均归因于HPAI。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。