临床时间序列数据集：ICU脓毒症、心脏骤停与GIB队列
本数据集为心血管系统疾病领域的时间序列公开数据集，来源：physionet。
基本信息
资源简介
临床时间序列数据集：ICU脓毒症、心脏骤停与GIB队列
该数据集英文名为 Clinical Time Series Datasets for Trajectory Flow Matching Evaluation: ICU Sepsis, ICU Cardiac Arrest, and ICU GIB Cohorts，源站标题为 clinical-trajectory-flow-icu，来源于 physionet.org，本站归类为循环系统疾病 / 其他。该资源包含三个临床时间序列数据集，用于论文 Trajectory Flow Matching with Applications to Clinical Time Series Modeling 中，以评估模型在重症监护环境中处理不规则采样数据的能力。三个队列分别对应 ICU 脓毒症、ICU 心脏骤停与 ICU 胃肠道出血（GIB）患者群体。数据集采用 PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 许可发布，属于需要凭据访问的健康数据资源。
【数据集背景】
该资源的核心用途是支撑论文 Trajectory Flow Matching with Applications to Clinical Time Series Modeling 中的模型评估工作。该论文关注轨迹流匹配方法及其在临床时间序列建模中的应用，而本数据集正是为评估相关模型而整理的三组重症监护时间序列数据。临床重症监护场景中的数据往往具有不规则采样的特点，即不同指标在不同时间点被记录，采样间隔不统一、缺失情况普遍，这给时间序列建模带来挑战。该资源的设计目标即是评估模型在重症监护环境中处理此类不规则采样数据的能力。
【数据内容】
该资源由三个临床时间序列数据集构成，分别对应三个 ICU 队列：ICU 脓毒症（Sepsis）队列、ICU 心脏骤停（Cardiac Arrest）队列以及 ICU 胃肠道出血（GIB）队列。三个队列均属于重症监护场景下的临床时间序列数据。关于各队列的具体样本量、变量字段、时间跨度、采样频率等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该资源的来源站为 physionet.org。源站描述说明，该资源包含三个临床时间序列数据集，用于上述论文中的模型评估。关于原始数据的采集机构、采集时间范围、采集流程与筛选标准等，源站未提供。
【适用场景】
依据源站描述，该资源适用于评估模型在重症监护环境中处理不规则采样数据的能力，尤其服务于轨迹流匹配方法在临床时间序列建模中的评测。三个队列覆盖脓毒症、心脏骤停与胃肠道出血三类重症监护情形，可用于考察模型在不同临床轨迹上的表现。关于其他具体应用场景，源站未提供。
【使用方法】
该资源采用 PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 许可，属于凭据访问类健康数据，使用者需按该许可的要求申请并获得授权后方可使用。关于数据的具体组织格式、文件结构、读取方式与评测流程，源站未提供。
【质量与限制】
该资源为面向论文评估的临床时间序列数据集，其数据来自重症监护环境，具有不规则采样的特征。关于数据质量评估、标注可靠性、缺失率、偏倚以及使用中的其他限制，源站未提供。
【引用与许可】
使用该资源应遵循 PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0 的条款。该资源与论文 Trajectory Flow Matching with Applications to Clinical Time Series Modeling 相关，引用时应参照该论文及源站的要求。关于具体的引用格式与许可条款细节，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取（PhysioNet）
- 源站标题：Clinical Time Series Datasets for Trajectory Flow Matching Evaluation: ICU Sepsis, ICU Cardiac Arrest, and ICU GIB Cohorts
- 版本：1.0.0
- DOI：10.13026/pqe3-bv16
- 源站页面：https://physionet.org/content/clinical-trajectory-flow-icu/1.0.0
PhysioNet 数据需注册账号（机构邮箱）并签署数据使用协议后下载：
- 在 https://physionet.org/content/clinical-trajectory-flow-icu/1.0.0 页面登录并接受许可条款；
- 命令行整目录下载：
wget -r -N -c -np --user=<账号> --ask-password https://physionet.org/files/clinical-trajectory-flow-icu/1.0.0/
- 或用官方工具（推荐，支持断点续传与校验）：
pip install physionet-download
physionet-download clinical-trajectory-flow-icu
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
该资源包含三个临床时间序列数据集，用于论文 Trajectory Flow Matching with Applications to Clinical Time Series Modeling，以评估在重症监护环境中处理不规则采样数据的模型。ICU Sepsis 和 ICU Cardiac Arrest 数据集源自 eICU Collaborative Research Database v2.0，ICU Gastrointestinal Bleeding (GIB) 数据集源自 MIMIC-III 数据库。ICU Sepsis 数据集包含 3362 名以脓毒症为主要入院诊断的患者，ICU Cardiac Arrest 数据集包含 64589 名有心脏骤停风险的 ICU 患者，ICU GIB 数据集包含 2602 名胃肠道出血患者。每个数据集按 0.8/0.1/0.1 的比例划分为训练集、验证集和测试集。这些数据集用于展示 Trajectory Flow Matching (TFM) 的改进性能。分享这些数据集旨在促进对临床时间序列建模的进一步探索、推动医学领域新模型的开发，并帮助他人复现实验结果。
许可
PhysioNet Credentialed Health Data License 1.5.0
引用
学术使用请引用：PhysioNet. Clinical Time Series Datasets for Trajectory Flow Matching Evaluation: ICU Sepsis, ICU Cardiac Arrest, and ICU GIB Cohorts. DOI 10.13026/pqe3-bv16。
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