用体外与计算机突变研究异二聚体膜转运复合物的形成
该数据集来自 search.dataone.org,聚焦心血管系统疾病/心肌病方向,研究 PLN 单体或五聚体在脂膜中形成 SERCA-PLN 复合物的过程,并将 PLN 跨膜区丙氨酸突变(I18A-L52A)引起的结合亲和力变化与 SERCA 钙转运活性的功能获得或缺失相关联

基本信息
资源简介
用体外与计算机突变研究异二聚体膜转运复合物的形成
Probing the formation of a hetero-dimeric membrane transport complex with dual in vitro and in silico mutagenesis.
该数据集来自 search.dataone.org,聚焦心血管系统疾病/心肌病方向,研究 PLN 单体或五聚体在脂膜中形成 SERCA-PLN 复合物的过程,并将 PLN 跨膜区丙氨酸突变(I18A-L52A)引起的结合亲和力变化与 SERCA 钙转运活性的功能获得或缺失相关联。数据包含三个文件,分别对应 SERCA-PLN 复合物(PDB: 4KYT)、PLN 单体(PDB: 1FJK)和 PLN 五聚体(PDB: 2KYV)中丙氨酸替换突变的自由能计算,由 VMD 1.9.4 的 ParseFEP 插件生成,可用于膜蛋白相互作用与突变效应研究(来源 DataONE)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究探讨 PLN 单体或 PLN 五聚体在脂膜中形成 SERCA-PLN 复合物的过程。具体而言,PLN 跨膜区丙氨酸突变(I18A - L52A)引起的结合亲和力变化与 SERCA 的钙转运活性相关——由于这些突变而表现出功能获得或功能缺失特征。该数据集包含三个文件,涉及 SERCA-PLN 复合物(PDB: 4KYT)、PLN 单体(PDB: 1FJK)和 PLN 五聚体(PDB: 2KYV)中丙氨酸替换突变的自由能计算。这些数据文件使用 VMD(版本 1.9.4)ParseFEP 插件生成。更多信息请参见相应出版物的方法部分(
【主题与分类】
主题标签:Medicine, Health and Life Sciences、Chemistry。本站分类:心血管系统疾病/心肌病。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256%3A2f2eae75cfdc4f3b54100d1925978a9bc046d0c5a29133503c410f61e9b98224
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
本研究探讨了在脂质膜中由PLN单体或PLN五聚体形成SERCA-PLN复合物的过程。具体而言,PLN跨膜区丙氨酸突变(I18A - L52A)导致的结合亲和力变化与SERCA的钙转运活性相关——这些突变表现出功能获得或功能丧失的特征。该数据集包含三个文件,涉及SERCA-PLN复合物(PDB:4KYT)、PLN单体(PDB:1FJK)和PLN五聚体(PDB:2KYV)中丙氨酸替换突变的自由能计算。这些数据文件使用VMD(版本1.9.4)ParseFEP插件生成。更多信息请参见相应出版物的方法部分(https://doi.org/10.1039/d4sc02915a)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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