209例儿童原发性心肌病先证者及其家系成员全基因组测序样本
该数据集来自 omicsdi.org,收录 209 例儿童原发性心肌病先证者及其家系成员的全基因组测序样本,所有样本均使用 Illumina 短读长平台完成测序

基本信息
资源简介
209例儿童原发性心肌病先证者及其家系成员全基因组测序样本
该数据集收录了 209 例儿童原发性心肌病先证者及其家系成员的全基因组测序样本,所有样本均使用 Illumina 短读长平台完成测序。数据集英文名称为 a89709ba-e0a3-481d-b52a-db75b2c3afcc - samples,来源站为 omicsdi.org,本站分类归入心血管系统疾病 / 心肌病,主题标签为 Genomics。从整体上看,这是一批面向儿童原发性心肌病遗传机制研究的基因组学资源,覆盖先证者与家系成员两个层面,为探索该疾病的遗传基础提供了原始测序数据。其核心价值在于将临床表型明确的儿童原发性心肌病病例与全基因组序列信息相对应,并借助家系样本为共分离分析、变异筛选和候选基因评估提供可能。
【数据集背景】
原发性心肌病是一组以心肌结构和功能异常为主要特征的疾病,儿童期发病者往往具有更强的遗传背景。该数据集聚焦于儿童原发性心肌病,纳入 209 例先证者及其家系成员,旨在从全基因组层面刻画与疾病相关的遗传变异。本站将其归类于心血管系统疾病 / 心肌病,主题标签为 Genomics,说明其定位属于基因组学与心血管疾病交叉领域。数据集来源站为 omicsdi.org,英文名称为 a89709ba-e0a3-481d-b52a-db75b2c3afcc - samples。除上述信息外,源站未提供更多关于研究队列招募标准、临床分型或研究机构的信息。
【数据内容】
该数据集的内容为全基因组测序样本,涉及 209 例儿童原发性心肌病先证者及其家系成员。所有样本均使用 Illumina 短读长平台完成测序。样本类型覆盖先证者与家系成员,意味着数据中既包含患病个体的基因组信息,也可能包含其亲属的基因组信息,从而支持家系层面的遗传分析。主题标签为 Genomics,表明数据以基因组序列为核心内容。关于测序深度、读长、覆盖度、变异检出格式、样本性别与年龄分布等具体技术指标,源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 omicsdi.org。样本来自儿童原发性心肌病先证者及其家系成员,总数为 209 例先证者,并包含其家系成员。测序平台为 Illumina 短读长平台。除上述信息外,源站未提供样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、知情同意情况以及具体测序中心等细节。
【适用场景】
该数据集适用于儿童原发性心肌病的遗传学研究,包括全基因组范围内的变异发现、家系共分离分析、候选致病基因筛选以及基因组学层面的疾病机制探索。由于包含先证者及其家系成员,可用于比较患病个体与家系成员之间的基因组差异,辅助识别与疾病相关的遗传变异。主题标签 Genomics 也表明其可服务于基因组学相关的方法开发与验证。关于是否适用于临床诊断、药物研发或特定人群筛查等场景,源站未提供明确说明。
【使用方法】
该数据集以全基因组测序样本形式提供,样本使用 Illumina 短读长平台测序。使用者可根据研究目的对测序数据进行比对、变异检测、注释与家系分析。由于涉及先证者及其家系成员,分析时可考虑以家系为单位组织样本,开展共分离或连锁相关分析。关于数据的具体下载方式、文件格式、参考基因组版本、分析流程建议以及是否提供配套元数据表,源站未提供。
【质量与限制】
所有样本均使用 Illumina 短读长平台完成测序,该平台通常具有较高的碱基准确度,但短读长在结构变异、重复区域和大片段插入缺失的检测方面存在固有局限。数据集包含 209 例儿童原发性心肌病先证者及其家系成员,样本量在罕见病遗传研究中具有一定规模,但关于测序质量参数、覆盖均匀性、污染控制、重复样本比例以及数据完整性等信息,源站未提供。此外,源站未提供临床表型细节、遗传模式分类或变异验证情况,使用者在解释结果时需注意这些限制。
【引用与许可】
该数据集来源站为 omicsdi.org,英文名称为 a89709ba-e0a3-481d-b52a-db75b2c3afcc - samples。关于引用方式、原始文献、数据许可协议、使用条款以及是否允许再分发或商业使用等信息,源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008477
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
对209名原发性心肌病儿科先证者及其家庭成员进行了全基因组测序。所有样本均使用Illumina短读长平台进行测序。
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