体外膜氧合下的心源性休克患者数据集

数据以 GSE182609_series_matrix.txt.gz 文件形式提供,可用于研究该临床场景下的基因表达特征(来源 NCBI)

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基因组分类Expression profiling by arrayGPL135349606
GSE182609: Cardiogenic Shock Patients under Extracorporeal Membrane Oxygenation

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

体外膜氧合下的心源性休克患者数据集

GSE182609 是一个面向心源性休克患者接受体外膜肺氧合(ECMO)支持这一临床场景的基因表达谱数据集,源站标题为“Cardiogenic Shock Patients under Extracorporeal Membrane Oxygenation”。该数据集归入心血管系统疾病 / 心源性休克分类,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),由 Sung-Liang Yu 提交,发布时间为 Aug 23 202。数据集以芯片表达谱分析为主题,涉及 GPL13534 平台与人类(9606)样本,当前提供 1 个数据文件,样例文件名为 GSE182609_series_matrix.txt.gz。整体而言,该数据集可用于考察这一危重症临床情境下的基因表达特征。

【数据集背景】

心源性休克是心血管系统疾病中的危重状态,患者常需体外膜肺氧合等机械循环支持手段维持循环与氧合。该数据集正是围绕“接受体外膜肺氧合的心源性休克患者”这一特定临床人群构建的表达谱资源,主题标签为 Expression profiling by array,指向基于芯片的基因表达检测。源站将其描述为一个 SuperSeries,由下方列出的若干 SubSeries 组成,说明该数据集在结构上承担着整合多个子系列的角色。数据集所属分类为心血管系统疾病 / 心源性休克,与其标题所指向的临床场景一致。

【数据内容】

数据集当前提供 1 个文件,样例文件为 GSE182609_series_matrix.txt.gz,即 GZIP 压缩格式的系列矩阵文件。该文件形式通常承载样本层面的表达谱矩阵信息,可用于研究该临床场景下的基因表达特征。主题标签中给出的 GPL13534 为芯片平台标识,9606 为人类物种标识,表明数据涉及人类样本在特定芯片平台上的表达谱检测。除上述文件与标签信息外,源站未提供更细的样本数量、分组构成或具体基因层面的内容说明。

【采集与来源】

数据来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),源站标题为“Cardiogenic Shock Patients under Extracorporeal Membrane Oxygenation”。作者为 Sung-Liang,Yu,发布时间为 Aug 23 202。源站对该数据集的描述为:这是一个 SuperSeries,由下方列出的 SubSeries 组成。关于样本采集地点、采集时间跨度、临床纳入排除标准以及伦理审批等信息,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于围绕心源性休克患者接受体外膜肺氧合支持这一临床场景开展基因表达特征研究,例如在芯片表达谱层面考察该人群的表达模式。其主题标签表明数据属于芯片表达谱分析类型,平台为 GPL13534、物种为人类,因此适合在人类样本的芯片表达谱分析框架下使用。由于源站将其定位为 SuperSeries,使用时可结合其下属 SubSeries 的结构理解数据组织方式。关于具体的疾病机制推断、生物标志物筛选或临床预后分析等用途,源站未提供明确说明。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE182609_series_matrix.txt.gz,该文件为 GZIP 压缩包格式,需按相应格式解压与读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段含义或编码差异导致解析错误。读取后可按系列矩阵的常规结构整理样本与表达值信息,并结合 GPL13534 平台标识与人类物种标识进行后续分析。关于具体的分析流程、标准化方法或推荐工具,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集目前仅提供 1 个文件,即 GSE182609_series_matrix.txt.gz,数据规模与样本构成的详细信息源站未提供。源站描述仅说明其为由 SubSeries 组成的 SuperSeries,未给出各子系列的具体内容、样本量或质控指标。发布时间记为 Aug 23 202,年份信息不完整。关于数据是否存在批次效应、缺失值情况、归一化处理方式以及验证结果等质量相关信息,源站未提供。使用时宜先自行核对字段与编码,并在小样本上验证后再批量处理。

【引用与许可】

该数据集的作者为 Sung-Liang,Yu,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Aug 23 202。关于引用格式、许可条款或使用限制的具体信息,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE182609

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.

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