TCGA WSI UNI2H 特征数据集

该数据集是一个计算病理学特征数据集,主要包含从TCGA多种癌症(如头颈鳞状细胞癌、膀胱癌)的全切片数字病理图像中,以256x256网格提取的tile级1536维UNI2-h嵌入特征,数据模态为图像特征向量,主要用于支持多实例学习、表征学习、弱监督学习及模型可解释性等非临床的癌症计算病理学研究。

Hugging Face
2026-03-09 更新
浏览 25
task_categories:image-feature-extractionlanguage:enlicense:othersize_categories:n<1Kformat:imagefoldermodality:imagelibrary:datasetslibrary:mlcroissantregion:uspathologytcgawsi
TCGA WSI UNI2H Features

基本信息

大小
1003.45 GB
许可
other
创建/更新时间
2026-03-09

资源简介

TCGA WSI UNI2H 特征数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《W8Yi/tcga-wsi-uni2h-features》。源站首次发布:2026-03-06。

【数据内容】

源站原始描述:# TCGA WSI UNI2H Features # Dataset Summary This dataset provides tile-level **UNI2-h** embeddings extracted from **TCGA** whole-slide images (WSIs) using a reproducible, auditable pipeline designed for computational pathology research. Data is organized by project (for example TCGA-HNSC) and currently exposes: - `features/` containing H5 feature files with tile-level embeddings - `vis/` containing overlay images for quality inspe…

【数据结构与技术规格】

文件数 899 个,合计 67.99 GB。

【主题与分类】

主题标签:task_categories:image-feature-extraction、language:en、license:other、size_categories:n<1K、format:imagefolder、modality:image、library:datasets、library:mlcroissant、region:us、pathology。

【获取与许可】

源站页面:https://huggingface.co/datasets/W8Yi/tcga-wsi-uni2h-features

使用许可:other。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2026-03-25,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取与加载(Hugging Face datasets)

# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset

ds = load_dataset("W8Yi/tcga-wsi-uni2h-features")
print(ds)  # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install &amp;&amp; git clone https://hf-mirror.com/datasets/W8Yi/tcga-wsi-uni2h-features

数据说明

TCGA WSI UNI2H Features数据集是一个用于计算病理学研究的特征数据集,它提供了从癌症基因组图谱(TCGA)项目的全切片图像(WSIs)中提取的tile级UNI2-h嵌入特征。该数据集采用可重复、可审计的流程生成,包含来自TCGA-ACC、TCGA-BLCA、TCGA-BLCA_IDC和TCGA-HNSC等多个癌症项目的数百个H5格式特征文件及对应的PNG覆盖图像。每个H5文件包含1536维的UNI2-h嵌入特征、tile坐标等信息,特征提取基于20x等效单位,采用256x256的非重叠网格,并经过组织过滤以确保质量。该数据集主要支持多实例学习、图像检索、表征学习、弱监督学习和模型可解释性等非临床研究,用户在使用时需遵守TCGA的数据使用条款和隐私规定。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

完整数据卡:huggingface.co/datasets/W8Yi/tcga-wsi-uni2h-features

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