癌症依赖图谱数据集

癌症依赖图谱数据集提供癌细胞系CRISPR筛选、RNAi、组学、药物反应和细胞系注释,数据模态为多模态,可用于癌症相关病例识别、诊断建模、分割检测、风险评估或临床研究复现。

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DepMap Portal
2025-01-01 更新
浏览 22
多模态药物反应预测cancerdependency mapDepMap
DepMap Public

基本信息

模态
多模态
数据量
1700
任务类型
药物反应预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2025-01-01

资源简介

癌症依赖图谱数据集

【一句话概览】

DepMap 门户在进入前会进行人机验证,以确认访问者为真人而非机器人,从而帮助保持门户对研究人员的响应速度。若需批量获取 DepMap 数据,可随时从下载区获取全部内容,请勿抓取门户。进入 DepMap 需启用 Cookie。该门户涉及癌症、依赖图谱等标签(来源 depmap.org)。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《DepMap — Verification Cancer Dependency Map Portal》。

【数据内容】

源站原始描述:Quick check before you enter We’re verifying you’re a person, not a bot. This helps keep the portal responsive for researchers. Need DepMap data in bulk? You’re always welcome to grab everything from the downloads section — please don’t scrape the portal. Enter DepMap → Cookies must be enabled to access this site

中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):进入前快速检查 我们正在验证您是真人,而非机器人。这有助于保持门户对研究人员的响应速度。需要批量获取DepMap数据?欢迎随时从下载区获取全部内容——请勿抓取门户。进入DepMap → 必须启用Cookie才能访问本网站。

【主题与分类】

主题标签:cancer、dependency map、DepMap。

【适用方向】

多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。

【获取与许可】

源站页面:https://depmap.org/portal/data_page/

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当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://depmap.org/portal/data_page/

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DepMap Public 数据集包含癌细胞系CRISPR筛选、RNAi、组学、药物反应和细胞系注释,可围绕癌症(Cancer)开展病例筛选、特征提取、诊断分类、分割检测或预后分析。

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