SHR/01a、BN-Lx及重组近交(HXB/BXH)6周龄大鼠品系腹膜脂肪转录组分析
该数据集来自omicsdi.org，提供SHR/01a自发性高血压大鼠、携带多趾-畸形综合征的Brown Norway同源品系BN-Lx以及重组近交(HXB/BXH)品系6周龄大鼠腹膜脂肪的基因表达谱
基本信息
资源简介
SHR/01a、BN-Lx及重组近交(HXB/BXH)6周龄大鼠品系腹膜脂肪转录组分析
该数据集为一份转录组学基因表达谱资源，英文名称为“Transcription profiling of peritoneal fat of SHR/01a (spontaneously hypertensive rat), BN-Lx (Brown Norway congenic carrying polydactyly-luxate syndrome)and recombinant inbred (HXB/BXH) 6-week old rat strains”，来源于omicsdi.org。其核心内容是对三种大鼠品系——SHR/01a自发性高血压大鼠、携带多趾-畸形综合征的Brown Norway同源品系BN-Lx，以及重组近交(HXB/BXH)品系——在6周龄时腹膜脂肪组织进行的基因表达谱分析。该数据集在站内被归类于心血管系统疾病 / 心碎综合征方向，主题标签为Transcriptomics，整体上服务于以转录组视角观察特定大鼠品系脂肪组织基因表达特征的研究需求。
【数据集背景】
该数据集聚焦于大鼠模型中的腹膜脂肪组织转录组特征。研究所涉及的动物材料包括SHR/01a自发性高血压大鼠、BN-Lx（携带多趾-畸形综合征的Brown Norway同源品系）以及重组近交(HXB/BXH)品系。这些品系分别代表了高血压相关背景、特定遗传缺陷背景以及重组近交遗传背景，为在转录水平上比较不同遗传构成下腹膜脂肪的基因表达提供了基础。数据集在站内被归入心血管系统疾病 / 心碎综合征分类，提示其可能与心血管系统疾病相关研究存在关联。关于该数据集更具体的立项背景、研究假设或项目来源，源站未提供。
【数据内容】
该数据集的核心内容是基因表达谱，即转录组层面的表达数据。其生物学样本为上述三种大鼠品系的腹膜脂肪组织，动物年龄统一为6周龄。数据覆盖SHR/01a、BN-Lx以及重组近交(HXB/BXH)品系，旨在呈现这些品系在相同组织、相同发育时间点上的基因表达特征。主题标签为Transcriptomics，表明数据属于转录组学范畴。关于具体检测平台、表达定量指标、基因数量、样本重复数或数据文件格式等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为omicsdi.org。根据源站描述，其内容为对SHR/01a、BN-Lx和重组近交(HXB/BXH)品系6周龄大鼠腹膜脂肪的基因表达谱分析。数据集的英文名称本身也概括了所涉及的品系与组织信息。关于样本采集的具体流程、组织处理方式、实验操作步骤、测序或芯片平台信息以及数据产生的时间与地点，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组学相关研究，尤其是围绕大鼠腹膜脂肪组织的基因表达比较分析。由于涉及SHR/01a自发性高血压大鼠、BN-Lx同源品系以及重组近交(HXB/BXH)品系，可用于探索不同遗传背景下脂肪组织的表达差异。结合站内分类“心血管系统疾病 / 心碎综合征”，该数据可能适用于心血管系统疾病相关机制研究中的转录组层面探索。此外，6周龄这一时间点使其可用于发育早期或疾病前期阶段的表达特征研究。关于该数据集在具体疾病模型、通路分析或药物研究中的适用性，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以转录组基因表达谱形式提供，使用者可依据来源站omicsdi.org获取相关数据。由于主题标签为Transcriptomics，常规使用方式包括对表达谱进行品系间比较、差异表达分析或表达模式聚类等。关于数据下载方式、文件组织格式、预处理流程、标准化方法以及配套分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于omicsdi.org，其源站描述明确指出了所涉及的品系、组织与年龄信息。然而，关于样本量、重复数、数据完整性、测序深度或芯片覆盖度、质控指标以及潜在批次效应等信息，源站未提供。因此，在缺乏这些细节的情况下，使用者难以全面评估数据质量。此外，该数据集仅涵盖6周龄大鼠的腹膜脂肪组织，其结论是否可推广至其他年龄、其他组织或其他品系，源站未提供相关说明。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息，源站未提供。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-AFMX-7
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
Gene expression profiling of peritoneal fat of SHR/01a (spontaneously hypertensive rat), BN-Lx (Brown Norway congenic carrying polydactyly-luxate syndrome)and recombinant inbred (HXB/BXH) 6-week old rat strains.
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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