房间隔缺损患者与西班牙裔成人对照的RNA测序样本数据集

该数据集来自 omicsdi.org,包含 24 个样本的 RNA 序列,其中 13 例为无亲缘关系的房间隔缺损(ASD)患者(均为男性),11 例为西班牙裔成人对照(4 名男性、7 名女性)

omicsdi
浏览 5
基因组分类Genomics
377490e0-7989-48a6-a874-d53d1b197dae - samples

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-10

资源简介

房间隔缺损患者与西班牙裔成人对照的RNA测序样本数据集

该数据集收录于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics,本站分类归入心血管系统疾病下的房间隔缺损方向。数据集英文名称为 377490e0-7989-48a6-a874-d53d1b197dae - samples,内容为 RNA 序列数据,共包含 24 个样本。其中 13 例为无亲缘关系的房间隔缺损(ASD)患者,均为男性;另 11 例为西班牙裔成人对照,包括 4 名男性和 7 名女性。测序研究在 Illumina 的 HiSeq 4000 平台上完成,获得双端序列,并以 fastq 文件形式保存。该数据集可用于从转录组层面观察房间隔缺损患者与成人对照之间的 RNA 序列特征,为相关心血管疾病研究提供样本层面的序列资源。

【数据集背景】

房间隔缺损属于心血管系统疾病中的一类先天性心脏异常。该数据集聚焦于房间隔缺损患者与成人对照之间的 RNA 序列比较,其来源站为 omicsdi.org,主题标签为 Genomics。数据集英文名称为 377490e0-7989-48a6-a874-d53d1b197dae - samples。从源站描述可知,研究纳入的 ASD 患者均为无亲缘关系个体,且全部为男性;对照为西班牙裔成人。该数据集以 RNA 序列为核心内容,属于转录组层面的组学数据,可用于探索房间隔缺损相关的基因表达或序列变异信息。关于该研究的具体科学假设、研究目的及更详细的疾病背景,源站未提供。

【数据内容】

该数据集包含 24 个样本的 RNA 序列。样本构成如下:13 例为无亲缘关系的房间隔缺损(ASD)患者,均为男性;11 例为西班牙裔成人对照,其中 4 名男性、7 名女性。测序类型为 RNA 序列,采用双端测序策略,所得序列以 fastq 文件形式保存。数据集的主题标签为 Genomics,本站分类为心血管系统疾病 / 房间隔缺损。除上述样本数量、性别构成、疾病状态、对照来源及序列文件类型外,源站未提供关于具体基因、转录本、表达量矩阵、变异位点或临床表型等更细粒度的数据内容说明。

【采集与来源】

该数据集来自 omicsdi.org。根据源站描述,RNA 测序研究在 HiSeq 4000(Illumina)平台上进行,获得双端序列,并生成 fastq 文件。样本包括 13 例无亲缘关系的 ASD 患者(均为男性)和 11 例西班牙裔成人对照(4 名男性、7 名女性)。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、知情同意情况以及具体的建库方法,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与房间隔缺损相关的转录组研究场景。由于包含 ASD 患者与成人对照的 RNA 序列,可用于比较两组样本在 RNA 序列层面的差异,例如探索与房间隔缺损相关的基因表达变化或序列特征。其主题标签为 Genomics,本站分类为心血管系统疾病 / 房间隔缺损,因此也可作为心血管疾病组学分析、转录组数据挖掘或方法学验证的样本资源。此外,由于对照为西班牙裔成人,该数据集可能适用于涉及该人群背景的转录组比较研究。关于该数据集是否适用于特定分析流程、是否可用于临床诊断或预后判断,源站未提供相关说明。

【使用方法】

该数据集以 fastq 文件形式提供双端 RNA 序列。使用者可根据常规转录组分析流程,对 fastq 文件进行质控、比对、定量及差异分析等操作。由于样本包含 13 例 ASD 患者和 11 例对照,可在分析中按疾病状态分组比较。关于具体的下载方式、数据访问链接、是否需申请权限、推荐的分析软件或参数,源站未提供。使用时应结合自身研究目的,并参考相关平台或数据库的通用规范进行操作。

【质量与限制】

该数据集共 24 个样本,其中 ASD 患者 13 例且均为男性,对照 11 例包括 4 名男性和 7 名女性。样本性别构成在组间并不均衡,ASD 组全部为男性,而对照组包含两性。对照为西班牙裔成人,来源人群相对集中。测序在 HiSeq 4000(Illumina)平台上完成,获得双端序列并以 fastq 文件保存。关于测序深度、读长、数据质量评分、批次效应、样本排除标准及潜在混杂因素,源站未提供。因此,在解释结果时需考虑样本量、性别分布及人群背景等可能限制,具体质量评估需依据实际数据判断。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式、文献出处、DOI、数据许可协议及使用条款,源站未提供。使用者如需引用或再利用该数据集,应自行查阅 omicsdi.org 上对应条目的最新说明,或联系数据提供方获取授权与引用信息。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00001008160

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

共对24个样本进行了RNA序列分析,其中包括13名无关的ASD患者(13名男性)和11名西班牙裔成年个体作为对照组(4名男性,7名女性)。RNAseq研究在HiSeq 4000(Illumina)平台上进行,并获得了双端序列(fastq文件)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案