能量稳态表观遗传失调驱动主动脉瓣狭窄且二甲双胍可治疗 [Cut & Tag]

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE302552

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在通过分析对照和Hdac3缺陷瓣膜中H3K27ac富集情况，以及对照瓣膜中HDAC3和磷酸化HDAC3（Ser424）的占据情况，探究小鼠主动脉瓣的表观遗传调控。我们采用CUT&Tag技术评估增强子活性的全基因组变化及HDAC3结合情况，以识别瓣膜间质细胞中Hdac3缺失所破坏的调控元件和通路。这些数据为理解HDAC3及其磷酸化在维持表观遗传稳态和主动脉瓣完整性所必需的基因表达程序中的作用提供了见解。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。