NAT10敲低对人瓣膜间质细胞基因表达的影响

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE335315

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

钙化性主动脉瓣疾病以人瓣膜间质细胞的成骨分化和钙化为特征。我们发现，钙化的人主动脉瓣中NAT10表达升高，且NAT10正向调控瓣膜间质细胞的钙化。为研究NAT10在人瓣膜间质细胞中的下游调控分子，我们对NAT10敲低细胞及匹配的阴性对照进行了RNA-seq。通过比较shNAT10组与shNC组的转录组，鉴定出可能参与瓣膜间质细胞钙化的NAT10调控基因和通路。这些数据为理解NAT10在调控人瓣膜间质细胞功能和钙化性主动脉瓣疾病中的作用提供了分子资源。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。