Name: 基于iTRAQ与Label Free技术的主动脉夹层蛋白质组学研究数据
Creator: 千方医数集科研发现管道
License: CC BY 4.0

基本信息

模态

医学影像

大小

0.00003732 GB

任务类型

分类

许可

CC BY 4.0

创建/更新时间

2023-06-16

版本

v1

资源简介

基于iTRAQ与Label Free技术的主动脉夹层蛋白质组学研究数据

DataSheet2_Study on Proteomics-Based Aortic Dissection Molecular Markers Using iTRAQ Combined With Label Free Techniques.xlsx

该数据集来自frontiersin.figshare.com，包含1个Excel文件，配套论文发表于BioMed Research International（2011年）。数据围绕主动脉夹层（aortic dissection）的蛋白质组学研究，采用iTRAQ结合Label Free技术，涉及血清分子标志物的筛选与急性主动脉夹层发病机制的初步鉴定。数据集可用于主动脉夹层与急性冠脉综合征的鉴别诊断、风险预测及分子标志物发现等研究（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。

【数据集背景】

配套论文《Quantitative Proteomics Analysis by Isobaric Tags for Relative and Absolute Quantitation Identified Lumican as a Potential Marker for Acute Aortic Dissection》发表于 BioMed Research International（2011），DOI：10.1155/2011/920763。源站首次发布：2022-07-15。

【数据内容】

源站描述（机器翻译，仅供参考）：背景：主动脉夹层是指主动脉中膜分离并沿长轴延伸，形成主动脉壁的真假腔。65–70%的患者死于心脏压塞、心律失常、夹层破裂等。目前，超声心动图、计算机断层扫描血管造影（CTA）等是主动脉夹层的主要诊断工具。迄今为止，尚无可用于鉴别诊断和风险评估的快速血清分子标志物。目的：系统筛选主动脉夹层与急性冠脉综合征中的血清分子标志物，并初步鉴定急性主动脉夹层的发病机制。方法：对广东省医疗纠纷协调数据库中所有医院的相关争议病例进行统计分析，计算AAD医疗纠纷比例、早期死亡比例和误诊比例。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个，合计 37.32 KB。数据集 DOI：10.3389/fphys.2022.862732.s002。

【主题与分类】

源站学科分类：Animal Physiology - Biophysics、Animal Physiology - Cell、Animal Physiology - Systems、Comparative Physiology、Physiology not elsewhere classified、Reproduction。主题标签：aortic dissection、proteomic、iTRAQ、label-free、Lumican。本站分类：心血管系统疾病/主动脉夹层。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Animal Physiology - Biophysics、Animal Physiology - Cell、Animal Physiology - Systems、Comparative Physiology、Physiology not elsewhere classified、Reproduction。

【获取与许可】

源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet2_Study_on_Proteomics-Based_Aortic_Dissection_Molecular_Markers_Using_iTRAQ_Combined_With_Label_Free_Techniques_xlsx/20317068

使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。

规范引用：Deng, Ting; Liu, Yongguang; Gael, Akindavyi; Fu, Xiaohua; Deng, Xiaofang; Liu, Yunfeng; et al. (2022). DataSheet2_Study on Proteomics-Based Aortic Dissection Molecular Markers Using iTRAQ Combined With Label Free Techniques.xlsx. Frontiers. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-06-16，引用时请注意版本时效。

原始链接

https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet2_Study_on_Proteomics-Based_Aortic_Dissection_Molecular_Markers_Using_iTRAQ_Combined_With_Label_Free_Techniques_xlsx/20317068

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使用方式

数据集获取（Figshare）

源站标题：DataSheet2_Study on Proteomics-Based Aortic Dissection Molecular Markers Using iTRAQ Combined With Label Free Techniques.xlsx
DOI：10.3389/fphys.2022.862732.s002
发布日期：2022-07-15
文件数：1 个
文件总体积：37.32 KB
源站页面：https://frontiersin.figshare.com/articles/dataset/DataSheet2_Study_on_Proteomics-Based_Aortic_Dissection_Molecular_Markers_Using_iTRAQ_Combined_With_Label_Free_Techniques_xlsx/20317068

命令行下载

curl -L -o "DataSheet2_Study on Proteomics-Based Aortic Dissection Molecular Markers Using iTRAQ Combined With Label Free Techniques.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/36301140"

文件清单

DataSheet2_Study on Proteomics-Based Aortic Dissection Molecular Markers Using iTRAQ Combined With Label Free Techniques.xlsx（37.32 KB）

文件总体积 37.32 KB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

背景：主动脉夹层是指主动脉中层分离并沿长轴延伸，形成主动脉壁的真腔与假腔。65–70%的患者死于心脏压塞、心律失常、夹层破裂等。目前，超声心动图、计算机断层扫描血管造影（CTA）等是主动脉夹层的主要诊断工具。迄今为止，尚无可用于鉴别诊断和风险评估的快速血清分子标志物。目的：系统筛选主动脉夹层与急性冠脉综合征之间的血清分子标志物，并初步明确急性主动脉夹层的发病机制。方法：对广东省医疗纠纷协调委员会2013年至2017年数据库中所有医院的相关争议病例进行统计分析，计算AAD医疗纠纷比例、早期死亡比例和误诊比例。

血清和主动脉组织样本分别通过iTRAQ和无标记分析进行定量，进一步通过ELISA验证，并通过免疫荧光和Western blot对来自2016年至2018年南方医科大学珠江医院和广东省人民医院入组的AAD和对照患者的蛋白质进行验证。结果：AAD病例在所有150例心血管争议中占15.29%，在所有24小时内发生的心血管死亡中占59.26%，在死亡时仍未确诊的患者中占88.89%。通过iTRAQ鉴定出84种蛋白质（分别有66种和18种上调和下调），通过Label-free鉴定出16种蛋白质（分别有9种和7种上调和下调）。通过David/Ease和String技术鉴定出九种与主动脉夹层发病机制相关的蛋白质（Lumican、FGL1、PI16、MMP9、FBN1、MMP2、VWF、MMRN1和PF4）作为验证试验的候选生物标志物。ELISA验证后发现四种蛋白质（Lumican、FGL1、PI16和MMP9）具有统计学差异。除Lumican外，FGL1、PI16和MMP9蛋白的表达在病理学上显著增加。

组织学上，主动脉组的TGF-β1、α-SMA和Collagen1也显著更高。C