人胸主动脉夹层环状RNA表达谱数据集
该数据集来自 NCBI GEO(GSE97745),利用 Arraystar 人环状 RNA 芯片分析 3 例 A 型胸主动脉夹层患者与 3 例年龄匹配正常供者主动脉节段的环状 RNA 差异表达谱,并通过实时定量 PCR 验证环状 RNA、亲本基因及 hsa-miR-320a 的表达,Western

基本信息
资源简介
人胸主动脉夹层环状RNA表达谱数据集
Circular RNA expression profile in human thoracic aortic dissection
该数据集来自 NCBI GEO(GSE97745),利用 Arraystar 人环状 RNA 芯片分析 3 例 A 型胸主动脉夹层患者与 3 例年龄匹配正常供者主动脉节段的环状 RNA 差异表达谱,并通过实时定量 PCR 验证环状 RNA、亲本基因及 hsa-miR-320a 的表达,Western blotting 确认 MMP9 表达,同时开展网络分析、Gene ontology 和 KEGG 通路分析。数据可用于胸主动脉夹层相关环状 RNA 标志物筛选与机制探索(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Apr 13 201。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):旨在评估环状 RNA(circRNA)表达谱并探索其在人胸主动脉夹层(TAD)中的潜在功能。使用 Arraystar 人环状 RNA 芯片分析人 A 型 TAD 患者(n=3)与年龄匹配正常供者(NA;n=3)主动脉节段之间的差异表达环状 RNA 谱。采用实时定量 PCR 验证环状 RNA、亲本基因及 hsa-miR-320a 的表达模式;Western blotting 用额外样本确认 MMP9 表达。利用包括网络分析、Gene ontology 和 KEGG 通路分析在内的生物信息学工具进行分析。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Non-coding RNA profiling by array、GPL21825、9606。本站分类:心血管系统疾病/主动脉夹层。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE97745
【使用注意】
· 源站最后修改于 Apr 13 202,引用时请注意版本时效。
下载信息
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
为评估环状RNA(circRNAs)的表达谱并探索其在人类胸主动脉夹层(TAD)中的潜在功能,采用Arraystar人类circRNAs微阵列分析人A型TAD患者(n=3)与年龄匹配的正常供体(NA;n=3)主动脉节段中差异表达的circRNAs谱。采用实时定量PCR验证circRNAs、亲本基因及hsa-miR-320a的表达模式;通过Western blotting在额外样本中确认MMP9表达。利用网络分析、基因本体论及KEGG通路分析等生物信息学工具进行分析。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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