人胸主动脉微区域 bulk RNA 测序数据

该数据集为来自人胸主动脉的微区域 bulk RNA 测序数据,包含 1 个文件(GSE318877_series_matrix.txt.gz),主题标签涉及高通量测序表达谱分析、GPL30173 平台及物种 9606

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基因组回归GPL301739606
GSE318877: Micro-regional bulk RNA sequencing data obtained from human thoracic aorta

基本信息

模态
基因组
任务类型
回归
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

人胸主动脉微区域 bulk RNA 测序数据

GSE318877 是一项针对人胸主动脉开展的微区域 bulk RNA 测序数据集,其英文全称为 Micro-regional bulk RNA sequencing data obtained from human thoracic aorta。该数据集聚焦心血管系统疾病中的主动脉夹层方向,通过高通量测序表达谱分析手段,捕捉主动脉壁内的基因表达变化,为理解主动脉疾病的发病机制提供数据支撑。数据集由 Kenichi Kimura 提交,来源为 ncbi.nlm.nih.gov,发布时间为 Feb 09 202,共包含 1 个文件,样例文件为 GSE318877_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及 Expression profiling by high throughput sequencing、GPL30173 平台以及物种编号 9606。

【数据集背景】

主动脉壁内基因表达的改变对于理解主动脉疾病的发病机制具有关键意义。为探究与人主动脉中膜疾病进展相关的基因表达变化,研究者采用微区域 RNA 测序分析策略,对来自人胸主动脉的样本进行表达谱刻画。该数据集即在这一研究背景下产生,归属于心血管系统疾病中的主动脉夹层方向,旨在从微区域尺度呈现主动脉壁内的转录组特征。

【数据内容】

该数据集的核心内容为来自人胸主动脉的微区域 bulk RNA 测序数据。数据集共包含 1 个文件,样例文件名为 GSE318877_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式存储。主题标签表明其属于高通量测序表达谱分析类型,涉及 GPL30173 平台,物种为 9606(即人类)。数据以系列矩阵文件的形式组织,便于对样本层面的表达信息进行汇总与查阅。

【采集与来源】

数据来源于 ncbi.nlm.nih.gov,源站标题为 Micro-regional bulk RNA sequencing data obtained from human thoracic aorta。源站描述指出,研究通过对人主动脉中膜进行微区域 RNA 测序分析,考察与疾病进展相关的基因表达改变。数据集作者为 Kenichi Kimura,发布时间为 Feb 09 202。样本取材于人类胸主动脉,属于心血管系统疾病研究范畴。

【适用场景】

该数据集适用于主动脉疾病尤其是主动脉夹层相关的基因表达研究,可用于考察主动脉壁内不同微区域的转录组差异,辅助理解疾病进展过程中的表达变化。其高通量测序表达谱属性也使其可用于表达谱层面的比较分析与候选基因挖掘等通用研究用途。具体研究设计与样本构成等信息,源站未提供。

【使用方法】

使用时可先下载数据文件 GSE318877_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入后续分析流程。关于平台注释与样本分组的具体处理方式,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集仅包含 1 个文件,数据规模与样本数量等信息源站未提供。数据源自公共数据库 NCBI,其质量控制指标、测序深度及批次信息等细节源站未提供,使用时应结合具体分析目的进行评估。

【引用与许可】

数据集作者为 Kenichi Kimura,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于引用方式与使用许可的具体条款,源站未提供。

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使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE318877

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

捕获主动脉壁内的基因表达变化对于理解主动脉疾病的发病机制至关重要。为探究与人主动脉中膜疾病进展相关的基因表达改变,我们进行了微区域RNA测序分析。

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