全蛋白质组筛选鉴定钙结合蛋白S100A8/S100A9为主动脉夹层临床相关治疗靶点的转化研究 [scRNA-seq]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为全蛋白质组筛选鉴定钙结合蛋白 S100A8/S100A9 为主动脉夹层临床相关治疗靶点的转化研究,包含单细胞 RNA 测序数据,共 1 个文件(GSE247260_series_matrix.txt.gz)
![GSE247260: A proteome-wide screen identifies the calcium binding proteins, S100A8/S100A9, as clinically relevant therapeutic targets in aortic dissection: a translational study [scRNA-seq]](/medical-api/medicalDataset/datasetCover/152215.jpg)
基本信息
资源简介
全蛋白质组筛选鉴定钙结合蛋白S100A8/S100A9为主动脉夹层临床相关治疗靶点的转化研究 [scRNA-seq]
A proteome-wide screen identifies the calcium binding proteins, S100A8/S100A9, as clinically relevant therapeutic targets in aortic dissection: a translational study [scRNA-seq]
该数据集来自 NCBI GEO,标题为全蛋白质组筛选鉴定钙结合蛋白 S100A8/S100A9 为主动脉夹层临床相关治疗靶点的转化研究,包含单细胞 RNA 测序数据,共 1 个文件(GSE247260_series_matrix.txt.gz)。研究通过无偏蛋白质组学与 RNA 测序分析,发现 S100A8/A9 在 TAAAD 患者主动脉和血清及小鼠模型中蛋白表达上调。数据可用于主动脉夹层相关基因表达谱分析与细胞类型分类研究(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Nov 07 202。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):S100A8 和 S100A9(别名 MRP8 和 MRP14)在中性粒细胞和单核细胞中高表达,被归类为损伤相关分子模式(DAMP)分子或警报分子。然而,S100A8/A9 在主动脉夹层中的作用尚未见报道。在本研究中,通过采用无偏蛋白质组学方法和 RNA 测序分析,我们发现钙结合蛋白 S100A8/A9 的蛋白表达在 TAAAD 患者的主动脉和血清中以及小鼠模型中均上调。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:GPL24247、10090。本站分类:心血管系统疾病/主动脉夹层。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE247260
【使用注意】
· 源站最后修改于 May 07 202,引用时请注意版本时效。
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
S100A8和S100A9(别名MRP8和MRP14)在中性粒细胞和单核细胞中高表达,被归类为损伤相关分子模式(DAMP)分子或警报分子。然而,S100A8/A9在主动脉夹层中的作用尚未见报道。在本研究中,通过采用无偏蛋白质组学方法和RNA测序分析,我们发现钙结合蛋白S100A8/A9的蛋白表达在TAAAD患者的主动脉和血清中以及小鼠模型中均上调。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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