主动脉夹层患者深低温停循环期间血浆tRNA衍生小RNA差异表达谱与功能预测

该数据集来自NCBI GEO,聚焦主动脉夹层患者深低温停循环(DHCA)过程中的血浆tRNA衍生小RNA(tsRNA)表达谱

geo
浏览 9
基因组预测GPL185739606
GSE171909: Differential expression profiles and functional prediction of tRNA-derived small RNAs in plasma of patients with aortic dissection during deep hypothermic circulatory arrest

基本信息

模态
基因组
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

主动脉夹层患者深低温停循环期间血浆tRNA衍生小RNA差异表达谱与功能预测

Differential expression profiles and functional prediction of tRNA-derived small RNAs in plasma of patients with aortic dissection during deep hypothermic circulatory arrest

该数据集来自NCBI GEO,聚焦主动脉夹层患者深低温停循环(DHCA)过程中的血浆tRNA衍生小RNA(tsRNA)表达谱。研究采集T1(停循环前)、T2(DHCA开始后15分钟)、T3(左颈总动脉去钳夹后、复温前)三个时间点的中心静脉血样,通过高通量测序鉴定差异表达的tsRNA,并据此预测可能的调控因子,旨在为DHCA过程寻找有效的器官保护策略。数据可用于tsRNA表达模式分析及功能预测研究(来源 NCBI)。

【数据集背景】

源站首次发布:Apr 12 202。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究旨在检测深低温停循环期间tsRNA的表达谱,并根据其表达水平变化寻找可能的调控因子,希望为该过程提供有效的器官保护策略。从中心静脉管路采集三份血样至乙二胺四乙酸(EDTA)管,具体如下:T1(开始停循环前)、T2(DHCA开始后15分钟)、T3(左颈总动脉去钳夹后、复温前)。在T1和T2组中共鉴定出286个共同表达的tsRNA,T1组特异表达68个tsRNA,T2组特异表达44个tsRNA。在T2和T3组中共鉴定出290个共同表达的tsRNA,T2组特异表达64个tsRNA,T3组特异表达43个tsRNA。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 0 B。

【主题与分类】

主题标签:GPL18573、9606。本站分类:心血管系统疾病/主动脉夹层。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE171909

【使用注意】

· 源站最后修改于 Apr 29 202,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE171909

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究旨在检测深低温停循环期间的tsRNA表达谱,并根据其表达水平的变化寻找可能的调控因子,以期为该过程提供有效的器官保护策略。从中心静脉管路采集三份血液样本至乙二胺四乙酸(EDTA)管中,具体如下:T1(开始停循环前)、T2(DHCA开始后15分钟)、T3(左颈总动脉去钳夹后、复温前)。在T1和T2组中共鉴定出286个共同表达的tsRNA,T1组特异性表达68个tsRNA,T2组特异性表达44个tsRNA。在T2和T3组中共鉴定出290个共同表达的tsRNA,T2组特异性表达64个tsRNA,T3组特异性表达43个tsRNA。接下来,选取四个tsRNA通过qRT-PCR进行验证。

总之,本研究创新性地提出了深低温停循环过程与tsRNA表达谱之间的相关性,并评估了tsRNA的表达水平及调控方式。对其在深低温停循环过程中的潜在生物学作用进行了初步探索,可为深低温停循环的器官保护机制提供更好的依据和更全面的解释。在进一步研究中,我们有望通过过表达或抑制相应的tsRNA来实现对器官的靶向保护。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案