主动脉夹层与正常人类主动脉的转录组和N6-甲基腺苷RNA甲基化组分析
该数据集为GSE147028,包含主动脉夹层与正常人类主动脉的转录组和N6-甲基腺苷RNA甲基化组分析数据,属于SuperSeries,由所列SubSeries组成

基本信息
资源简介
主动脉夹层与正常人类主动脉的转录组和N6-甲基腺苷RNA甲基化组分析
GSE147028 是一个围绕主动脉夹层与正常人类主动脉组织展开的转录组与 N6-甲基腺苷(m6A)RNA 甲基化组分析数据集,来源于 NCBI(ncbi.nlm.nih.gov),归属于心血管系统疾病下的主动脉夹层方向。该数据集以 SuperSeries 形式组织,由若干 SubSeries 组成,配套提供 1 个数据文件 GSE147028_series_matrix.txt.gz,主题标签涉及高通量测序表达谱分析、平台 GPL24676 与物种编号 9606。整体而言,该数据集面向主动脉夹层与正常主动脉之间基因表达及 m6A RNA 甲基化修饰差异的比较研究,适合作为心血管疾病转录组与表观转录组分析的基础数据资源。
【数据集背景】
主动脉夹层属于心血管系统疾病范畴,涉及主动脉壁结构的病理改变。该数据集聚焦于主动脉夹层与正常人类主动脉样本,同时从转录组表达谱和 N6-甲基腺苷 RNA 甲基化组两个层面开展分析,旨在为理解主动脉夹层在基因表达与 RNA 甲基化修饰层面的特征提供数据支撑。数据集标题明确指向“主动脉夹层与正常人类主动脉的转录组和 N6-甲基腺苷 RNA 甲基化组分析”,其研究定位属于比较性分析,即以正常主动脉作为参照,考察夹层样本中的表达与甲基化变化。
【数据内容】
该数据集为 SuperSeries,由所列 SubSeries 组成,源站描述明确指出“This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.”。数据集包含 1 个文件,文件样例为 GSE147028_series_matrix.txt.gz,采用 GZIP 压缩格式。主题标签显示其涉及高通量测序表达谱分析(Expression profiling by high throughput sequencing)、平台 GPL24676 以及物种编号 9606(人类)。数据内容覆盖转录组与 m6A RNA 甲基化组两类分析信息,具体子系列构成与各子系列的样本规模、分组细节源站未提供。
【采集与来源】
数据来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,数据集英文名为“GSE147028: Transcriptome and N6-methyladenosine RNA methylome analyses in aortic dissection and normal human aorta”,源站标题与数据集英文名一致。作者信息记为 xianwu,zhou,发布时间为 Mar 16 202。样本物种为人类(9606),检测平台为 GPL24676。关于样本采集地点、临床信息来源、伦理审批及具体实验流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于主动脉夹层与正常主动脉之间的转录组表达谱比较分析,以及 N6-甲基腺苷 RNA 甲基化组的差异分析;也可用于两类组学数据之间的联合考察,探索表达变化与 m6A 修饰之间的关联。由于数据集以 SuperSeries 形式组织,使用者可按需追溯其下属 SubSeries 以获取更细粒度的数据。此外,该数据集可作为心血管系统疾病尤其是主动脉夹层方向的公共数据资源,用于方法验证、结果对照或二次分析。具体分析类型与适用范围应以源站及子系列说明为准,源站未提供更详细的适用建议。
【使用方法】
使用时可先下载数据文件 GSE147028_series_matrix.txt.gz,按 GZIP 压缩包格式进行读取。建议先在小样本上核对字段与编码,确认无误后再批量接入,以避免因字段含义或编码差异导致解析错误。由于该数据集为 SuperSeries,实际分析时还需结合其下属 SubSeries 的数据组织方式进行整合。关于表达谱与甲基化组数据的具体处理流程、标准化方法与分析工具,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集仅包含 1 个文件,文件样例为 GSE147028_series_matrix.txt.gz,数据规模与样本数量源站未提供。作为 SuperSeries,其数据完整性依赖于下属 SubSeries 的可用性,源站描述仅说明由所列 SubSeries 组成,未给出各子系列的具体内容。发布时间记为 Mar 16 202,年份信息不完整。关于数据质量评估、批次效应、样本纳入排除标准及技术重复情况,源站未提供。使用者应注意该数据集在物种上限定为人类(9606),平台为 GPL24676,跨平台或跨物种外推需谨慎。
【引用与许可】
作者信息为 xianwu,zhou,来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据集的引用格式、许可条款与使用限制,源站未提供。使用者在发表相关研究成果时,应遵循源站及原作者的引用要求,具体许可信息需以源站说明为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE147028
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
This SuperSeries is composed of the SubSeries listed below.
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