GSE12279:AAA-ATPase结构域与溴结构域的功能协同
该数据集来自NCBI GEO,标题为AAA-ATPase结构域与溴结构域的功能协同,归入心血管系统疾病/主动脉瘤分类。源站描述围绕Atad2蛋白两个结构域的功能协同展开,涉及蛋白多聚化、乙酰化核小体结合、组蛋白H4尾部乙酰化K5位点特异性及转录抑制等

基本信息
资源简介
GSE12279:AAA-ATPase结构域与溴结构域的功能协同
Functional cooperation between AAA-ATPase domain and a bromodomain.
该数据集来自NCBI GEO,标题为AAA-ATPase结构域与溴结构域的功能协同,归入心血管系统疾病/主动脉瘤分类。数据为表达谱芯片,平台GPL1456,物种为人(9606),共1个文件,样例为GSE12279_series_matrix.txt.gz。源站描述围绕Atad2蛋白两个结构域的功能协同展开,涉及蛋白多聚化、乙酰化核小体结合、组蛋白H4尾部乙酰化K5位点特异性及转录抑制等。该数据可用于研究相关基因表达变化及结构域功能机制(来源 NCBI)。
【数据集背景】
源站首次发布:Jul 29 200。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):已证实AAA型ATPase结构域与溴结构域之间存在功能协同。这两个结构域在一个尚未被表征的因子Atad2中被鉴定并测试了活性,其双结构域构型在进化过程中高度保守。在人和小鼠中,Atad2在睾丸中表达最丰富,在小鼠中也是如此。它也在减数分裂后阶段和成熟精子中被检测到。发现AAA-ATPase结构域对于蛋白质多聚化以及通过其溴结构域与乙酰化核小体的高亲和力结合是必需的。该结合被发现对乙酰化组蛋白H4尾部具有特异性,其中乙酰化K5位置起关键作用。体内研究表明,Atad2表现为转录的一般抑制因子,并具有染色质“冻结”活性。最后,我们证明凋亡的诱导导致早期降解
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 0 B。
【主题与分类】
主题标签:Expression profiling by array、GPL1456、9606。本站分类:心血管系统疾病/主动脉瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE12279
【使用注意】
· 源站最后修改于 Oct 16 201,引用时请注意版本时效。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE12279
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
AAA型ATP酶结构域与溴结构域之间的功能性协作已得到证实。这两个结构域在一个尚未被表征的因子Atad2中被鉴定并测试了其活性,该因子的双结构域构型在进化过程中高度保守。在人类和小鼠中,Atad2在睾丸中表达最为丰富,在小鼠中亦然。它也在减数分裂后阶段和成熟精子中被检测到。研究发现,AAA-ATP酶结构域对于蛋白质多聚化及其溴结构域与乙酰化核小体的高亲和力结合是必需的。该结合被证明对乙酰化组蛋白H4尾部具有特异性,其中乙酰化的K5位点发挥关键作用。体内研究表明,Atad2表现为一种通用转录抑制因子,并具有染色质“冻结”活性。最后,我们证明凋亡的诱导导致Atad2的早期降解,这可能通过增加染色质动态来促进凋亡因子的作用。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




