Array_dataset_TS 主动脉瘤 DNA 甲基化数据集
该数据集英文名为 Array_dataset_TS,来源于 omicsdi.org,本站归类为心血管系统疾病下的主动脉瘤

基本信息
资源简介
Array_dataset_TS 主动脉瘤 DNA 甲基化数据集
Array_dataset_TS 是一个以英文名标识的数据集,来源站为 omicsdi.org,在本站分类体系中归属于心血管系统疾病下的主动脉瘤方向。该数据集的主题标签为 Genomics,源站对其的描述为“DNAm Case samples using Illumina Infinium 450K”,表明其内容与 DNA 甲基化(DNAm)的病例样本相关,并采用 Illumina Infinium 450K 平台进行检测。整体来看,该数据集聚焦于主动脉瘤这一心血管系统疾病,从基因组学特别是 DNA 甲基化层面提供样本层面的数据资源,适合用于探索主动脉瘤相关的表观遗传特征。以下将围绕该数据集的背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面展开介绍。
【数据集背景】
主动脉瘤属于心血管系统疾病的重要类型,其发生发展涉及遗传与表观遗传等多层次机制。DNA 甲基化作为一种关键的表观遗传修饰,能够在不大规模改变 DNA 序列的前提下调控基因表达,因而常被用于疾病相关机制研究。Array_dataset_TS 正是在这一背景下出现的数据集,其主题标签为 Genomics,源站描述明确指向 DNAm Case samples,说明该数据集面向的是主动脉瘤相关的病例样本,并借助 Illumina Infinium 450K 平台获取甲基化信息。该数据集在本站被归类于心血管系统疾病 / 主动脉瘤,便于研究者按疾病类别进行检索与整合。
【数据内容】
根据源站描述,该数据集包含的是使用 Illumina Infinium 450K 平台检测的 DNAm 病例样本。Illumina Infinium 450K 是一种常用的甲基化芯片平台,通常可覆盖基因组中大量 CpG 位点的甲基化状态。因此,该数据集的核心内容应为病例样本的 DNA 甲基化检测结果。除上述信息外,关于样本数量、具体位点数量、分组设计、临床变量、数据文件格式等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 omicsdi.org。源站描述指出其样本为 DNAm Case samples,检测平台为 Illumina Infinium 450K。由此可知,数据采集依托于该甲基化芯片平台,样本类型为病例样本。至于样本的具体采集地点、采集时间、伦理审批信息、病例纳入与排除标准等,源站未提供。
【适用场景】
基于其疾病分类与数据内容,Array_dataset_TS 可适用于主动脉瘤相关的表观遗传研究场景,例如探索病例样本中 DNA 甲基化模式的差异、筛选与主动脉瘤可能相关的甲基化位点或区域,以及与其他基因组学数据联合开展整合分析。由于主题标签为 Genomics,该数据集也可用于基因组学范畴下的数据挖掘与比较研究。需要说明的是,上述适用方向是基于该数据集所属疾病领域与检测平台的一般用途而提出的,具体研究问题是否适用,仍需结合源站未提供的样本设计与临床信息加以判断。
【使用方法】
该数据集来源于 omicsdi.org,使用者通常可通过该来源站获取数据集入口或相关说明。由于源站描述仅提及 DNAm Case samples using Illumina Infinium 450K,关于数据下载方式、文件组织、预处理流程、标准化方法以及配套分析工具等,源站未提供。因此,在实际使用前,建议以来源站提供的原始说明为准。
【质量与限制】
该数据集采用 Illumina Infinium 450K 平台,该平台在甲基化研究中应用广泛,但其具体数据质量指标,如探针检出率、样本合格率、批次效应情况等,源站未提供。此外,该数据集仅被描述为 DNAm Case samples,是否包含对照组、样本量大小、人群构成等信息均未说明,这些因素可能影响研究结论的外推与比较。因此,在使用该数据集时,应关注其来源站的最新说明,并注意上述未提供信息所带来的限制。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许再分发等信息,源站未提供。使用者在引用或使用该数据集前,应查阅来源站 omicsdi.org 上的相关说明,以确认具体的引用要求与许可条件。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010001261
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
DNAm Case samples using Illumina Infinium 450K
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