Array_dataset_Male 男性主动脉瘤 DNA 甲基化数据集

该数据集英文名为 Array_dataset_Male,来源于 omicsdi.org,归类于心血管系统疾病下的主动脉瘤

omicsdi
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时间序列分类Genomics
Array_dataset_Male

基本信息

模态
时间序列
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

Array_dataset_Male 男性主动脉瘤 DNA 甲基化数据集

Array_dataset_Male 是一个以英文名称标识的组学数据集,来源于 omicsdi.org。该数据集在分类上归属于心血管系统疾病,并进一步细分为主动脉瘤方向。从源站给出的描述来看,该数据集涉及使用 Illumina Infinium 450K 平台获得的 DNA 甲基化(DNAm)病例样本。其主题标签为 Genomics,表明该数据集的核心内容与基因组学相关。整体而言,该数据集围绕主动脉瘤这一心血管系统疾病,提供了基于 DNA 甲基化芯片检测的病例样本信息,适合用于探索与主动脉瘤相关的表观遗传学特征。以下将依据可获得的信息,对该数据集的背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制以及引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

该数据集归类于心血管系统疾病下的主动脉瘤。主动脉瘤是心血管系统疾病中的一种,通常涉及主动脉壁的异常扩张。该数据集以 Array_dataset_Male 为英文名称,来源于 omicsdi.org,主题标签为 Genomics。源站描述指出,该数据集包含使用 Illumina Infinium 450K 平台获得的 DNAm 病例样本。DNA 甲基化是表观遗传学修饰的一种常见形式,常被用于研究基因表达调控与疾病状态之间的关系。因此,该数据集可能用于从表观遗传学角度考察主动脉瘤病例中的 DNA 甲基化模式。不过,关于该数据集的具体研究背景、样本收集的临床背景、病例与对照的设置等信息,源站未提供。

【数据内容】

根据源站描述,该数据集的内容为 DNAm 病例样本,检测平台为 Illumina Infinium 450K。Illumina Infinium 450K 是一种常用的 DNA 甲基化芯片,能够覆盖基因组中大量 CpG 位点的甲基化状态。该数据集的主题标签为 Genomics,说明其数据内容属于基因组学范畴。数据集英文名为 Array_dataset_Male,其中“Male”可能提示该数据集与男性样本相关,但源站未提供关于性别构成、样本数量、具体检测位点、甲基化 beta 值矩阵、原始信号强度文件或注释文件等详细信息。因此,关于数据内容的具体维度、文件格式、样本分组和临床变量等,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集的来源站为 omicsdi.org。源站描述仅说明其包含使用 Illumina Infinium 450K 获得的 DNAm 病例样本。关于样本采集地点、采集时间、伦理审批信息、受试者招募方式、样本类型(如血液、组织等)、病例定义标准以及是否包含对照样本等,源站未提供。该数据集在分类上属于心血管系统疾病 / 主动脉瘤,主题标签为 Genomics。除上述信息外,没有更多关于采集流程与来源机构的细节可供说明。

【适用场景】

基于现有信息,该数据集可能适用于与主动脉瘤相关的 DNA 甲基化研究,尤其是使用 Illumina Infinium 450K 平台产生的病例样本分析。其主题标签为 Genomics,因此可被用于基因组学或表观基因组学方向的探索性分析。潜在用途可能包括识别主动脉瘤病例中差异甲基化位点、开展甲基化模式聚类、或与其他组学数据整合分析等。然而,由于源站未提供样本量、临床注释、对照设置和具体数据文件,实际适用场景需结合数据下载后的完整说明来判断。任何超出源站描述的具体分析目标或结论均无法从现有信息中确认。

【使用方法】

关于该数据集的具体使用方法,源站未提供。通常,使用 Illumina Infinium 450K 数据可能涉及甲基化信号预处理、背景校正、探针过滤、标准化、beta 值或 M 值计算以及下游统计分析等步骤,但这些属于该平台的通用分析流程,并非该数据集特有的使用说明。该数据集的文件组织方式、下载格式、是否提供预处理数据或原始 IDAT 文件、是否附带样本注释表和分析脚本等,源站均未提供。因此,无法给出针对该数据集的具体操作指南。

【质量与限制】

该数据集的质量信息,如样本质量评估、探针检出率、批次效应控制、技术重复情况等,源站未提供。其限制方面,由于源站描述仅提及 DNAm 病例样本,未说明是否包含对照组、样本量大小、年龄与性别分布、合并症信息或随访数据,因此无法评估其统计效力与适用范围。此外,数据集英文名中的“Male”是否意味着仅包含男性样本,源站未明确说明。该数据集归类于主动脉瘤,但源站未提供疾病亚型、严重程度或治疗状态等信息。因此,在使用该数据集时,应注意到这些未提供的信息可能带来的解释限制。

【引用与许可】

关于该数据集的引用方式与许可条款,源站未提供。使用者如需引用或使用该数据集,应参考 omicsdi.org 上该数据集条目所附带的原始说明。由于源站未提供具体的许可协议、使用限制或所需致谢格式,无法在此给出确切的引用与许可信息。

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使用方式

数据集获取

源站:https://omicsdi.org/dataset/ega/EGAD00010001260

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

DNAm Case samples using Illumina Infinium 450K

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