phs000636:家族性颅内动脉瘤(FIA I-II)研究全外显子组测序

该数据集为 phs000636,即家族性颅内动脉瘤(FIA I-II)研究的全外显子组测序数据,来源于 NCBI 的 dbGaP 数据库,属于家族(Family)研究

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基因组分类Family
phs000636: Whole Exome Sequencing for Familial Intracranial Aneurysm (FIA I-II) Study

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

phs000636:家族性颅内动脉瘤(FIA I-II)研究全外显子组测序

phs000636 是家族性颅内动脉瘤(Familial Intracranial Aneurysm,FIA I-II)研究的全外显子组测序数据集,收录于 NCBI 的 dbGaP 数据库。该数据集在分类上归属于心血管系统疾病中的动脉瘤方向,研究设计以家族为单位,主题标签为 Family。其核心内容围绕家族性颅内动脉瘤这一疾病展开,通过全外显子组测序手段获取相关样本的外显子区域遗传信息,用于支持家族聚集性颅内动脉瘤的遗传学研究。数据集名称中的 FIA I-II 提示其对应家族性颅内动脉瘤研究的两个阶段或两个组成部分,整体定位为面向家族研究的测序数据资源,可供具备相应权限的研究人员用于遗传学与疾病机制方向的探索。

【数据集背景】

颅内动脉瘤是心血管系统疾病中较为重要的一类病变,而家族性颅内动脉瘤则强调疾病在家族中的聚集现象。phs000636 正是围绕这一疾病类型建立的研究数据集,其英文全称明确指向“家族性颅内动脉瘤(FIA I-II)研究”的全外显子组测序。该数据集来源于 NCBI 的 dbGaP 数据库,属于以家族为单位的 study。dbGaP 作为遗传学与表型数据的重要归档平台,通常承载与人类遗传变异、疾病表型相关的数据资源,phs000636 即为其一。数据集的主题标签为 Family,说明家族结构在该研究中具有核心地位,研究关注的是家族性颅内动脉瘤在家族背景下的遗传特征,而非散发性或无关个体构成的队列。

【数据内容】

该数据集的内容为全外显子组测序数据,针对家族性颅内动脉瘤(FIA I-II)研究而生成。全外显子组测序的目标区域是基因组中的外显子部分,即蛋白编码区域及其邻近剪接相关区域,因此该数据集所包含的遗传信息主要集中在外显子层面。数据集以家族为组织单位,主题标签为 Family,表明样本之间存在家族关系,数据可用于在家族内部考察遗传变异的传递与分离情况。数据集名称中的 FIA I-II 表明其覆盖家族性颅内动脉瘤研究的两个阶段或两个部分,但关于具体样本数量、测序深度、覆盖度、变异位点数目、家族数目等细节,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI 的 dbGaP 数据库,源站描述其为 dbGaP study,研究类型为 Family。其英文名称为 phs000636: Whole Exome Sequencing for Familial Intracranial Aneurysm (FIA I-II) Study,本站分类为心血管系统疾病 / 动脉瘤。除上述来源与分类信息外,关于样本采集地点、采集时间、招募方式、伦理审批信息、测序平台、建库方法等具体采集细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于家族性颅内动脉瘤的遗传学研究场景,尤其是基于全外显子组测序数据开展的家族聚集性分析。研究人员可在获得相应授权的前提下,利用该数据集探索家族性颅内动脉瘤相关的遗传变异,例如在家族内部进行变异筛查、共分离分析或候选基因评估。由于主题标签为 Family,该数据集也适合用于以家系为单位的遗传模式研究,以及心血管系统疾病中动脉瘤方向的遗传背景探索。此外,该数据集可作为家族性颅内动脉瘤研究领域的参考数据资源,用于与其它队列或数据集进行比较性分析。但具体适用场景应结合数据访问权限与研究设计加以判断,源站未提供更详细的适用建议。

【使用方法】

该数据集托管于 NCBI 的 dbGaP 数据库,通常需通过 dbGaP 的数据访问流程获取。研究人员一般需要提交数据访问申请,经相应数据访问委员会审批后方可获得受控访问权限。获得权限后,可按照 dbGaP 提供的下载与使用规范获取全外显子组测序数据及相关文件。由于该数据集属于家族研究,使用时应充分考虑家族结构与样本间亲缘关系,在分析中采用适合家系数据的统计遗传学方法。关于具体的文件格式、下载工具、分析流程与操作步骤,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为 dbGaP 收录的家族研究数据,其质量与限制的具体信息源站未提供。使用时应关注全外显子组测序本身的覆盖范围局限,即主要覆盖外显子区域,对非编码区、深内含子区及结构变异的检测能力有限。同时,家族性研究的数据在样本量、家族数目与人群代表性方面可能存在限制,具体程度源站未提供。数据访问受 dbGaP 受控访问政策约束,未经授权不得使用。关于数据质控指标、缺失率、批次效应等技术性质量信息,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,属于 dbGaP 数据库中的 phs000636 研究。使用该数据集时,应遵循 dbGaP 的引用规范与数据使用协议,通常需在发表成果中引用对应的 dbGaP 研究编号及原始研究。数据许可与使用条款由 dbGaP 及相关数据访问委员会规定,具体许可类型、使用限制与引用格式,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/projects/gap/cgi-bin/study.cgi?study_id=phs000636

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

dbGaP study (Family).

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