人内皮细胞暴露于凝血酶2或6小时的转录谱分析

内皮细胞暴露于凝血酶(5 IU/ml)两次(2 和 6 小时),并与相同时间段未处理的细胞进行比较。主题标签:心血管系统疾病、急性冠脉综合征、内皮细胞、凝血酶、转录谱分析、基因表达

omicsdi
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时间序列分类心血管系统疾病急性冠脉综合征内皮细胞凝血酶转录谱分析基因表达
Transcription profiling of human endothelial cells exposed to thrombin for 2 or 6 hours

基本信息

模态
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分类
创建/更新时间
2026-10-08

资源简介

人内皮细胞暴露于凝血酶2或6小时的转录谱分析

该数据集聚焦于凝血酶刺激下的人内皮细胞转录谱变化,旨在通过基因表达层面的检测,揭示内皮细胞在凝血酶作用不同时间点后的分子响应特征。研究将内皮细胞暴露于 5 IU/ml 的凝血酶中,分别处理 2 小时和 6 小时,并与相同时间段内未处理的细胞进行对照比较。数据集归属于心血管系统疾病与急性冠脉综合征方向,主题涉及内皮细胞、凝血酶、转录谱分析及基因表达。通过这一设计,研究者可以观察凝血酶短期刺激对内皮细胞转录活动的影响,并比较不同暴露时长下基因表达模式的差异,为理解凝血相关刺激下内皮细胞功能变化提供转录层面的数据基础。

【数据集背景】

内皮细胞是血管内壁的重要组成部分,参与维持血管稳态、调节凝血与抗凝平衡、控制血管通透性以及介导炎症反应等过程。凝血酶不仅是凝血级联反应中的关键酶,也可通过激活内皮细胞表面的相关受体,影响内皮细胞的基因表达和功能状态。在急性冠脉综合征等心血管系统疾病中,凝血酶生成增加、内皮细胞活化与血栓形成风险密切相关。因此,在体外条件下观察人内皮细胞暴露于凝血酶后的转录谱变化,有助于从基因表达角度理解内皮细胞在凝血酶刺激下的早期和稍晚阶段响应。该数据集以 2 小时和 6 小时两个时间点为核心,比较凝血酶处理与未处理细胞之间的转录差异,属于心血管系统疾病与急性冠脉综合征相关的基础研究数据。

【数据内容】

数据集的核心内容是转录谱分析结果,即对人内皮细胞在凝血酶处理与未处理条件下进行基因表达层面的检测。实验设置包括两个处理时间点:2 小时和 6 小时。处理组细胞暴露于 5 IU/ml 凝血酶,对照组则为相同时间段内未处理的细胞。通过比较处理组与对照组,可以识别在不同暴露时长下表达发生变化的基因或转录本。该数据集的主题标签包括心血管系统疾病、急性冠脉综合征、内皮细胞、凝血酶、转录谱分析和基因表达,说明其内容围绕内皮细胞在凝血酶刺激下的转录活动展开。关于具体检测平台、样本数量、基因数量、差异表达基因列表、统计阈值及原始数据文件格式等信息,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 omicsdi.org。根据源站描述,内皮细胞被暴露于凝血酶(5 IU/ml)两次,分别为 2 小时和 6 小时,并与相同时间段未处理的细胞进行比较。数据集英文名称为“Transcription profiling of human endothelial cells exposed to thrombin for 2 or 6 hours”。本站将其归类于心血管系统疾病 / 急性冠脉综合征。关于样本采集的具体来源、细胞类型细分、供体信息、培养条件、实验重复次数、测序或芯片平台、数据处理流程等,源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于与内皮细胞生物学、凝血酶信号传导、心血管系统疾病及急性冠脉综合征相关的转录水平研究。潜在使用场景包括:分析凝血酶刺激后内皮细胞基因表达的时间依赖性变化;比较 2 小时与 6 小时两个时间点之间转录响应的异同;筛选可能参与内皮细胞活化、凝血调控或血管炎症反应的候选基因;将本数据集的表达模式与其他内皮细胞相关转录谱数据进行比较;为后续实验设计提供假设来源,例如选择特定基因进行验证或机制研究。此外,该数据集也可用于教学或方法学示例,展示处理组与对照组在短时间暴露实验中的转录谱比较思路。关于具体分析工具、标准化方法或统计模型,源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时,可围绕处理组与对照组的比较展开分析。基本思路是将 2 小时凝血酶处理组与 2 小时未处理对照组进行比较,将 6 小时凝血酶处理组与 6 小时未处理对照组进行比较,从而获得两个时间点下凝血酶相关的转录变化。进一步可以比较 2 小时与 6 小时处理组之间的表达模式差异,以观察时间因素对转录响应的影响。若进行差异表达分析,需要根据数据实际格式选择相应流程,例如数据预处理、归一化、差异检验和多重检验校正等。关于该数据集的具体文件结构、下载方式、数据格式、是否提供原始数据或仅提供处理后的表达矩阵,以及是否有配套分析代码,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的设计明确包含两个凝血酶暴露时间点及对应未处理对照,便于进行时间点内的处理与对照比较。然而,关于样本量、重复次数、细胞来源一致性、实验批次效应、测序深度或芯片探针覆盖情况、数据质量控制指标等信息,源站未提供。因此,在解释结果时应注意缺乏这些元数据可能带来的不确定性。该数据集仅涉及体外内皮细胞暴露于 5 IU/ml 凝血酶的转录谱变化,不能直接等同于体内急性冠脉综合征的复杂病理过程。此外,转录谱变化并不必然直接对应蛋白质水平或功能改变,后续结论仍需实验验证。关于数据是否存在已知偏差、缺失值处理方式或标准化细节,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 omicsdi.org,英文名称为“Transcription profiling of human endothelial cells exposed to thrombin for 2 or 6 hours”。关于该数据集的正式引用格式、原始提交者、关联文献、DOI、访问链接、许可协议及使用限制,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据集前,应自行查阅来源站点的相关说明,并遵循其适用的引用与许可要求。

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源站:https://omicsdi.org/dataset/biostudies-arrayexpress/E-MEXP-952

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

内皮细胞分别暴露于凝血酶(5 IU/ml)中两次(2小时和6小时),并与相同时间段内未处理的细胞进行比较。

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