外周血管疾病PBMC miRNA表达数据
该数据集为外周血单核细胞(PBMC)的miRNA原始读数,采用Ion Torrent S5 XL平台RNA测序获得,样本来自40例下肢动脉疾病(LEAD)患者、28例腹主动脉瘤(AAA)患者和34例慢性静脉疾病(CVD)患者

基本信息
资源简介
外周血管疾病PBMC miRNA表达数据
miRNA expression data
该数据集为外周血单核细胞(PBMC)的miRNA原始读数,采用Ion Torrent S5 XL平台RNA测序获得,样本来自40例下肢动脉疾病(LEAD)患者、28例腹主动脉瘤(AAA)患者和34例慢性静脉疾病(CVD)患者。数据以单一Excel文件提供,属于心血管系统疾病/腹主动脉瘤主题,包含miRNA、NGS、血管疾病、生物标志物等标签。可用于外周血管疾病相关的miRNA表达分析、生物标志物筛选及分类建模研究,使用需引用原论文(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2022-03-29。
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 1.26 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.19446851.v2。
【主题与分类】
源站学科分类:Medical biochemistry and metabolomics not elsewhere classified、Medical genetics (excl. cancer genetics)。主题标签:miRNA、NGS、vascular diseases、Biomarkers、Medical Genetics (excl. Cancer Genetics)。本站分类:心血管系统疾病/腹主动脉瘤。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Medical biochemistry and metabolomics not elsewhere classified、Medical genetics (excl. cancer genetics)。
【获取与许可】
源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Expression_data_figshare_xlsx/19446851
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Zalewski, Daniel (2022). miRNA expression data. figshare. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2022-04-05,引用时请注意版本时效。
下载信息
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数据集获取
源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19446851.v2
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 1.3 MB。
数据说明
MicroRNA原始读数计数来源于对40例下肢动脉疾病(LEAD)患者、28例腹主动脉瘤(AAA)患者和34例慢性静脉疾病(CVD)患者采集的PBMCs样本进行RNA测序(Ion Torrent S5 XL平台)。该数据集是为论文《miRNA Regulatory Networks Associated with Peripheral Vascular Diseases》(作者:Daniel P. Zalewski、Karol P. Ruszel、Andrzej Stępniewski、Dariusz Gałkowski、Marcin Feldo、Janusz Kocki和Anna Bogucka-Kocka)生成的。如果您使用该数据集,请引用我们的论文。文献信息将在我们的论文发表后提供。如需进一步信息,请通过电子邮件与我联系:daniel.zalewski@umlub.pl
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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