外周血管疾病PBMC miRNA表达数据

该数据集为外周血单核细胞(PBMC)的miRNA原始读数,采用Ion Torrent S5 XL平台RNA测序获得,样本来自40例下肢动脉疾病(LEAD)患者、28例腹主动脉瘤(AAA)患者和34例慢性静脉疾病(CVD)患者

figsharefigshare
datacite
2022-04-05 更新
浏览 16
基因组分类miRNANGSvascular diseasesBiomarkersMedical Genetics (excl. Cancer Genetics)
miRNA expression data

基本信息

模态
基因组
大小
0.001264742 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2022-04-05
版本
v2

资源简介

外周血管疾病PBMC miRNA表达数据

miRNA expression data

该数据集为外周血单核细胞(PBMC)的miRNA原始读数,采用Ion Torrent S5 XL平台RNA测序获得,样本来自40例下肢动脉疾病(LEAD)患者、28例腹主动脉瘤(AAA)患者和34例慢性静脉疾病(CVD)患者。数据以单一Excel文件提供,属于心血管系统疾病/腹主动脉瘤主题,包含miRNA、NGS、血管疾病、生物标志物等标签。可用于外周血管疾病相关的miRNA表达分析、生物标志物筛选及分类建模研究,使用需引用原论文(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2022-03-29。

【数据结构与技术规格】

文件数 1 个,合计 1.26 MB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.19446851.v2。

【主题与分类】

源站学科分类:Medical biochemistry and metabolomics not elsewhere classified、Medical genetics (excl. cancer genetics)。主题标签:miRNA、NGS、vascular diseases、Biomarkers、Medical Genetics (excl. Cancer Genetics)。本站分类:心血管系统疾病/腹主动脉瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medical biochemistry and metabolomics not elsewhere classified、Medical genetics (excl. cancer genetics)。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/Expression_data_figshare_xlsx/19446851

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Zalewski, Daniel (2022). miRNA expression data. figshare. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2022-04-05,引用时请注意版本时效。

官方服务

专家保障全链路合规授权与标注交付

陕川双基地 × 超十家三甲医院直连

从合规授权、采集治理、专业标注到数据集交付,我们提供全链路闭环服务,让高质量临床数据即拿即用。

⚡️ 需要原始数据或标注支持?联系我们获取定制方案。

帮我联系

下载信息

注册下载

需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。

暂未开放

公开下载

无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。

免登录

有偿下载

公开数据集受托下载与技术交付服务。

提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)

暂未开放

当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。

使用方式

数据集获取

源站:https://doi.org/10.6084/m9.figshare.19446851.v2

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 1.3 MB。

数据说明

MicroRNA原始读数计数来源于对40例下肢动脉疾病(LEAD)患者、28例腹主动脉瘤(AAA)患者和34例慢性静脉疾病(CVD)患者采集的PBMCs样本进行RNA测序(Ion Torrent S5 XL平台)。该数据集是为论文《miRNA Regulatory Networks Associated with Peripheral Vascular Diseases》(作者:Daniel P. Zalewski、Karol P. Ruszel、Andrzej Stępniewski、Dariusz Gałkowski、Marcin Feldo、Janusz Kocki和Anna Bogucka-Kocka)生成的。如果您使用该数据集,请引用我们的论文。文献信息将在我们的论文发表后提供。如需进一步信息,请通过电子邮件与我联系:daniel.zalewski@umlub.pl

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据缺失?

依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。

⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。

获取专属数据定制方案