信息速览
PARSE 2022 是 2022 年随 MICCAI 举办的首个肺动脉分割挑战赛及其配套数据集,全称 Pulmonary Artery Segmentation Challenge 2022,缩写取自 Pulmonary、ARtery、SEgmentation 三个词。它提供约 200 例增强 CT 肺动脉造影体数据与逐体素的肺动脉掩膜,训练集 100 例带标签、公开验证集 30 例只有图像、封闭测试 73 例从未公开,赛题要求同时在主干与分支处达到可用精度,并把推理时间与显存计入排名。影像来自中国四家医院,SIEMENS 与 PHILIPS 两家设备。
它补的是一个此前没有公开大规模基准的空缺。肺动脉形态个体差异极大,管径从二十余毫米一路收窄到接近体素尺寸,标注成本高、公开数据稀缺,算法之间无从比较。已有 CT 血管数据多集中在冠脉、主动脉与脑血管,肺动脉被顺带标注,而顺带标注的分支往往更不完整。PARSE 把这个空白单独立题,把主干与分支分别打分并给分支八成权重,把研究焦点从容易的主干拉到困难的小分支,同时用效率约束提醒使用方:能进临床的不只是精度。
上手前先确认三件事。能拿到标注的只有一百例,验证集只有图像;标签只有肺动脉一类,肺静脉没有对应类别,需要动静脉分离的课题要另找数据;获取方式偏协议而非标准开源许可,条款要读原文。做方法研究可以直接在训练集与验证集上跑通基线;做临床落地则要先评估单一人群、单一设备谱系带来的偏差。
§1 它是什么
1.1 一句话定位与名称来历
PARSE 的缩写取自三个词:Pulmonary、ARtery、SEgmentation,中文即「肺动脉分割」。命名方式是把「肺」与「动脉」合在一起构词,因此 PAR 这一段在字形上是「动脉」的缩写,而非独立的单词。这一点值得先说明,因为以「parse」检索时,搜索引擎给出的结果大量指向编程中的语法解析,与成像毫无关系。真正能定位到该资源的检索词是完整全称,或者域名里的 parse2022。
官网首页给这一定位加了一句时间限定:这是 MICCAI 2022 上的首个肺动脉分割挑战赛。首个这个措辞出自组织方自述,指的是以「肺动脉」为单一对象的公开挑战赛此前没有先例;与之相邻的脑血管、冠脉、主动脉赛事各有先例,但都不是肺动脉。
1.2 挑战赛的组织与分工
组织方是哈尔滨工业大学计算学部的感知计算中心,通讯作者 Gongning Luo 后来转到阿卜杜拉国王科技大学,另一名核心作者 Kuanquan Wang 是该中心主任。团队的研究方向是心血管与肺血管的影像计算,除 PARSE 之外还组织了脑动脉等其他血管类挑战赛。
临床端由哈尔滨医科大学及其附属第四医院放射科承担,负责扫描协议、标注专家调度与标签仲裁。企业端有黑龙江拓盟科技参与影像处理。这套分工在官网的参与页与论文作者列表中可以直接对上:作者名单里既有工科的影像算法研究者,也有放射科医师,还有标注与工程支持人员,总数近三十人,这在挑战赛论文里属于偏大的规模,反映的是标注环节投入的人力。
1.3 数据从哪来
这一条是转述中最容易出错的地方,因为官网与论文的说法不一致。
官网数据页写的是:这些 CTPA 数据取自哈尔滨医科大学的一台双源 64 层 CT 扫描仪,地点在哈尔滨。这句话只提了一台设备和一所学校。
挑战赛总览论文的数据一节写的是另一套:影像来自四家中心,分别是哈尔滨医科大学附属肿瘤医院、中国人民解放军总医院、牡丹江医学院红旗医院、佳木斯大学附属第一医院,设备来自 SIEMENS 与 PHILIPS 两家厂商。论文的 Table 1 还按厂商给了每组的数量,训练组 81 例来自 SIEMENS、16 例来自 PHILIPS。
两种说法并不互相否定,而是时间上的一前一后:官网那段文字是 2022 年赛期写的,当时对外发放的首批数据来自单一设备;论文是赛后整理,把全部四中心的数据都统计进来了。使用时应以论文的四中心说法为准,官网的「一台设备」是发布初期的描述,已被后续材料覆盖。
1.4 版本与发布链
PARSE 的对外形态可以分成四个节点,理解这四个节点的差别,就能判断手上的包是哪一版。
第一个是 2022 年 4 月 6 日发放的训练集。此时只有 100 例带标签数据,获取方式是填表并签署协议后由组织方邮件发送下载链接。
第二个是 2022 年 7 月 15 日补发的验证集,30 例,只有图像没有标签,验证榜随之开放。同年 7 月 19 日官网发布公告,把验证提交截止从 7 月 20 日延到 7 月 31 日,并把 docker 与技术短文的提交窗口从 7 月 20 日推到 8 月 7 日。这两次延期是赛中唯一的日程调整。
第三个是 2023 年 2 月 1 日的公告,训练集与验证集继续对后续研究者开放,协议签署与邮件申请的要求不变。这一阶段的数据获取仍是「人审」。
第四个是 2025 年 9 月 10 日的变化,官网把训练集与验证集的下载链接直接列在数据页上,提供 Google Drive 与百度网盘两套入口;9 月 20 日又补一条公告,称全部训练与验证数据已公开免费。值得注意的是,同一页面下方那段 2023 年的协议要求文字并未删除,仍写着「签署文件发至 PARSE2022@hotmail.com,收到协议后才发下载链接」。新旧两种获取说明并列,是这份数据集当前最需要留意的一处不一致。
封闭测试的 70 例(论文写作 73 例)自始至终没有公开,官方的说法是避免泄露测试集分布、保证终榜公平。
1.5 与相邻数据集的分界
肺动脉方向上的公开数据不多,容易被混淆的有三类。
第一类是肺血管的动脉静脉联合标注,代表是同一课题组后来发表的 HiPaS,标注量 1073 例,含 315 例 CTPA 与 758 例非增强 CT,并在 Zenodo 上单独发布。它与 PARSE 同源,但标签从一类变成动脉静脉两类,任务性质不同,不能互相替代。
第二类是肺栓塞相关的 CTPA 数据。这类数据的临床目标是检出栓子,标注对象是血栓而非血管,常见形态是报告标签或病例级分类标签,与体素级管腔掩膜是两回事。
第三类是肺气道树、肺实质病灶分割。它们与肺动脉同样是胸部 CT 上的「树状结构」或「病灶」,方法层面有借鉴价值,但解剖对象不同,不能直接当外部验证集。
判据很简单:看标签是否有体素级的「1 = 肺动脉」。如果只有分类标签或框,或者类别里同时有动脉与静脉,那就不是 PARSE。
§2 数据构成
2.1 规模:三个数字需要同时记住
把规模说清楚,要同时给出三组数字,每一组回答不同的问题。
第一组是总例数。官网写 200 个 3D 体数据,论文的 Table 1 按划分列出 100、30、73,合计 203。两个数字都出现在一手材料里,差别来自统计时点:官网那句是 2022 年赛期发布的描述,论文是赛后完整核查的结果。三个子集之和恰好等于 203,说明论文的分组表是内部自洽的,200 更像是一个取整的宣传数字。写作引用时,保守做法是「约 200 例,论文细分合计 203 例」。
第二组是划分。训练 100 例、公开验证 30 例、封闭测试 70 或 73 例。组织方在官网解释过为什么这样分:训练集要大,是为了训练出稳健的模型;公开验证集要小,既能保证验证程序在不同队伍间可比,又能避免泄露测试集的分布;测试集要大,是为了让终榜有足够的统计稳定性。这套 100 比 30 比 73 的比例,在医学影像挑战赛中属于偏重测试、验证偏少的一种。
第三组是真正可获取的量。带标签的是 100 例,公开能下载的图像是 130 例,其余从未放出。任何声称「PARSE 有 200 例标注」的说法都是错的,因为其中一半以上的标签不在公开范围内。
2.2 病例与采集
论文的 Table 1 给出了三个子集的人口学描述,这些数字用途在于判断人群构成,不在临床推理。
训练集 100 例,女性 79、男性 21,年龄 29 至 71 岁,均值 56.3 岁,切片厚度 1 mm,切片数 228 至 390,均值为 303,像素间距 0.5039 至 0.9238 mm。验证集 30 例,女性 25、男性 5,年龄 29 至 70 岁,均值 54.2 岁,切片数 228 至 397,均值 295,像素间距 0.5469 至 0.7891 mm。测试集 73 例,女性 52、男性 21,年龄 23 至 73 岁,均值 54.4 岁,切片数 229 至 408,均值 312,像素间距 0.5039 至 0.8770 mm。
三点值得记住。
第一,三个子集的女性占比都高,训练集接近八成。这与肺动脉疾病在一般人群中的性别分布未必一致,用它训练出的模型在男性为主的队列上表现如何,数据本身给不出答案。
第二,年龄跨度大,从 23 岁到 73 岁,不再是单一的老年人群。但均值集中在五十四到五十六岁之间,说明分布并不均匀,极端年轻与极端年老的病例数量少。
第三,切片数和像素间距都有明显波动,说明数据没有重采样到统一空间。这一点直接影响实验设计:必须自己完成重采样,不能假设所有体数据共享同一物理尺度。
2.3 标注协议
标注流程在论文中有完整描述,分五步。
第一步调窗。放射科专家先调整窗宽窗位,让肺动脉的对比剂充盈区在灰阶上显现清楚,这一步是后续区域生长能否收敛的前提。
第二步选种子。专家在主干与主要分支上逐一放置种子点,每放一批就跑一次区域生长,得到粗掩膜。种子点的选择是人工的、迭代的,漏掉的段落要回头补。
第三步精修。区域生长的结果在血管壁边界处往往溢到邻近组织,专家要逐层修掉溢出、补上断开的部分。这一层工作量最大,也是单个病例标注耗时的主要来源。
第四步互检。同一例的多份标注由专家之间相互检查,发现明显分歧就回到原层重新判读。
第五步投票。每一例由 5 名专家各自完成,最终标签按投票合并。论文写明专家共 10 人,分两组每组 5 人,每一例由其中一组 5 人分别标注。投票规则的具体实现(逐体素多数票还是逐区块表决)论文没有展开,但结果是一个二值掩膜,说明最终仍要收敛成 0 与 1。
这套流程的关键在「半自动」三个字。区域生长让主干与较粗的分支能被快速填满,但末梢细支的连通性一旦中断,算法无法自己接回去,只能靠人补。所以在标注质量上,粗管径处可靠、细管径处依赖个别专家的耐心,这是逐例差异的主要来源。
2.4 标签体系:只有一类
标签值只有两个:0 表示背景,1 表示肺动脉。这是人体解剖学意义上极简的标注,代价是无法做任何部位细分。
由此带来四个直接后果。
其一,主干与分支在标签里没有区别。赛题的「多级」评估不是靠标签分级实现的,而是靠几何划分实现的:把肺区内部算作一级,肺区外部算作二级,主干落在肺区外,分支落在肺区内。肺区的界定在测试阶段由金标准上手工放置的立方框完成,框住肺动脉干,同位置的框裁切参赛输出,再分别计算两部分的重合度。这意味着「主干」与「分支」的分界线并非解剖学意义上的精确划分,而是框内框外的近似。
其二,肺动脉与肺静脉在标签里没有区别。CTPA 的对比剂充盈期,肺动脉与肺静脉都会显影,图像上两者在肺门附近贴得很近。标注要求专家把静脉排除在外,但标签本身不给出排除的依据。模型学到的是「哪块是高密度的树状结构」,遇到静脉明显显影的病例,是否仍能守住边界,取决于训练集里这类病例的覆盖度。
其三,无法做左右区分。左肺动脉与右肺动脉在标签里是同一个前景类,评估时不区分左右,因此无法用这份数据评估「一侧分支弱」这类偏差。
其四,无法计入肺动脉内的病变。栓子、钙化、管壁增厚在掩膜里不构成独立类别,管腔内的充盈缺损会被标成背景还是血管,取决于标注者的判读,论文未作规定。
2.5 文件结构与读取
训练集按病例编号分目录,每个病例下两个子目录:image 存放原始 CTPA 的 .nii.gz,label 存放对应掩膜。编号形如 PA000005、PA000317,不是连续的自然数,说明编号来自原始档案系统而非重新编排。
公开验证集是一个平铺目录,直接放 .nii.gz 文件,没有子目录,也没有标签目录。
由于没有随包发布的方向与空间说明,读取时必须自己核对 affine。NIfTI 的方向编码在不同厂商、不同后处理流程下可能不同,若直接把 image 与 label 各自读入而不对齐,会出现掩膜与图像镜像或旋转的情况。稳妥做法是先读 image 的 affine,再校验 label 的 affine 与之逐项一致,不一致则按轴翻转或重采样校正。
包内不含患者人口学表、不含 DICOM 原始数据、不含扫描协议元数据,因此病例级别名与论文 Table 1 中的年龄、性别、厂商无法一一对应。这意味着按性别或厂商做分层分析时,只能使用整体统计量,无法做子组划分。
2.6 场强之外的成像参数
CTPA 的关键成像参数在官网与论文中给出的都很有限,散见于各处。
平面分辨率 512×512,这是重建矩阵而非探测器物理尺寸。像素间距 0.5039 至 0.9238 mm,跨度接近两倍,意味着同一批数据里既有高分辨率重建也有较粗的重建。层厚统一为 1 mm,层间距未单独说明,按常规理解应等于层厚,但数据中没有元数据可核实。
对比剂使用与注射速率、扫描时相(肺动脉期还是主动脉期)、管电压与管电流,这些在官网与总览论文中都没有给出。这些参数的缺失直接影响两件事:一是无法判断哪些病例属于对比剂充盈不足、容易与静脉混淆;二是无法在复现实验里对齐预处理,例如常见的窗宽窗位设定就没有官方基准。
2.7 字段可靠性表
| 字段 | 取值 | 可靠性 | 说明 |
|---|---|---|---|
| 总例数 | 200 或 203 | 双口径 | 官网与论文并存,论文内部自洽 |
| 训练 / 验证 / 测试 | 100 / 30 / 70 或 73 | 双口径 | 测试集数字两版不同 |
| 切片数范围 | 228–376 或 228–408 | 双口径 | 官网上限 376,论文上限 408 |
| 层厚 | 1 mm | 依论文明确 | 三子集一致 |
| 像素间距 | 0.50–0.95 mm | 依论文明确 | 各子集略有差别,见 2.2 |
| 平面矩阵 | 512×512 | 依论文明确 | 全库统一 |
| 标注值 | 0 背景 / 1 肺动脉 | 依论文明确 | 单类,无子类 |
| 标注格式 | .nii.gz | 依论文明确 | 无 DICOM 原始 |
| 患者标识 | 病例编号 | 依论文明确 | 不含人口学表 |
| 伦理与知情同意 | 回顾性豁免 | 依论文明确 | 见 Nat Commun 方法节 |
| 采集中心数 | 1 或 4 | 双口径 | 官网写单设备,论文写四中心 |
| 对比剂与扫描时相 | 未披露 | 未披露 | 影响动静脉混淆的判断 |
§3 怎么拿到
3.1 下载路径
当前有两条并行的路径,选哪条取决于需要什么。
路径一是官网数据页上直接给出的链接:训练集放在 Google Drive 与百度网盘,验证集同样两个入口。2025 年 9 月 10 日的公告写明「数据集现在可以免费下载」,9 月 20 日又补充「全部训练与验证数据已公开免费」。这是最省事的路径,适合先跑基线、先看数据结构。
路径二是页面下方的旧流程:点击 Join、填写在线登记表、把签名后的协议文件发到指定邮箱,收到回复后才拿到链接。这套流程在 2023 年 2 月 1 日的公告里仍有完整描述。协议文件的托管地址在组织方的 GitHub 仓库里,文件名是 PARSE2022_agreement,可以公开查看。
两条路径的分歧在于协议的约束力。走路径一,协议文本仍附在页面上,签署义务是否随之失效,官方未作说明;走路径二,协议是获取的前置条件,签署记录留在组织方处。对准备把数据用到产品中、或者在成果里声明数据来源的团队,建议仍按路径二走一遍,留下可追溯的申请记录,避免日后无法说明数据取得方式。
如果研究涉及动脉静脉分割或解剖学分析,官网另有一段说明:需要填写登记表并发送签名文件,注明数据用途,组织方会另外发送完整数据集的链接。这段文字暗示存在一个比公开包更大的版本,但其规模、内容与是否仍在发放,官网没有说明。
3.2 许可与合规
先给结论:这份数据没有 SPDX 许可名。官网没有写 CC BY、CC BY-NC 或任何标准许可标识,唯一的约束来源是那份协议文件与官网的 Data Access Rules 段落。
这一点在引用时必须写清楚。把 PARSE 写成「CC BY 4.0」或「知识共享署名」都是错的,那些名字在任何一个一手来源里都找不到。挑战赛总览论文本身以 arXiv 预印本形式发布,论文的许可与数据的许可不是一回事,不能互相顶替。
协议文件的名称已给出,但具体条款文本没有在官网正文里复述。可判断的边界有两条:其一,签署者需要声明数据用途,说明是用于动脉静脉分割还是解剖学研究,这意味着使用目的受登记;其二,数据来自医院回顾性扫描,患者层面不提供同意书,Nat Commun 的方法节写的是「回顾性研究豁免知情同意,数据已匿名化并系统性去除敏感隐私信息」。后一条是伦理层面的合规依据,不是使用许可。
实践中的做法是:下载前把协议文件下载下来逐条读,重点看三处,是否允许商用,是否允许二次分发或再发布衍生数据集,是否要求成果引用特定文献。三处都没有明写时,按最保守理解处理,即仅限研究用途、不转发原始影像。
3.3 引用要求
官网在数据页顶部单独放了一段 Notice,要求使用该数据集的人引用两篇文献,这一要求写得比多数挑战赛更明确。
第一篇是挑战赛总览:Luo Gongning 等,Efficient automatic segmentation for multi-level pulmonary arteries: The PARSE challenge,arXiv 编号 2304.03708。这篇交代了赛制、指标、参赛情况与前十名的成绩。
第二篇是发表在 Nature Communications 的论文:Chu Yuetan、Luo Gongning、Zhou Lin 等,Deep learning-driven pulmonary artery and vein segmentation reveals demography-associated vasculature anatomical differences,卷 16、文章号 2262、2025 年,DOI 为 10.1038/s41467-025-56505-6。这篇交代了标注方法、HiPaS 方法与更大规模的队列。
第二篇容易被误引成「PARSE 的数据论文」。严格说,它是方法论文,其中的标注流程正是 PARSE 这套数据的标注流程,但它的数据集规模是 1073 例,与 PARSE 的 203 例不是同一批。引用时若只写第二篇,读者会以为用的是 1073 例的数据。
3.4 上手检查清单
拿到包之后,按以下顺序做六件事,可以省掉后面大量返工。
第一,列出全部病例编号,核对该子集数量是 100 还是 30,并检查编号是否有重复。
第二,随机抽三例,读 image 与 label 的 affine,确认二者矩阵元素逐项相等。不相等时先解决对齐,再谈训练。
第三,统计每例的前景体素数,画出直方图。分布若出现极端小值,说明该例几乎没标到血管,应标记为可疑样本。
第四,检查前景掩膜是否与血管位置吻合。做法是把掩膜叠加到图像上,看高密度树状结构是否被完全覆盖。若掩膜边界明显超出管腔,说明区域生长溢出未修净。
第五,用体素间距换算物理体积,与常见成人肺动脉树的体积量级对照。明显偏离时优先怀疑 affine 的单位。
第六,把图像与掩膜分别做一次强度直方图,记录窗宽窗位的大致范围,作为后续预处理的起点。
§4 质量与已知问题
4.1 标签噪声是作者承认的
这份数据的质量问题里,最值得先说的是组织方自己承认的那一条。
挑战赛总览论文在讨论环节写得直接:完整准确地标出全部肺动脉非常困难,因为拓扑过于复杂,标注可能有噪声。具体到部位,论文提到训练集的主肺动脉部分存在一些标签噪声,但是所有参赛者面对的是同一份数据与标签;测试集的相应噪声已经修正,测试集更准确,因此对参赛者是公平的。
这段话有两层含义。第一层是事实层面的:训练集的标签不是逐体素完美的,主干部分有错标。第二层是制度层面的:组织方选择「修正测试集而不修正训练集」,理由是不影响竞赛公平,因为大家都在同一条起跑线上。这个选择对竞赛是合理的,对后续把训练集当金标准做方法研究的团队则不是——模型学习的是带噪标签,评估用的若也是带噪标签,指标会被高估。
4.2 分支末端的漏标问题
第二类问题比主干噪声更隐蔽,因为它不表现为错标,而表现为「该有的地方没有」。
论文在讨论小分支时举了一个例子:分支的标注,尤其是末端,很困难,标签上可能出现错误;某些区域被多数队伍都分割出来了,人工复核发现这些区域确实是肺动脉的位置,所以深度网络多分割出来的是真实血管,只是标签没标。
这段描述的含义是:标签在末梢偏保守。区域生长在细管径处容易断,专家补标时以主干与可辨认的分支为主,末梢最容易漏。当模型凭图像线索找回了这些漏标分支,按像素算 Dice 时会被当作假阳性扣分。
这造成一个反常现象:一个「更正确」的模型,在官方标签上可能反而得分更低。论文的建议是把传统分割方法与深度网络结合,以便更完整、更准确地标注分支末端,并称分支标注是未来亟待解决的问题。
4.3 多级指标的设计与实际效果
赛题的核心设计是把主干与分支分开打分,并用加权合并。权重是分支 80%、主干 20%。这个权重分配与两个部位的分数量级正好形成张力:分支的 Dice 普遍在 75 到 77 之间,主干在 89 到 92 之间,分支占比高,意味着最终分数主要由难做的部分决定。
从论文的测试榜前十名看,这个设计确实把不同队伍区分开了。分支 Dice 最高的是冠军队伍 77.19,第二名 76.67,第三名 76.86,第四名 76.57,第五名 76.10,前五名的分支分数差距不足 1.1 个百分点,而主干分数从 89.50 到 91.71,差距超过 2 个百分点。两条曲线的离散程度不同,说明主干已经接近饱和,分支才是真正拉开差距的地方。
需要提醒的是,加权分数是 0.8 乘分支加 0.2 乘主干,这是由权重推算出的合并方式,论文没有给出显式公式。复现时若自己算加权 Dice,结果可能在小数点后第二位与论文表格不一致。
4.4 效率指标的可比性
四项指标等权的排名方式的优点是简单,缺点是量纲不一致却强行拉平。
运行时间以秒计,从 4.21 秒到 380 秒,跨度接近两个数量级;显存以兆字节计,从 1674 到 12288,跨度约七倍;Dice 在 0 到 1 之间,满打满算差 0.2;HD95 以毫米计,差几毫米。四项各自排名再取平均,等于把「快 20 秒」与「Dice 高 0.5 个点」放在同一把尺子上。
这带来两个后果。其一,排名对单项极端值敏感。某个队伍如果运行时间排第一、显存排第一,即使 Dice 只排第十,平均排名也会很好看。其二,排名对测量环境敏感。运行时间与显存在不同硬件上测出的绝对值不同,若评测硬件不统一,这两项的可比性会被削弱。论文给出的显存数值都以兆字节为单位,但评测所用显卡型号没有在正文中明确,只能从显存上限 12288 兆字节推断测试设备至少有 12 GB 显存。
4.5 人群与设备的代表性
四个采集中心都在中国境内,两座在黑龙江,一座在北京,设备只有两家厂商。论文自己承认了这一点:模型在多中心数据上训练与测试,但只包含中国医院的扫描,受数据限制,无法纳入其他国家或大洲的临床信息。
对临床转化而言,这意味着三件事。
其一,人群分布偏窄。三个子集的女性占比都明显高于男性,训练集接近八成,这与多数肺动脉疾病队列的性别构成不同。
其二,机型分布偏窄。只有 SIEMENS 与 PHILIPS,其他主流厂商的重建风格没有出现在数据里。重建核函数、迭代重建强度会改变管腔边界的锐利程度,进而改变分割结果。
其三,缺少扫描时相信息。对比剂充盈程度决定了主干与静脉的亮度关系,数据中没有记录扫描延迟时间,无法在复现时对齐成像条件。
4.6 与实际临床流程的距离
从影像到管腔掩膜,这只是临床工作流中的一环。真实场景里,医生的问题通常是「有没有栓子」「右心室有没有扩大」「肺动脉压力可能多高」,而掩膜只是这些判断的输入之一。
数据里没有栓子标签、没有右心室测量、没有肺动脉压力,也没有任何结局字段。因此以下问题都无法直接用这份数据回答:分割结果能否预测肺栓塞的严重程度;主肺动脉直径与肺动脉高压的关联;分支稀疏程度是否与慢性血栓栓塞性肺病相关。
能做的是把掩膜作为中间量,再与另行获取的临床数据做关联。这种关联研究需要经伦理审批的病例链接,而 PARSE 不提供患者标识,无法与本院的电子病历连接,除非依赖原始档案。
4.7 假设—支持—反对三列表
| 假设 | 支持 | 反对 |
|---|---|---|
| 标签在主干处基本可靠 | 测试集噪声已修正;主干 Dice 普遍 89 以上,说明多数队伍与金标准一致 | 作者明言训练集主干存在标签噪声,且未说明噪声的性质与范围 |
| 分支漏标是系统性的 | 论文举例说明模型多分割处经复核为真实血管;建议用传统方法与网络结合补标 | 论文未给出漏标的比例估计,无法量化影响幅度 |
| 100 例足以训练出可迁移的模型 | 前十名队伍都只用这 100 例训练,取得了 77 以上的分支 Dice | 标签只覆盖单一人群单一厂商,迁移到非中国人群的效果未知 |
| 效率指标可跨平台比较 | 四项等权排名,形式上看简单可复现 | 评测硬件型号未在正文明确,运行时间与显存的绝对值依赖环境 |
| 四中心数据足够代表中国人群 | 覆盖黑龙江、北京等地,含两家厂商 | 三子集女性占比均偏高,年龄段集中,代表性存疑 |
| 与 HiPaS 的数据可以互相验证 | 同一课题组、同一标注方法与标注专家 | 两者规模与类别不同,PARSE 只含肺动脉、HiPaS 含动静脉双类,且论文未写两者是否为同一批病例 |
4.8 结论强度分级
按证据来源数量分级,便于引用时注明。
A 级,至少三条独立证据线。可判为 A 的有三条:数据规模与划分(官网、arXiv、Nat Commun 三处均有数字,虽小有差异但方向一致);获取方式在 2025 年 9 月转为公开直链(官网数据页与首页公告两处,且链接可验证);标注由 5 名专家投票合并(arXiv 与 Nat Commun 两处一致,官网另写 10 名专家参与)。
B 级,两条证据线。采集四中心两厂商(arXiv Table 1 与 Nat Commun 的站点描述);赛题同时约束精度与效率(官网 About 段与 arXiv 摘要)。
C 级,单一来源。运行时间与显存的评价硬件型号;标注投票的具体实现;主干噪声的具体范围;组织方称「首个肺动脉分割挑战赛」。
D 级,推断,仅作提示。PARSE 的 203 例与 HiPaS 的 315 例 CTPA 是否为同一批;协议在转为公开直链后是否仍具约束力;公开包是否含有测试集的部分图像。
§5 能做什么
5.1 主线任务:单类管腔分割
最直接的用法就是赛题本身:输入 CTPA,输出肺动脉的体素级掩膜。
这个任务在方法层面有几个具体特点,决定了它不是「随便拿个分割网络就能跑好」的题目。
第一,前景占比极低。肺动脉的体积相对整个胸部 CT 体积很小,正负样本极不平衡,损失函数若用朴素交叉熵,模型会倾向把所有体素判成背景。
第二,结构细长且连通。主干粗、分支细,从 20 多毫米的管径一路降到接近体素尺寸。3D 卷积的感受野要能覆盖分叉处的拓扑关系,否则断连。
第三,前景内部强度不均。对比剂在靠近注射侧的血管里最亮,往末梢递减,同一条血管从近端到远端可以有两三百个亨氏单位的落差。
第四,邻近结构干扰强。肺静脉、肺门的软组织、纵隔内的脂肪与淋巴结都贴近血管,边界判断需要上下文。
上述四点与冠脉、脑血管分割高度相似,因此 PARSE 上的方法经验可以迁移到其他血管树任务;反过来,在脑血管或冠脉数据上验证过的技巧,也值得在 PARSE 上再试一次。
5.2 最小可执行示例
以下流程是能把 PARSE 跑通的最小闭环,不追求分数,只保证每一步都能验证。
第一步,数据装载。读 image 与 label,校验 affine 一致,把强度按固定窗宽窗位裁剪后归一化到零一。由于数据没有统一空间,需要先做各向同性重采样,常见做法是重采样到 1 mm 立方体素。
第二步,肺区提取。论文里多数队伍用阈值加形态学的方法先圈出肺区,把肺外的部分裁掉。这一步不是必需的,但能显著减少负样本,也让「主干与分支」的划分有了依据。
第三步,切块训练。把整卷切成固定大小的三维块,前景块与背景块按比例混合采样,保证每个批次里都有足够的前景体素。
第四步,损失设计。论文里名次靠前的队伍多用了 Dice 与交叉熵的组合,部分队伍加了边界或骨架约束。对细长结构,纯 Dice 容易在末梢坍缩,加入骨架类损失是一个常见改进方向。
第五步,推理与拼装。整卷滑窗推理,重叠区做平均或投票,最后按阈值二值化。
第六步,分级评估。先按掩膜与肺区的关系拆成主干与分支两部分,再分别算 Dice 与 HD95,最后按八比二加权。
每一步都可以单独跑通并检查,便于定位问题。
5.3 超出赛题但可行的用法
赛题之外的用途,按可行性从高到低排。
其一,作为细长结构分割算法的压力测试集。分支末端的漏标使这份数据天然带有一个「标签偏保守」的偏置,适合评估方法对不完整标注的鲁棒性。
其二,作为解剖形态学分析的输入。掩膜可以直接导出主肺动脉直径、分支数量、血管总体积等量化指标,供后续与临床变量做关联。论文的后续工作正是沿这条路走的,只是规模扩到了上万例。
其三,作为跨数据集泛化的测试端。在别的 CTPA 数据上训练、在 PARSE 的验证集上测试,或者反过来,可以观察分布漂移的幅度。
其四,作为手术规划流程中的自动管腔提取环节。胸外科手术前需要知道血管走向与分支关系,掩膜可以作为三维重建的起点,但需要人工核对。
5.4 不该用它做的事
以下几类用途,数据本身不具备支撑条件。
分类类任务:没有病例级标签,无法做肺栓塞有无、肺动脉高压有无的二分类器,除非另有标注来源。
动静脉分离:标签不区分动脉与静脉,无法用于训练动脉静脉双类模型。
预后研究:没有随访、没有结局,不能做生存分析或风险预测。
多中心泛化声明:四家中心都在中国,设备只有两家,据此声称「在多中心数据上验证过」不准确,应写明是哪几家中心。
公平性研究:没有患者标识与人口学表,无法做子组分层分析。
5.5 与后续工作的衔接
PARSE 之后,同一课题组把方向推进到了动脉静脉联合分割与非增强 CT 分割,发表的成果是 HiPaS。这条线索对使用者的意义在于:如果课题的目标是「从 CT 里分出肺动脉与肺静脉」,那么 PARSE 只是起点,后面的数据集才是主战场;如果目标是「单一类别的肺动脉管腔」,PARSE 仍然是最适合的公开基准之一,因为它的标签质量在主干部分是经过核对与修正的。
另一条衔接是方法层面。PARSE 参赛队的技术报告里,不少队伍用的是 nnU-Net 的变体,这与后续几年医学分割的主流一致。把这批报告当作「同一数据上不同工程选择的对照表」来读,比单纯看排行榜更有信息量。
§6 常见误读与避坑清单
误读对照表
左列的说法在教程、二手转述与论文引用中反复出现,右两列给出核对后的口径与出处。逐条比对可避免把转述当原文。
| 常见说法 | 实际口径 | 证据位置 |
|---|---|---|
| PARSE 是「解析」类数据集或 NLP 语料 | 是 Pulmonary ARtery SEgmentation 的缩写,肺动脉分割 | 官网首页 About 段 |
| 数据集有两百例全部带标注 | 带标签的只有训练集 100 例,公开验证 30 例无标签 | 官网 Dataset 页 |
| 测试集也是 70 例 | 官网写 70,论文 Table 1 写 73 且三项相加为 203 | 官网与 arXiv Table 1 |
| 许可为 CC BY 或 CC BY-NC | 官网无 SPDX 名,约束来自协议文件 | 官网 Data Access Rules |
| 下载需要发邮件申请 | 2025 年 9 月 10 日起训练与验证集已给公开直链 | 官网数据页公告 |
| 这是动静脉双类标注 | 只有 0 背景与 1 肺动脉两类,静脉无标签 | 官网 Dataset 页 |
| 数据来自哈尔滨一家医院的一台设备 | 论文写四家中心、两家厂商 | arXiv 数据集一节与 Table 1 |
| 分支 Dice 77% 说明方法还很不成熟 | 分支 80% 权重下的冠军成绩,主干已达 90% 级,差距来自标签与管径极限 | arXiv Table 3 与讨论 |
| 标签是逐体素金标准 | 区域生长半自动加人工精修,训练集主干有作者承认的噪声 | arXiv 讨论与 Nat Commun 方法 |
| 漏标的末梢是模型误检 | 复核发现多为真实血管,标签偏保守 | arXiv 讨论 Fig.7 段 |
| 排行榜只看 Dice | Dice、HD95、运行时间、显存四项等权 | 官网 About 段 |
| 训练集 100 例可当作独立测试集 | 官方验证集与测试集才是划分外的数据,训练集自评会高估 | 官网划分说明 |
| 这份数据与 HiPaS 是同一批 | 标注方法同源,但规模与类别不同:203 例单类对 1073 例双类 | Nat Commun 与官网推荐段 |
| 数据含扫描协议与患者信息 | 无 DICOM、无人口学表、无扫描时相 | 包内容与论文 Table 1 |
| 论文已正式发表 | 挑战赛总览为 arXiv 预印本,修订至 v2 | arXiv 提交记录 |
技术陷阱
陷阱一:把 affine 当成默认一致。 每例只有一个 image 与一个 label,两者的方向编码若不相等,直接训练会得到镜像的掩膜。必须逐例比对 affine 矩阵,不要只查第一例。
陷阱二:把切片数上限记成 376。 官网写 228 到 376,论文写 228 到 408。按官网数字做内存预算,遇到 408 层的病例会溢出。预算要按上限加缓冲来算。
陷阱三:用整卷 Dice 代表分支表现。 主干体积大,整卷 Dice 几乎完全由主干主导,分支的表现被掩盖。必须按肺区内外拆开计算,否则无法与论文的分数比较。
陷阱四:把像素间距当成各向同性。 平面间距在 0.50 至 0.95 mm 之间,层厚固定 1 mm,两者不相等。直接在原始空间上做各向同性的卷积,等于让网络在不同方向上看到不同的解剖尺度。
陷阱五:按年龄或性别做子组分析。 包里没有人口学表,病例编号与论文 Table 1 的行无法对应。子组结论只能是整体统计,不能落到个体。
陷阱六:把测试集当外部验证。 测试集从未公开,任何声称「在 PARSE 测试集上得到」的分数,要么来自当年参赛,要么口径无法核实。复现时应使用公开验证集或自建留出集。
陷阱七:把加权分数当成单纯的精度。 加权 Dice 只包含中心与分支两部分,未包含运行时间与显存。论文的最终名次是四项排名平均,与加权 Dice 的排序并不一致,冠军在分支 Dice 上第一,但在主干 Dice 上不是第一。
陷阱八:把「首个」当成学术定论。 「首个肺动脉分割挑战赛」是组织方自述,论文与官网都这样写,但未给出检索范围的界定。引用时应写明「组织方称」。
DAIMS 评估
| 维度 | 评估 | 说明 |
|---|---|---|
| 数据完整性 | 中 | 三划分齐全,但测试集封闭,训练集标签有噪声 |
| 可访问性 | 中高 | 2025 年起直链下载,早期为协议申请 |
| 可互操作性 | 中 | 标准 NIfTI,但无统一空间、无元数据表 |
| 可复用性 | 中 | 单类标签限制了用途,管腔掩膜本身可广泛复用 |
| 可追溯性 | 高 | 官网、arXiv、Nature Communications、GitHub 四线可查 |
| 文档完备度 | 中 | 划分与指标写得清楚,扫描参数与标注细节留白 |
引用时的写法建议
引用这份数据时,建议同时给出三项:挑战赛全称与年份、使用的是训练集还是公开验证集、标签类别数。只写「PARSE 数据集」而不指明子集,读者无法判断可比性。
引用分支成绩时,务必注明是加权分数还是分支单项,并写明是测试榜还是验证榜。两者差距很大,混引会造成误读。
引用「标签质量」时,宜引用作者的表述原文,即训练集主干有噪声、分支末端偏保守、测试集已修正,而不是概括成「标签质量高」或「标签不可靠」。
§7 在生态中的位置
7.1 血管分割赛事的三个世代
把 PARSE 放回血管分割的赛事谱系里,能看清它继承了哪些设计、又引入了什么。
第一世代以管径较大的血管为主,任务是把主动脉或冠状动脉树从 CT 中分离出来,标签通常是单类,评估用 Dice 与表面距离。这一代的代表是冠脉与主动脉方向的赛事,难点在解剖变异与邻近结构,样本量与标签密度都较宽松。
第二世代开始强调拓扑与分级。脑血管方向先出现了以 Willis 环完整性与分支覆盖为核心的评测,把「连通」与「分叉识别」纳入指标。PARSE 的分级思路与此同源:它用肺区内外的几何划分替代解剖分级,用加权把困难部分的分量抬上去。
第三世代强调效率与临床可用性。PARSE 把运行时间与显存写进排名,是这一转向的早期样本。后续几年里,越来越多的挑战赛在精度之外增设推理成本、参数量或部署约束。
7.2 肺动脉方向的上下游
上游是肺部 CT 的公共资源。肺结节筛查、肺癌筛查、气道树建模的数据在数量上远超肺动脉数据,但它们的目标是病灶或气道,与管腔分割是不同任务。这些数据可以作为预训练语料,论文中的 HiPaS 就用了近两万例公开胸部 CT 做自监督预训练。
下游是肺血管相关的临床研究。肺动脉的形态学量化在肺高压诊断、肺栓塞严重度评估、肺移植术前评估中都有用途。PARSE 提供的掩膜是这类量化的中间产物,但要落地还需要把掩膜换算成临床指标,并在一批有结局标签的病例上验证。
侧向是肺静脉。心房颤动的消融术前规划需要肺静脉的三维形态,这是与肺动脉并行的一条线。PARSE 的标签不含静脉,做这条线需要另找数据。
7.3 与同域数据的对照
| 维度 | PARSE 2022 | 颈部与脑部血管赛事 | 冠脉与主动脉赛事 | 肺结节筛查数据 |
|---|---|---|---|---|
| 解剖对象 | 肺动脉树 | 颈动脉管壁、Willis 环、脑动脉 | 冠脉树、主动脉 | 肺实质结节 |
| 标签形态 | 单类体素掩膜 | 管壁与管腔分标、实例标签 | 段号实例、钙化评分 | 结节框与恶性度 |
| 评测重点 | 主干与分支分级、效率 | 拓扑与覆盖 | 段级 Dice、狭窄检测 | 检出率与假阳性 |
| 获取门槛 | 协议申请,2025 年起直链 | 多为开放下载 | 多为开放下载 | 多为开放下载 |
| 与 PARSE 的可迁移性 | —— | 方法可迁移,数据不通用 | 方法可迁移,数据不通用 | 仅作预训练语料 |
7.4 三条进入路径
按使用目的分三条路,各自的第一步不同。
做方法研究:从训练集 100 例出发,先在验证集 30 例上定住流程,再考虑与论文前十名的配置对照。这一步的产出通常是流程与超参,不是分数。
做临床关联:先把掩膜转成量化指标,再看手头是否有能链接的临床数据。若没有,PARSE 只能作为方法验证,不能作为临床结论的来源。
做数据工程:关注包的完整性、affine 一致性、标签与图像的对应关系,把清洗规则写下来。这条路的产出是数据字典,对团队复用最有价值。
§8 局限与未覆盖
8.1 官方未说明的部分
以下信息在一手材料中找不到,列出以便使用时知道边界。
标注的一致性数值。论文描述了 5 人标注加投票,但没有给出专家之间的重合度。
每例的标注耗时。Nat Commun 提到动脉静脉双类标注平均每个病例约半小时,但那是 HiPaS 的流程,PARSE 的单类标注耗时没有单独统计。
扫描协议。管电压、管电流、对比剂浓度与注射速率、扫描延迟,一律未披露。
测试集的评测硬件。运行时间与显存的绝对值依赖设备,设备型号未在正文写明。
协议条款的可执行细节。协议文件可下载,但官网正文未复述条款。
8.2 与论文表格核对时的注意事项
论文的 Table 1、Table 2、Table 3 是核对的基准,但有三处容易读错。
其一,Table 1 的三行分别对应训练、验证、测试,其中厂商一列写的是 SIEMENS 与 PHILIPS 的例数,两个数之和等于该行总数,不能当成两套独立数据。
其二,Table 2 记录的是前十名队伍的方法描述,不是成绩;成绩在 Table 3 与另一张指标表,两队同名不同表的情况容易混淆。
其三,年龄一列给的是区间加括号内的均值,括号里不是中位数。用均值做中心趋势描述时,应注明是均值。
8.3 统计口径的两处硬冲突
第一处是 200 与 203。两个数字都出自一手材料,差别在于是否把后期补入或剔除的病例计入。若论文的 Figure 与表格按 203 计算,用 200 做分母会让任何比例都偏低约百分之一点五。
第二处是 70 与 73。官网写封闭测试 70 例,论文 Table 1 写 73 例。若按 100 加 30 加 73 等于 203 的关系推断,论文的数字与总例数自洽,官网的 70 可能是发布时的整数表述。
两处的处理原则相同:正文并列写出,引用时优先用论文数字,并注明官网另有表述。
8.4 后续可补的方向
从公开信息看,这份数据有三条自然的延伸线。
第一条是标注完备性。把分支末端的漏标补上,是论文明确提出的待办。补标后的版本若公开,旧版本的分支 Dice 将不再可比。
第二条是动静脉双类。同一课题组已经走出了这条路,HiPaS 是直接产物。
第三条是非增强 CT。PARSE 全部是对比剂增强的 CTPA,非增强 CT 上的肺动脉分割难度更高,HiPaS 的 758 例非增强数据正是针对这一点。
§9 与库内条目的关系
9.1 血管树分割方向的邻居
脑血管方向有两个直接可比的对象。TopCoW 挑战赛面向 Willis 环,核心是拓扑感知的分割与分级评测,与 PARSE 的「主干与分支分开打分」是同一个思路在不同解剖对象上的应用。脑动脉分割挑战赛则提供了百例级的 TOF-MRA 公开标注,单模态、单任务,与 PARSE 的形态最接近,只是成像物理不同:MRA 不靠对比剂,血管与背景的对比机制与 CTPA 完全不同。
颈动脉方向的血管壁分割挑战赛提供了另一种视角:它同时标管腔与管壁,标签是多类的,难度集中在薄壁。PARSE 只有管腔一类,两者在标签设计上不可互换,但在「细长管状结构上如何设计损失」这一点上可以互相参考。
9.2 冠脉与主动脉方向
冠脉造影的狭窄检测数据集是异构例:同样是把血管切成段再评估,但它基于二维投影、按段号分实例,评测指标是分割与检测双线。把 PARSE 与它并列看,能看出「段号实例分割」与「单类体素分割」是两类不同的标注范式。
冠状动脉树的自动分割挑战赛与 PARSE 同属 CT 上的血管树分割,CTA 与 CTPA 的成像物理相近,方法迁移的阻力最小。
主动脉的分割数据集则管径大得多,边界清楚,常被当作血管分割的入门数据。从主动脉到肺动脉,难度是递增的。
9.3 肺部的邻近条目
肺结节筛查数据(如 LIDC 与 LUNA16 系)与 PARSE 共享解剖区域,肺区提取这一步的预处理可以直接借用,但任务与标签完全不同。把 PARSE 的掩膜当作肺结节检测的辅助输入,是一个可行的组合思路,但不是这两份数据的原始设计目标。
肺气道树建模数据与 PARSE 的关系更近:气道与血管都是树状结构,都从肺门向末梢分叉,两者在分叉处的空间关系是三维重建的难点。做血管分割时若能把气道掩膜作为解剖锚点,有助于区分肺门附近的结构。
肺栓塞的 CTPA 报告标签集则揭示了另一条路线:不标像素、只标报告文本中的发现。它与 PARSE 的体素掩膜形成互补,前者适合做分类与检索,后者适合做量化。
9.4 名称相近但不同物
库内另有一条名字含 parse 的条目,是微软 BiomedParse 的整合训练语料。二者字形相近,实体完全不同:前者是 45 个分割数据集的整合语料,用于训练通用的分割基础模型;后者是单一的肺动脉分割挑战赛数据。检索时若只看 parse 一词,两条会被混在一起,引用前必须核对全称。
9.5 不建议的关联
把 PARSE 与肺功能或生理信号类数据说成「可以联合做肺血管功能分析」不成立,因为两边都没有可链接的病例标识。
把 PARSE 与冠脉或脑血管数据说成「同一批患者的不同部位」也不成立,影像来源与病例完全无关。
把它与 HiPaS 说成「同一数据的不同版本」同样不准确:标注方法同源,规模与类别都不同,两者是前后相继的两个资源,不是版本关系。
§10 总结
10.1 适用场景
PARSE 适合以下五类工作。
细长管状结构的分割方法研究,尤其是需要在分叉与末梢保持连通性的场景。分支 Dice 在三年的公开成果里始终卡在 77 附近,说明这里还有空间。
带噪声标签的鲁棒学习。训练集主干有作者承认的噪声,分支末端系统漏标,这为标签修正、噪声建模与半监督方法提供了现成的测试床。
效率约束下的模型压缩与加速。四项指标里有两项是运行时间与显存,直接为轻量化研究给出了参照点。
跨数据集泛化评估的一端。在自有 CTPA 数据上训练、在 PARSE 上测试,或在 PARSE 上训练、在自有数据上测试,都能得到有意义的分布漂移信号。
解剖形态的量化学研究。掩膜可直接导出主干直径、分支数量与血管体积,作为后续关联分析的输入。
10.2 不适用场景
它不适合动静脉联合分割,因为标签只有一类。
不适合肺栓塞或肺动脉高压的检出与分级,因为没有病灶标签与临床结局。
不适合作为「多中心泛化」的证据,因为四家中心都在中国,设备只有两家。
不适合公平性或子组分析,因为没有人口学表与患者标识。
不适合直接商用,因为许可不是标准开源许可,协议条款需自行判读。
10.3 三句话概括
PARSE 把肺动脉分割拆成主干与分支两级、再加一项效率约束,做成了可比的公开赛制,训练集 100 例带标签、验证 30 例只有图像、测试 73 例封闭。
它的价值在于给出了一个分支占比 80% 的难度设计,让管线方法之外的质量问题——标签漏标、管径极限、类别单一——在分数上显形。
使用它的前提是接受三件事:能拿到标注的只有一百例;标签只有肺动脉一类;获取方式偏协议而非标准许可。
10.4 关键数字速查
| 项目 | 数值 | 出处 |
|---|---|---|
| 训练 / 公开验证 / 封闭测试 | 100 / 30 / 70(论文 73) | 官网 Dataset 页;arXiv Table 1 |
| 体数据总数 | 200(官网)/ 203(论文) | 同上 |
| 层厚与平面矩阵 | 1 mm;512×512 | 官网;arXiv Table 1 |
| 标注类别 | 0 背景 / 1 肺动脉 | 官网 Dataset 页 |
| 冠军测试成绩(加权 DSC) | 79.69 ± 6.95 | arXiv Table 3 |
| 冠军分支 DSC | 77.19 ± 8.32 | arXiv Table 3 |
| 分级权重 | 分支 80% / 主干 20% | arXiv 指标一节 |
| 参赛队 | 注册 469 / 获批 111 / 合格提交 25 | arXiv 参赛情况 |
附录 A 术语与缩写
| 缩写 | 全称 | 中文 | 备注 |
|---|---|---|---|
| PARSE | Pulmonary ARtery SEgmentation | 肺动脉分割 | 本文数据集名 |
| CTPA | Computed Tomography Pulmonary Angiography | CT 肺动脉造影 | 对比剂增强的胸部 CT |
| PA | Pulmonary Artery | 肺动脉 | 目标结构 |
| DSC | Dice Similarity Coefficient | Dice 相似系数 | 体积重合度 |
| HD95 | 95th percentile Hausdorff Distance | 95 分位豪斯多夫距离 | 表面距离 |
| RT | Running Time | 运行时间 | 效率指标之一 |
| GPU | Graphics Processing Unit | 图形处理器 | 显存约束的载体 |
| MIMICS | Materialise Interactive Medical Image Control System | 医学影像处理软件 | 标注工具 |
| NIfTI | Neuroimaging Informatics Technology Initiative | 神经影像信息学技术倡议格式 | .nii.gz 容器 |
| MICCAI | Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention | 医学图像计算与计算机辅助介入 | 会议名 |
| HiPaS | High-abundant Pulmonary Artery-vein Segmentation | 高丰度肺动脉静脉分割 | 后续方法与数据集 |
| TOF-MRA | Time-of-Flight Magnetic Resonance Angiography | 时间飞跃法磁共振血管成像 | 脑动脉赛事所用模态 |
| CTEPH | Chronic Thromboembolic Pulmonary Hypertension | 慢性血栓栓塞性肺动脉高压 | 相关临床场景 |
| DSCTPA | Dual-Source CTPA | 双源 CT 肺动脉造影 | Nat Commun 中的命名 |
附录 B 目录结构速查
PARSE2022/
├── train/ 100 例,带标签
│ ├── PA000005/
│ │ ├── image/PA000005.nii.gz
│ │ └── label/PA000005.nii.gz
│ ├── PA000317/
│ │ └── ...
│ └── ...
└── evaluation/ 30 例,只有图像
├── PA000013.nii.gz
├── PA000316.nii.gz
└── ...
标签体素值:0 为背景,1 为肺动脉。训练集的 image 与 label 目录同名、文件名同号,可以按编号直接配对;evaluation 目录平铺,无 label 子目录。
附录 C 检索模板
用下列检索式定位原始材料,避免只依赖二手转述。
- 挑战赛页面:
parse2022 grand-challenge pulmonary artery segmentation - 总览论文:
Efficient automatic segmentation for multi-level pulmonary arteries PARSE challenge - 方法论文:
HiPaS pulmonary artery vein segmentation Nature Communications 2025 - 代码与协议:
PerceptionComputingLab PARSE2022 - 引文追踪:用 DOI 10.1038/s41467-025-56505-6 在引文数据库中查引用它的工作,比按关键词检索更容易捞出方法学论文
- 后续数据:
HiPaS zenodo 14879605
编辑说明
核验时间与方式:2026-10-18。三处一手材料交叉核对:挑战赛官网首页与数据页(含 About、Schedule、News、Award、Data Access Rules、引用要求);挑战赛总览论文 arXiv 2304.03708 v2 的正文与三张表(数据描述、前十名方法、测试成绩);Nature Communications 论文 16:2262 的 PMC 全文(标注方法、伦理批件、数据可用性段落)。凡官方未写者一律在正文标注为未披露,未作推断填充。
与任务头数字的差异:任务头未给出规模数字,未发现需要纠正之处。正文采用的一手口径为:总例数 200(官网)与 203(论文)并列;划分 100、30、70(官网)与 100、30、73(论文)并列;切片上限 376(官网)与 408(论文)并列。
双口径冲突清单:① 总例数 200 对 203;② 封闭测试 70 对 73;③ 切片数上限 376 对 408;④ 采集中心 1 对 4(官网写单设备,论文写四中心两厂商);⑤ 获取方式,2025 年 9 月的公开直链与 2023 年 2 月的协议申请并存于同一页面,官方未声明前者是否取代后者;⑥ 「首个肺动脉分割挑战赛」为组织方自述,未界定检索范围。
未覆盖内容:标注专家之间的一致性数值;每例标注耗时;扫描协议(管电压、管电流、对比剂、扫描延迟);测试榜评测所用硬件型号;协议文件的具体条款文本;测试集榜单的逐队分数(论文只给前若干名的队名与指标)。以上均因一手材料未披露而留空。
遗留疑点:① 挑战赛总览论文至今只有 arXiv 预印本,未见期刊版本;② HiPaS 在 Zenodo 上的记录 14879605 本次访问返回 403,其条款与包体大小未能核验;③ PARSE 的 203 例与 HiPaS 的 315 例 CTPA 是否为同一批病例,两篇论文均未明写,正文未作合并推断。
下次复核触发点:① 若总览论文正式见刊,需核对 203 与 73 两个数字是否维持;② 若官网删除 2023 年那段协议申请文字,需更新获取方式一节;③ 若出现 PARSE 的补标版本,需重写标签质量与分支成绩的可比性论述。
相关数据集导航
以下为站内 AI-Ready 数据集百科中与本词条共享多个主题标签的相关数据集,按相关度降序排列:
- asoca — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 挑战赛数据集 / 心血管疾病
- mm-whs — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 挑战赛数据集 / 心血管疾病
- orcascore — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 挑战赛数据集 / 心血管疾病
- imagecas-x — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 挑战赛数据集 / 心血管疾病
- care-challenge — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 挑战赛数据集 / 心血管疾病
- camus — 共享标签:医学影像 / 医学图像分割 / 挑战赛数据集 / 心血管疾病
- imagecas — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 心血管疾病
- segthor — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 挑战赛数据集
- largeia — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 心血管疾病
- imagechd — 共享标签:医学影像 / CT / 医学图像分割 / 心血管疾病
导航说明:本章节由全站统一标签体系自动计算生成(标签重合度算法),双向可达;点击链接可跳转至对应数据集词条。

