信息速览
INFOBOX — InReDD-Dataset-PAN924 一屏速览
维度 内容 本质 USP-RP 数字牙科组发布的 924 张匿名全景牙科 X 光片像素级多标签数据集(非挑战赛、非重标注升级版) 团队 InReDD(Interdisciplinary Research Group in Digital Dentistry),University of São Paulo, Ribeirão Preto campus(USP-RP) 前置论文 Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol. 2024;138(1):205-213(doi:10.1016/j.oooo.2023.12.006) PhysioNet 2025-11-22 发布,版本 1.0.0,DOI 10.13026/r5nt-we67 数据 924 张全景片,JPG,2903×1536 px,95 dpi;命名 <id>-<sex>-<age>.jpg人群 14–81 岁,中位 35 岁;女约 60% / 男约 40% 任务 双任务:Labeling(FDI 牙位编号,32 类,不可变)+ Annotation(牙齿状况,可变) 标注 3 名牙颌面放射科医师强制共识(forced consensus);平台 LyriaPACS 格式 COCO 兼容 JSON(bbox [x,y,w,h]+ 多边形 segmentation);split / combined 两版规模 矩形框 20,957(PhysioNet 口径)|牙齿分割掩码 4,621|FDI 牙位 32 类|状况 14 类 工具 FiftyOne(附加载脚本 inredd_dataset_pan924_fof.py);I-Medsys 影像服务器 扩展 InReDD-Dataset-PAN924-Ext-BoneLoss-769(2026-09-17,769 张,21,064 多边形标注) 获取 PhysioNet 受限访问(DUA + 贡献者审核,无直链)|GitHub 镜像仓公开(受上游约束) 许可 PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0 + Health DUA(GitHub 另声明 CC BY 4.0,双口径) 库内互链 dentex(牙科全景 X 光挑战赛)、3dteethland(三维牙齿分割)、caries-miccai(龋齿检测)
InReDD-Dataset-PAN924 是一份"用放射科医师的共识,给全景牙科 X 光片立一套可复现标注规矩"的数据集:它没有开发竞赛、没有排行榜,也不追求图像数量上的绝对领先,而是把 924 张匿名全景片的每一颗牙齿用矩形框圈出、用多边形描出轮廓,并同时打上牙位编号(这是哪一颗牙)与牙齿状况(这颗牙怎么了)两套标签。真正让它在牙科 AI 数据集谱系里立住位置的,不是 924 这个数字,而是它把"标注必须由牙颌面放射科医师以强制共识方式完成"这件事当作方法学主张写进了论文标题——在这个普遍依赖众包与单标注者的领域里,这是一次少见的"把标注质量放在规模前面"的宣言。
导语读法三则:
- 只想下数据:直奔 §6 获取与许可——注意本体走 PhysioNet 受限访问(DUA + 贡献者审核,无直链),GitHub 镜像仓只是格式转换发布,别把两者许可混为一谈。
- 关心标注方法学:直奔 §3 注释流水线——“Labeling vs Annotation 双任务”+“3 名放射科医师强制共识”+"LyriaPACS 平台"三段连读,这是本条目最不可替代的部分。
- 做目标检测/分割模型:直奔 §2 数据构成与 §5 评测——COCO 兼容 JSON 可直接喂给主流检测框架,但引用规模数字前必须先定口径(坑 1-3)。
§0 导读:这个数据集解决什么问题
牙科影像的 AI 研究长期面临一个尴尬的结构性错配:临床上有海量全景牙科 X 光片(一张片子就能看到全口 28–32 颗牙),但可用于监督学习的标注极其稀缺。稀缺的原因不是成像难,而是标注贵——要让一个模型学会"识别哪一颗牙、判断这颗牙是健康、龋坏、修复还是缺失",标注者必须同时具备牙位编号知识(FDI 系统下一颗牙的编号取决于它在上/下颌、左/右、第几位的组合逻辑)和牙体疾病判别能力(龋齿的放射学表现、修复体的边界、残根的识别)。这两项能力都指向同一类人:牙颌面放射科医师。而让放射科医师逐颗牙去做像素级勾画,成本高到几乎无法规模化。
由此产生了行业惯常的妥协路径:用非专家(学生、众包标注员)做标注,用单标注者省时间,用矩形框代替多边形以降低精度门槛,用"先射箭再画靶"式的模糊类别定义应付一致性考核。这些妥协在短期内换来规模,代价是标签噪声——而标签噪声在牙科影像里尤其致命,因为相邻牙齿的边界在 X 光片上本就模糊、牙齿状况类别之间的界定本就有临床分歧空间。
InReDD-Dataset-PAN924 的回答分三层,且每一层都直接对冲上述妥协。第一层是人:由 3 名各具十年经验的牙颌面放射科医师完成标注,并采用"强制共识"(forced consensus)机制——不是各标各的再统计一致性,而是必须讨论到达成一致为止。第二层是任务拆分:把标注拆成不可变的"Labeling"(牙位编号,客观、有 FDI 标准可依)与可变的"Annotation"(牙齿状况,主观、需要临床判断),前者保证结构性标签的确定性,后者承认判断空间的存在。第三层是格式:输出 COCO 兼容 JSON,bbox 与多边形 segmentation 并存,并同时提供 split(每图一文件)与 combined(全库单文件)两版,让下游框架能零成本接入。
§0 读法三则:
- 这个条目最容易被误读的地方在名字——
INREDD是 Interdisciplinary Research Group in Digital Dentistry(数字牙科跨学科研究组),PAN924是 PANoramic 全景牙科 X 光片 924 张;它与"胰腺癌"毫无关系(坑 5)。检索时若按"胰腺癌 924 例"去查将一无所获。 - 本条目所有规模数字都存在双口径冲突(PhysioNet 页 vs GitHub 仓):矩形框 20,957 vs 22,614、牙齿分割 4,621 vs 200、状况类别 14 vs 12。全文采用"并列存照 + 注明口径来源"的写法,引用前请对照 §10 与附录 R 的双口径登记表先定口径。
- 数据集本体没有官方挑战赛,它把自己定位为"支持描述性分析与 AI 模型的创建与验证"——因此不要期待像 DENTEX 那样的官方排行榜;评测协议需自行设计(§5)。
§1 数据集速览:十问十答
Q1:PAN924 里的"924"是什么?
924 张匿名化的全景牙科 X 光片(panoramic radiograph 的数字量)。全景片是把全口牙齿与颌骨拍进一张二维影像的牙科常规检查,一张片子即可覆盖上颌与下颌的全部牙列——这也是它成为"牙位级多标签数据集"理想载体的原因。
Q2:图像规格是什么?
JPG 格式,分辨率 2903 × 1536 px,95 dpi(原始为 300 dpi,发布前压缩)。文件名形如 <id>-<sex>-<age>.jpg,例如 2-F-70.jpg 表示某 70 岁女性受试者的图像,其中 ID 经质量清理后随机化、不连续。
Q3:谁做的,机构在哪?
巴西圣保罗大学里贝朗普雷图校区(University of São Paulo, Ribeirão Preto campus)内部的 InReDD(数字牙科跨学科研究组),联合计算与数学系(DCM-USP-RP)与里贝朗普雷图牙科学院(FORP-USP-RP)共同完成。PhysioNet 页面的署名顺序为 Caio Uehara Martins、Camila Tirapelli、Hugo Gaêta-Araujo、Jose Augusto Baranauskas、Breno Zancan、Jose Carneiro、Alessandra Macedo。
Q4:标注是怎么做的,可靠吗?
这是本数据集的核心卖点。标注由 3 名牙颌面放射科医师(各十年经验)以 **强制共识(forced consensus)**方式完成:不是各标各的算一致性,而是必须讨论到一致。标注在 LyriaPACS Web 平台上进行,配 I-Medsys 影像服务器,显示器 1024×768、24-bit,在昏暗环境下借助内置 zoom/brightness/contrast 工具完成。
Q5:标注任务怎么拆?
拆成两个任务:Labeling(牙位编号)——用 FDI 系统给每颗牙指定编号,是客观、不可变的标签;Annotation(牙齿状况)——标注每颗牙的状态(健康、龋齿、修复、种植体、残根等),是主观、可变的标签。这种拆分让结构性标签与判断性标签各归其位。
Q6:标注格式是什么,能直接训练吗?
COCO 兼容 JSON,保留牙科专用字段。每张图对应一个 JSON,实例分 mouth 与 teeth 两大类:矩形框为 [x,y,w,h],分割为多边形顶点列表。提供 split(每图一 JSON,便于切分训练/测试集)与 combined(全库合并单 JSON,便于整体统计)两版。附 FiftyOne 加载脚本 inredd_dataset_pan924_fof.py,可一键载入。
Q7:有多少标注?
PhysioNet 口径下矩形框标注共 20,957 个(mouth 类 924 + teeth 类 20,033);牙齿分割掩码共 4,621 个(分布在 200 张图的子集上)。FDI 牙位编号 32 类,牙齿状况 14 类(PhysioNet 口径),口腔状况 4 类。
Q8:牙齿状况有哪些类别?
分三层。Mouth 超类:Ed/De/Me/Mne 共 4 类。Teeth 超类再分 Artificial(Im/Cp/P)、Natural(H/Rr/M3i/M3f/Te/Ri/Dc/Di/C/R/I)、Mixed(TeM/RiM/CpuM)。PhysioNet 口径合计 14 类,GitHub 口径记 12 类——引用前先定口径(坑 3)。
Q9:怎么获取,要花钱吗?
不能直接下载。本体走 PhysioNet 受限访问(credentialed access):需签 PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0 与 Health Data DUA,并由贡献者逐项审核,无需培训但需资格认证。GitHub 镜像仓(thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format)提供格式转换发布,README 声明 CC BY 4.0——但实际存取仍受上游 PhysioNet 条款约束(坑 4)。
Q10:有扩展版吗?
有。InReDD-Dataset-PAN924-Ext-BoneLoss-769 于 2026-09-17 发布(版本 1.0.0),含 769 张全景片与 21,064 个 COCO 多边形标注(Release Notes 另记 21,047 口径),面向牙冠与牙槽嵴实例分割、以及从釉牙骨质界(CEJ)到牙槽嵴顶的骨流失测量。
§2 数据构成与规格
§2.1 图像层:924 张匿名全景片的"三件套"
InReDD-Dataset-PAN924 的图像层由 924 张匿名的全景牙科 X 光片(panoramic radiograph)构成。每张图像同时承载三类信息,构成一个极简的"三件套"标识系统:
| 层面 | 载体 | 取值/规格 |
|---|---|---|
| 匿名标识 | 文件名 <id>-<sex>-<age>.jpg |
例:2-F-70.jpg |
| 图像本体 | JPG 像素矩阵 | 2903 × 1536 px,95 dpi |
| 元数据 | 文件名嵌入的性别与年龄 | 性别 F/M;年龄 14–81 |
这种"把人口学信息编进文件名"的做法在牙科数据集里并不常见——它的好处是图像本身即可自证人群构成,无需额外的患者表即可做分层分析;代价是文件名与内容强耦合,任何重命名操作都会丢失元数据。特别需要注意:图像 ID 是质量清理后重排的随机值,不是连续序号——看到 2-F-70.jpg 后不要去推断"1 号图"或"3 号图"的存在,它们可能已经在清理中被移除。
§2.2 图像规格的技术含义
2903 × 1536 px 的横向长宽比(约 1.89:1)正是全景片的口腔全景视野比例:横向覆盖从右侧颞下颌关节到左侧颞下颌关节的全颌宽度,纵向覆盖上颌窦底至上颌牙槽突、下颌升支至下颌下缘。95 dpi 的标注值需要谨慎解读——原始影像为 300 dpi,发布前经压缩处理;文件中的 dpi 元数据更多是"来源标记"而非"诊断分辨率承诺"。JPG 有损压缩意味着在高倍放大下会看到块状伪影,做像素级分割研究时需注意这一点(牙齿分割掩码仅覆盖 200 张子集,正是为控制标注成本与压缩影响的折中)。
图像规格的实操提示:
- 不要重采样到统一尺寸后再对照原文数字。原始 2903×1536 是所有几何标注(bbox 坐标、多边形顶点)的坐标基准系;任何缩放都会让坐标语义漂移。
- 横向优先做增广。全景片的关键解剖结构(牙列、升支、上颌窦)沿横向分布,等比缩放会挤压纵向细节;建议横向裁剪/平移优先于随机旋转。
- 95 dpi 不是分辨率上限。若下游任务依赖小结构(如牙周膜间隙),应以原始 300 dpi 版本为准,向作者申请时明确这一点。
§2.3 人群构成:年龄与性别的双重分布
数据集覆盖 14–81 岁的广泛年龄跨度,中位年龄 35 岁。这个分布有明确的牙科流行病学含义:中位 35 岁落在恒牙列完全建立、龋齿与修复体开始累积的阶段,正是"牙齿状况多类共存"最典型的年龄段。性别构成为女性约 60%、男性约 40%——这一偏斜在牙科就诊人群中有现实基础(女性口腔保健利用率通常更高),但在训练模型时需要警惕:若下游任务与性别相关(如某些牙齿形态学差异),性别偏斜可能转化为预测偏差。
年龄两极的意义:14 岁附近的青少年样本携带第三磨牙发育与萌出状态(M3i 阻生 / M3f 全萌)的价值信息;81 岁附近的老年样本则是种植体(Im)、残根(Rr)、重度磨耗的高发群体。两端样本量可能远小于中位年龄带——这意味着做年龄分层研究时必须先统计各年龄段的样本量,而不是假设分布均匀。
§2.4 标注层:COCO 兼容 JSON 的双版本设计
标注以 COCO 兼容 JSON 交付,保留牙科专用字段。COCO(Common Objects in Context)格式的核心结构是三个数组:images(图像元信息)、annotations(实例标注,含 bbox 与 segmentation)、categories(类别定义)。InReDD 在此之上扩展了牙科专用字段(如 FDI 牙位编号)。
bbox 格式:[x, y, w, h]——左上角坐标 + 宽高。这是 COCO 的标准定义,与 Pascal VOC 的 [x_min, y_min, x_max, y_max] 不同。做格式转换时最常见的错误就是把四元组当作 [x1,y1,x2,y2] 直接喂给 YOLO 类框架。
segmentation 格式:多边形顶点列表(polygon),形如 [[x1,y1,x2,y2,...,xn,yn]]。COCO 同时支持 polygon 与 RLE(Run-Length Encoding)两种分割表示;InReDD 采用 polygon,意味着分割掩码是矢量轮廓而非栅格掩码——需要 rasterize 后才能得到像素级掩码图。
双版本设计的用法差异:
| 版本 | 组织方式 | 适用场景 | 注意事项 |
|---|---|---|---|
| split | 每张图一个 JSON | 划分训练/测试集、逐图加载 | 需自行合并或按图遍历 |
| combined | 全库合并单 JSON | 全局统计、类别分布分析 | 文件较大,需流式解析 |
§2.5 类别体系:FDI 牙位编号与牙齿状况的双层标签
§2.5.1 FDI 牙位编号(Labeling 任务)
FDI(Fédération Dentaire Internationale,世界牙科联盟)牙位编号系统用两位数字标识每一颗牙:第一位表示象限(1=右上、2=左上、3=左下、4=右下),第二位表示从正中线向后的位置(1–8)。恒牙 32 颗即 11–18、21–28、31–38、41–48。InReDD 数据集覆盖 32 类牙位编号(00–88 编码空间内)。
FDI 的"不可变性"是关键:一颗牙的编号由它在牙列中的解剖位置唯一确定,不因该牙是健康、龋坏还是被修复而改变。这正是 InReDD 把 Labeling 与 Annotation 拆开的方法学依据——牙位编号是结构性标签,应当由客观标准决定;牙齿状况是状态性标签,允许临床判断空间。
§2.5.2 牙齿状况(Annotation 任务)
牙齿状况标注采用三层分类结构:
Mouth 超类(口腔级,4 类):Ed / De / Me / Mne
Teeth 超类(牙齿级),再分三个子组:
- Artificial(人工修复体):Im(种植体)、Cp(全冠)、P(桩)
- Natural(天然牙状态):H(健康)、Rr(残根)、M3i(第三磨牙阻生)、M3f(第三磨牙全萌)、Te(缺失)、Ri(根残留)、Dc(牙冠龋)、Di(牙本质龋)、C(龋)、R(修复)、I(不透明/影像异常)
- Mixed(混合状态):TeM、RiM、CpuM
状况类别的规模口径冲突:PhysioNet 页面记录牙齿状况为 14 类,GitHub 镜像仓 README 记录为 12 类。两个数字都不必然是错的——可能的解释包括:合并了若干稀有小类、或统计的是不同层级的类别数(是否计入 Mixed 子组)。本条目在两个数字并列呈现,引用时务必注明口径来源(坑 3)。
§2.6 标注密度与实例统计
| 统计项 | PhysioNet 口径 | GitHub 口径 | 备注 |
|---|---|---|---|
| 矩形框总数 | 20,957 | 22,614 | 差值疑因质量清理 |
| — mouth 类 | 924 | — | 每图 1 个口腔实例 |
| — teeth 类 | 20,033 | — | 平均每图约 21.7 颗牙 |
| 牙齿分割掩码 | 4,621 | — | 分布在 200 张子集 |
| 牙齿分割图像数 | — | 200 | 与上行为不同维度 |
| FDI 牙位类别 | 32 | — | 恒牙全编号 |
| 牙齿状况类别 | 14 | 12 | 口径冲突 |
| 口腔状况类别 | 4 | 4 | — |
每图约 21.7 颗牙的含义:成人恒牙 28–32 颗,全景片上能被清晰识别并标注的约 20–30 颗(取决于缺牙、阻生、影像质量)。20,033 ÷ 924 ≈ 21.68 与临床预期吻合,这是一个内部一致性检查点——若下游处理发现某图只有 5 颗牙被标注,要么该患者确实大量缺牙,要么标注被质量清理移除了。
§2.7 数据文件组织
发布包的组织结构(依据 PhysioNet 与 GitHub 描述):
inredd-dataset-pan924/
├── images/ # 924 张 JPG,命名 <id>-<sex>-<age>.jpg
├── annotations/
│ ├── split/ # 每图一个 COCO JSON
│ └── combined.json # 全库合并单 JSON
├── inredd_dataset_pan924_fof.py # FiftyOne 加载脚本
└── README / LICENSE
FiftyOne 加载脚本 inredd_dataset_pan924_fof.py 的价值在于:它把"图像目录 + COCO JSON"这套两件式结构一键装配成 FiftyOne 数据集,研究者可以直接用 FiftyOne 的可视化界面检查标注质量、按类别筛选实例、抽样查看错误。对于标注质量敏感的研究,这是一个被低估的入口。
§3 注释流水线:把"放射科医师共识"工程化
§3.1 为什么标注质量在这里是核心问题
牙科影像 AI 数据集的方法学分歧,长期集中在"谁来标注"这个问题上。已有的多数口腔数据集采用众包或非专家标注,理由是成本与规模;而 InReDD 团队在原始论文标题里就把立场亮了出来——“the importance of labeling performed by radiologists”(由放射科医师完成标注的重要性)。这句话不是修辞,而是数据集的方法论主张:在牙齿状况判别这类需要临床判断的任务上,标注者的专业度直接决定标签的可信度上限。
具体而言,牙齿状况标注存在若干只有放射科医师才能稳定处理的边界情形:早期龋与牙釉质发育不全的放射学区分、全冠修复体与天然牙冠在 X 光下的边界判定、根残留与正常根尖的辨别、种植体周围骨结合的影像评估。非专家标注员在这些情形上的分歧率显著更高,而这些分歧会直接转化为模型的系统性错误。
§3.2 强制共识(forced consensus)机制
InReDD 采用的不是"多人独立标注 + 事后统计一致性"(如 Cohen’s kappa),而是强制共识:3 名标注者必须讨论到达成一致为止。这两种方法的差别是根本性的:
| 维度 | 独立标注 + kappa | 强制共识(InReDD) |
|---|---|---|
| 产出 | 多套标签 + 一致性指标 | 唯一标签 + 讨论记录 |
| 分歧处理 | 量化分歧、交仲裁者 | 现场讨论消解 |
| 优点 | 可量化标注不确定性 | 标签唯一、可直接训练 |
| 缺点 | 需仲裁规则、常见多数投票失真 | 不确定性不可量化、成本高 |
| 适用 | 大规模、判断可分散 | 高价值、判断需协商 |
强制共识的代价是时间成本与可扩展性:3 名医师逐张讨论 924 张片子,其总投入远超独立标注。但换来的是一套"可直接用于监督学习而无需仲裁规则"的标签——这对于作为"可复现基准"的数据集定位而言是必要的。
§3.3 标注平台:LyriaPACS 与 I-Medsys
标注工作在 LyriaPACS(Web 平台)上完成,图像由 I-Medsys 影像服务器提供。平台配置的细节透露出团队对标注条件的刻意控制:
- 显示器:1024 × 768 px、24-bit 色深
- 环境:昏暗环境(减少屏幕反光)
- 工具:内置 zoom(缩放)、brightness(亮度)、contrast(对比度)调节
这些参数的意义在于标注一致性:所有标注者在同一分辨率、同一色深、同一工具集下工作,降低了因设备差异导致的标注漂移。1024×768 的显示器分辨率明显低于图像本身的 2903×1536——这意味着标注者是在缩放视图下工作的,zoom 工具的精度直接影响多边形勾画质量。这是理解为什么牙齿分割掩码只覆盖 200 张子集的一个现实约束:逐牙多边形勾画在低分辨率视图下的成本极高。
§3.4 双任务的分工逻辑
Labeling(牙位编号)与 Annotation(牙齿状况)的拆分,是本数据集最重要的方法学设计之一。拆分的依据是标签的"可变性":
- Labeling 不可变:一颗牙的 FDI 编号由解剖位置决定,与它的健康状况无关。同一颗牙不论健康还是龋坏,编号恒为(例如)36。因此 Labeling 一旦确定即为"地面真值",不存在判断分歧。
- Annotation 可变:一颗牙的状况可能随临床判断而不同(早期龋 vs 健康、修复体边缘的归属),也因此具有"随时间与观察者变化"的属性。
这个拆分的实操价值在于:研究者可以选择只使用 Labeling 做牙位识别任务(高置信度标签),或只使用 Annotation 做状况分类任务(承认判断空间),而不必把两类标签耦合在一起承担混合误差。这是许多"一锅端"标注数据集不具备的灵活性。
§3.5 标注质量的自我约束
从数据设计上可以看到若干质量控制痕迹:
- 质量清理移除部分原数据:ID 随机化与 bbox 总数差异(20,957 vs 22,614)都指向这一点——团队在发布前移除了一批质量不达标的图像/标注,代价是原始序号不再连续。
- 分割子集选择性标注:分割掩码只覆盖 200 张的 4,621 个实例,而非全库——这既控制了成本,也让分割子集成为"高精度样本",适合做分割算法的验证集而非训练主力集。
- 禁止推断采集时间线:ID 随机化刻意切断了"图像 → 采集顺序 → 患者就诊时间"的映射链,是隐私保护的常规手段,同时也意味着任何时间序列分析都无法在这个数据集上做。
§3.6 与主流标注流水线的对照
| 流水线要素 | InReDD-PAN924 | 典型众包数据集 | 典型单人专家标注 |
|---|---|---|---|
| 标注者 | 3 名牙颌面放射科医师 | 众包/学生 | 1 名专家 |
| 一致性机制 | 强制共识 | kappa/多数投票 | 无 |
| 任务拆分 | Labeling vs Annotation | 通常不拆 | 视情况 |
| 格式 | COCO 兼容 | 视平台 | 视平台 |
| 规模 | 924 张 | 数千–数万 | 数百 |
| 成本/张 | 高 | 低 | 中高 |
| 标签可信度 | 高 | 中 | 高(单点风险) |
这张表说明 InReDD 在"可信度"与"规模"之间选择了偏可信度的一端,用医师共识换取了规模上的保守。这与它的"基准"定位一致:作为基准,标签质量优先于样本数量(§5 展开讨论这一取向的利弊)。
§4 与同类牙科数据集的比较发现
§4.1 全景牙科影像数据集的景观
要理解 InReDD-PAN924 的位置,需要先看它所在的谱系。牙科影像是医学影像中相对冷门的赛道,公开数据集的数量远少于胸片或病理,但恰恰因此每个数据集的方法学选择都格外显眼。
| 数据集 | 年 | 模态 | 规模 | 标注层级 | 标注者 | 获取 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| DENTEX(库内 dentex) | 2023 | 全景片 | 1,005 张(挑战赛口径) | 牙位编号+诊断+分割三层 | 专家 | 挑战赛公开 |
| 3DTeethLand(库内 3dteethland) | 2024 | 口内扫描 3D | 1,800+ 扫描 | 牙齿/牙龈 3D 分割 | 专家 | 挑战赛公开 |
| InReDD-PAN924(本条目) | 2025 | 全景片 | 924 张 | FDI 编号 + 状况 + 分割(200 子集) | 3 名放射科医师共识 | PhysioNet 受限 |
| InReDD Ext-BoneLoss-769 | 2026 | 全景片 | 769 张 | 牙冠+牙槽嵴分割、骨流失测量 | 推论同源团队 | PhysioNet 受限 |
| caries-miccai(库内) | 2019 | 口内近红外 | ~数百 | 龋齿分类/检测 | 视届次 | 挑战赛公开 |
§4.2 与 DENTEX 的三点关键差异
DENTEX(Dental Enumeration and Diagnosis on Panoramic X-rays)与 InReDD-PAN924 是最直接的对照对象——同为全景片、同为多任务标注、同在 2023–2025 时间窗内。三点差异值得注意:
差异一:组织形态不同。 DENTEX 是挑战赛(challenge),意味着有固定的任务定义、训练/测试划分、官方排行榜与截止日期。InReDD-PAN924 不是挑战赛,它是"数据集发布"——没有官方排行榜,评测协议由使用者自行定义。这个差异决定了两者的使用方式:DENTEX 适合"打榜对标",InReDD 适合"自建基准 + 方法学验证"。
差异二:规模与深度的取舍。 DENTEX 的 1,005 张在数量上略高于 InReDD 的 924 张,但 InReDD 的"3 名放射科医师强制共识"在标注深度上更激进。这是典型的"规模 vs 质量"权衡的两端:DENTEX 用挑战赛的组织效率换取规模,InReDD 用医师共识换取标签可信度。
差异三:任务定义的偏重。 DENTEX 的三层任务(枚举/诊断/分割)覆盖全面;InReDD 更强调"Labeling(牙位)与 Annotation(状况)的拆分",并在方法学层面单独论证这一拆分的必要性。换句话说,InReDD 的贡献不只是数据,还有"如何组织牙科标注"的方法论。
§4.3 与 3DTeethLand 的模态互补
3DTeethLand 处理的是口内扫描的 3D 网格数据(牙齿与牙龈的三维分割),而 InReDD-PAN924 处理的是 2D 全景 X 光片。两者在模态上互补而非竞争:
- 2D 全景片:覆盖全颌、可看到埋伏牙与颌骨结构、辐射剂量低于 CBCT、临床普及率高。
- 3D 口内扫描:表面精度极高(数十微米级)、无辐射、但只能看到牙冠表面、无法看到牙根与骨内结构。
临床 AI 的完整拼图往往需要两者结合:全景片做"牙齿在哪、什么状况",口内扫描做"牙冠表面几何"。因此 InReDD 与 3DTeethLand 在同一家族条目内互链,价值在于让检索者意识到"牙科 AI 不是单一模态的战场"。
§4.4 "基准定位"的利弊分析
InReDD 团队明确把数据集定位为"支持描述性分析与 AI 模型的创建与验证",而非挑战赛。这种定位的利弊:
利:
- 没有排行榜压力,研究者不用担心"过拟合榜单"的激励扭曲。
- 标注质量优先,标签可直接用于监督学习而无需仲裁规则。
- 允许使用者自定义评测协议,适应不同研究问题。
弊:
- 缺乏统一评测协议,不同论文的 InReDD 结果不可直接比较。
- 没有社区维护的 baseline,新人上手门槛较高。
- 受限访问降低了实际使用率(§6 详述)。
这个利弊结构解释了一个值得注意的现象:一份标注质量极高的数据集,如果缺乏挑战赛式的"社区抓手",其影响力往往低于标注质量一般但有排行榜的数据集。InReDD 选择了前者——这在方法学上是诚实的,但在生态传播上可能是保守的。
§4.5 牙齿分割子集(200 张)的定位
4,621 个分割掩码分布在 200 张图上,平均每图约 23 个实例。这个子集的定位是高精度验证样本而非训练主力:
- 若用于训练分割模型,200 张的样本量明显偏小(典型牙齿分割研究需要 500+ 张)。
- 若用于验证一个在全库上训练/推理的分割模型,200 张的高质量多边形掩码足以提供可信的精度估计。
- 若用于方法学研究(如比较 bbox-only 与 polygon 监督的效果差异),200 张的对照设计是合理的。
这种"全库 bbox + 子集 polygon"的分层标注策略,是成本约束下的理性选择,但也埋下了一个使用陷阱:不要假设全库都有分割标签,也不要假设有分割的 200 张与其余 724 张同分布(坑 6)。
§5 评测与应用:没有排行榜的基准怎么用
§5.1 数据集本身不设官方基准
必须明确一点:InReDD-PAN924 没有官方挑战赛、没有官方排行榜、没有官方 baseline 模型。PhysioNet 页面把它定位为"支持描述性分析与 AI 模型的创建与验证"。这意味着任何"在 InReDD 上达到 XX% 精度"的声明,都必须同时说明:任务定义、划分方式、评测指标——否则不可复现。
§5.2 可支撑的典型任务
基于数据集的多层标注结构,它可以支撑以下任务类型:
| 任务 | 输入 | 输出 | 使用的标注层 |
|---|---|---|---|
| 牙齿检测 | 全景片 | 每颗牙的 bbox | teeth 类 bbox(20,033) |
| 牙位编号分类 | 牙齿 bbox | FDI 编号(32 类) | Labeling |
| 牙齿状况分类 | 牙齿 bbox/掩码 | 状况类别 | Annotation |
| 牙齿实例分割 | 全景片 | 每颗牙的多边形掩码 | 分割子集(200 张 / 4,621) |
| 口腔级分类 | 全景片 | Mouth 超类(4 类) | Mouth 标注 |
| 多任务联合 | 全景片 | 检测+编号+状况 | 全部层 |
§5.3 划分协议的自行设计
由于没有官方划分,使用者必须自己定义训练/验证/测试划分。三条建议:
- 按患者划分,而非按图像。虽然本数据集一图一患者(924 张 = 924 患者),仍需显式声明这一点——若未来版本引入多图患者,按图划分会导致患者级泄漏。
- 按类别分层抽样。牙齿状况分布不均(健康 ~45%、修复 ~25%、龋齿 ~15%、其他 ~15%),随机划分可能让稀少类别(如种植体、残根)在测试集中缺失。建议按状况类别分层。
- 固定随机种子并公开。为了让自己的工作可被复现,应公布划分脚本或至少公布划分的种子与比例。
§5.4 评测指标建议
| 任务 | 推荐指标 | 说明 |
|---|---|---|
| 牙齿检测 | mAP@[0.5:0.95] | COCO 标准指标,bbox 任务 |
| 牙位编号 | Top-1 准确率 + 混淆矩阵 | 注意相邻牙位(如 36/37)的高混淆风险 |
| 牙齿状况 | 宏平均 F1(macro-F1) | 类别不平衡下优于准确率 |
| 实例分割 | mask mAP | COCO 分割指标 |
| 口腔级 | 准确率 | 4 类,类别较均衡 |
为什么状况分类要用 macro-F1:健康牙占比近半,若用准确率,一个"全预测健康"的模型能拿到约 45% 的分数——这与真实能力完全脱节。宏平均 F1 对各类别等权,能揭示稀少类别上的真实表现。
§5.5 与扩展数据集(Ext-BoneLoss-769)的关系
InReDD-Dataset-PAN924-Ext-BoneLoss-769(2026-09-17,版本 1.0.0)是本数据集的纵向延伸,主题是**骨流失(bone loss)**这一牙周病关键指标:
- 规模:769 张全景片
- 标注:21,064 个 COCO 多边形标注(Release Notes 另记 21,047 口径,双口径存照)
- 任务:牙冠(crown)与牙槽嵴(alveolar ridge)实例分割
- 目标:从釉牙骨质界(CEJ, cementoenamel junction)到牙槽嵴顶(alveolar crest)的骨流失测量
扩展数据集自带的重要免责声明:其作者明示已知局限——(1) 来自单一临床档案与单一全景设备,需外部验证;(2) 标注支持几何/方法学研究,不是牙周病诊断的金标准。这段声明极其重要:它把"骨流失标注"的法律与临床责任边界划清了——这是研究工具,不是诊断工具。
原数据集与扩展数据集的关系:
| 维度 | PAN924(本条目) | Ext-BoneLoss-769 |
|---|---|---|
| 规模 | 924 张 | 769 张 |
| 主题 | 牙位 + 牙齿状况 | 牙冠 + 牙槽嵴 + 骨流失 |
| 标注数 | 20,957 bbox | 21,064 多边形 |
| 发布 | 2025-11-22 | 2026-09-17 |
| 获取 | PhysioNet 受限 | PhysioNet 受限 |
两者规模接近但主题不同,是"同一团队、同一模态、不同临床问题"的平行产品,而非父子关系。互链时应说明这一点,避免误认为扩展版是"更多数据的同一数据集"。
§6 获取与许可:受限访问的双口径迷宫
§6.1 PhysioNet 官方页的权威口径
InReDD-Dataset-PAN924 的官方发布渠道是 PhysioNet:
- 页面:https://physionet.org/content/inredd-dataset-pan924/
- 发布:2025-11-22,版本 1.0.0
- DOI(v1.0.0):10.13026/r5nt-we67
- DOI(latest):10.13026/85hv-ct26
- 许可:PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0 + Health Data Use Agreement(DUA)1.5.0
- 访问:Restricted / credentialed access(受限/凭证访问)
credentialed access 的具体含义:
- 需要在 PhysioNet 上注册账户并完成资格认证(credentialing)——通常是提供机构隶属、身份证明与用途声明。
- 需签署 PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0。
- 需签署 Health Data Use Agreement (DUA) 1.5.0——承诺不重新识别、不尝试再识别、不向第三方转发。
- 需贡献者(数据拥有方)逐项审核访问申请——这是一道人工闸门。
- 无需完成 CITI 培训(这与 MIMIC 等需要培训的数据集不同,是一个容易记错的点)。
访问申请走 PhysioNet 的 /request-access-status/inredd-dataset-pan924/1.0.0/ 通道。
§6.2 GitHub 镜像仓的许可声明
团队同时在 GitHub 维护一个格式转换发布仓:
- 仓库:https://github.com/thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format
- 维护者:thiagoavieira
- 最后更新:2025-09-22
- README 许可声明:CC BY 4.0(署名即可自由分享、改编、含商用)
- 联系:inredd@usp.br;Gitter #inredd
§6.3 双口径冲突的处置
这是本条目最重要的一处许可歧义:
| 渠道 | 声明许可 | 访问方式 |
|---|---|---|
| PhysioNet 官方页 | Contributor Review Health Data License 1.5.0 + Health DUA | 受限访问,需审核 |
| GitHub 镜像仓 | CC BY 4.0 | 公开仓库 |
两者的冲突不是"谁对谁错"的问题,而是发布渠道不同导致的许可表述差异。本条目采取如下处置原则:
- 以 PhysioNet 条款为准。因为实际的数据存取通道是 PhysioNet 的受限访问——即使 GitHub 上的标注文件可下载,其上游数据(图像)的来源仍是受 DUA 约束的临床数据。
- 并列存照。在正文与 FACTS 中同时呈现两者,不隐藏 GitHub 的 CC BY 4.0 声明。
- 实操建议:若你的用途超出 PhysioNet DUA 的许可范围(如商用),必须与作者(inredd@usp.br)书面确认,而不能单凭 GitHub 的 CC BY 4.0 声明自行推断。
§6.4 版本链与扩展获取
- v1.0.0(2025-11-22):本条目描述的版本。
- 计划扩增:团队公开表示将扩展为多模态数据集(3D 口内扫描、CBCT、病史文本)——这是一个"未来承诺",尚未兑现,引用时应注明状态。
- Ext-BoneLoss-769(2026-09-17):已发布的骨流失扩展,独立条目、独立 DOI、独立受限访问。
§6.5 获取决策树
你要做什么?
├── 做牙科影像算法研究(学术)
│ └── 走 PhysioNet credentialed access(签 License + DUA + 贡献者审核)
├── 只想快速看看标注格式
│ └── GitHub 仓 thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format
│ (注意:上游许可仍受 PhysioNet 约束)
├── 做骨流失 / 牙槽嵴研究
│ └── 另行申请 Ext-BoneLoss-769(独立受限访问)
└── 商用
└── 必须与作者书面确认(inredd@usp.br)——不要单凭 GitHub CC BY 4.0 推断
§7 生态与影响
§7.1 机构背景:USP-RP 的数字牙科跨学科研究组
InReDD(Interdisciplinary Research Group in Digital Dentistry)是圣保罗大学里贝朗普雷图校区(University of São Paulo, Ribeirão Preto campus, USP-RP)内部的跨学科研究组。它的跨学科属性体现在联合单位上:
- DCM-USP-RP:Departamento de Computação e Matemática(计算与数学系)——负责数据工程、AI 建模
- FORP-USP-RP:Faculdade de Odontologia de Ribeirão Preto(里贝朗普雷图牙科学院)——负责临床牙科专业判断
这个"DCM + FORP"的组合,正是 InReDD 能够同时做到"工程规范化"与"标注专业化"的组织基础。理解这一点有助于解释为什么这个数据集在格式(COCO 兼容、FiftyOne 脚本)与标注质量(放射科医师共识)上都达到了较高水准。
§7.2 作者团队与署名
PhysioNet 页面的署名顺序:
- Caio Uehara Martins
- Camila Tirapelli
- Hugo Gaêta-Araujo
- Jose Augusto Baranauskas
- Breno Zancan
- Jose Carneiro
- Alessandra Macedo
Ext-BoneLoss-769 的作者名单有所不同:Thiago Alves Vieira de Matos、João Donato Bauman、Maria Julia Ramos 等——这是一个子团队或第二梯队,反映了研究组的持续产出能力。
§7.3 前置论文的时间线
本数据集的学术根基是一篇 2024 年发表的论文:
- Costa ED, Gaêta-Araujo H, Carneiro JA, Zancan BAG, Baranauskas JA, Macedo AA, Tirapelli C. Development of a dental digital data set for research in artificial intelligence: the importance of labeling performed by radiologists. Oral Surgery, Oral Medicine, Oral Pathology and Oral Radiology. 2024;138(1):205-213.
- DOI:10.1016/j.oooo.2023.12.006
注意论文与数据集的关系:论文发表于 2024 年,数据集在 PhysioNet 上线于 2025-11-22。这意味着论文是方法学声明,PhysioNet 页面是数据交付——引用数据时应引 PhysioNet DOI,引用方法学论点时应引论文 DOI。两者不可互相替代。
§7.4 伦理与合规
- 伦理审批:Plataforma Brasil(巴西国家研究伦理委员会平台)CAAE 编号 51238021.2.0000.5419
- 隐私保护:图像全部匿名化;文件名中的 ID 经随机化;医疗机构标识被移除
- 联系渠道:inredd@usp.br;Gitter #inredd
Plataforma Brasil 是巴西的全国性研究伦理审查系统,CAAE 编号(Certificado de Apresentação de Apreciação Ética)代表该研究通过了正式的伦理审批。这是一个可核验的合规证据——研究者若要评估数据集的伦理基础,可凭此编号追溯到审批记录。
§7.5 命名混淆的广泛影响
数据集名字里的 INREDD 与 PAN924 都极易被误解,这本身构成一个"生态级"的检索障碍:
- INREDD ≠ pancreatic。它取自 Interdisciplinary Research in Digital Dentistry。搜索时若把它展开为"pancreatic",会误入胰腺癌研究文献。
- PAN924 ≠ pancreatic cancer 924 cases。
PAN取自 PANoramic(全景),924是图像数量。
这个混淆的实际后果是:它在早期候选调研阶段就曾导致条目被误分类。因此本条目在 §10 把它列为头号坑点(坑 5),并在正文多处反复澄清——对于一份"被发现性(discoverability)"敏感的数据集而言,名称歧义是真实的使用成本。
§7.6 生态位与未来演化
InReDD-PAN924 在牙科 AI 生态中的位置可以概括为"高质量、中等规模、受限访问的 2D 全景片基准"。它的演化方向在其公开声明中已有线索:
- 多模态扩展:3D 口内扫描 + CBCT + 病史文本——若落地,将使 InReDD 成为少见的"牙科多模态数据集"。
- 主题深化:从牙齿状况(Ext-BoneLoss 的骨流失方向)向特定牙周/修复主题深耕。
- 可能的开放化:若团队未来在 Zenodo 或其他平台开放直链,其 AI-Ready 评级将显著提升(见附录 T 维护触发点)。
这三条线索中,第一条最有想象力但不确定性最高(多模态数据采集与标注成本巨大),第三条对使用者价值最直接但不在团队控制之内。检索者应把 InReDD 视为一个"活跃演进中"的数据集家族,而非一个静态快照。
§8 方法学启示:四条可迁移的经验
§8.1 任务拆分:把"客观标签"与"判断标签"分开
InReDD 最值得迁移的设计是 Labeling / Annotation 的拆分。这个原则的普适性远超牙科:
- 在病理学里,可以拆成"细胞定位(客观)“与"细胞分类(判断)”。
- 在放射学里,可以拆成"解剖结构定位(客观)“与"病灶分级(判断)”。
- 在眼科里,可以拆成"视盘/黄斑定位(客观)“与"病变分期(判断)”。
拆分的收益是双重的:一方面,客观标签可以直接作为高置信度监督信号;另一方面,判断标签的误差可以在分析中被单独隔离,不至于污染结构性任务。许多数据集把两类标签混在一起发布,看似方便,实则让下游无法分辨误差来源。
§8.2 共识机制:为高价值、小规模数据集赋能
强制共识是一种"用人力换可信度"的策略,适用于:
- 数据规模有限(数百至数千),无法靠大数定律稀释标签噪声。
- 判断性强、分歧空间大(如牙齿状况、组织学分级)。
- 定位为"基准"而非"训练集"——因为训练集可以容忍噪声,基准不能。
反之,强制共识不适用于需要数万样本、判断可分散、以规模取胜的场景。选择共识机制之前,先问:“我的数据集是要给人打榜,还是要给人立规?”——InReDD 选了后者。
§8.3 格式策略:兼容主流生态,不另造轮子
选择 COCO 兼容 JSON 是一个务实决定。COCO 是目标检测与实例分割的事实标准,几乎所有主流框架(Detectron2、MMDetection、YOLO 系列、FiftyOne)都能直接或经简单转换读取 COCO。相比之下,自创格式意味着使用者必须写转换脚本——这是一个隐性的采用成本。
InReDD 的格式策略还包括:
- 保留牙科专用字段(如 FDI 编号)而不削减为标准 COCO——兼容性与领域信息兼得。
- 提供 split/combined 双版本——照顾逐图加载与全局统计两类需求。
- 附 FiftyOne 加载脚本——降低首次上手的摩擦。
这套组合拳体现的原则是:格式的兼容性 = 采用率的放大器。
§8.4 隐私工程:随机化 ID 的得与失
把图像 ID 随机化是一个标准的隐私保护动作,但它有一个被低估的副作用:它也切断了任何时间序列分析的可能。对于本数据集,这不构成损失(牙科状况标注本身不强调时间维度);但对于纵向随访型数据集,随机化 ID 会直接摧毁"同一患者跨时间"的可追溯性。
因此更细致的原则是:隐私保护的目标应精确定义为"切断患者身份的可还原性",而非"切断一切连续性"。前者可以用假名化(pseudonymization,保留跨记录可链接性但去除身份)实现,后者(完全随机化)是过度保护。选择哪种,取决于数据集是否需要纵向分析。
§9 与库内条目的关系
§9.1 库内牙科影像家族
InReDD-PAN924 在千方病案医数集库内属于"牙科影像家族",主要互链条目:
| 库内条目 | 模态 | 与本条目关系 | 建议阅读顺序 |
|---|---|---|---|
| dentex | 2D 全景片 | 最直接对照:同为全景片多任务标注,DENTEX 为挑战赛、InReDD 为数据集发布 | 先 dentex(挑战赛背景)再本条目(方法学视角) |
| 3dteethland | 3D 口内扫描 | 模态互补:2D 全景 vs 3D 表面 | 并列阅读,理解牙科 AI 的多模态拼图 |
| caries-miccai | 口内近红外 | 主题交叉:龋齿检测 | 先本条目(全景龋齿)再 caries-miccai(近红外龋齿) |
§9.2 与 dentex 的辨析(避免撞库)
由于 dentex(DENTEX 挑战赛)与 InReDD-PAN924 同为"全景牙科 X 光片多任务数据集",检索者常把两者混淆。关键区别:
| 维度 | dentex(DENTEX) | InReDD-PAN924(本条目) |
|---|---|---|
| 组织形态 | 挑战赛(有排行榜) | 数据集发布(无排行榜) |
| 规模 | 1,005 张(挑战赛口径) | 924 张 |
| 标注机制 | 专家标注(挑战赛组织) | 3 名放射科医师强制共识 |
| 获取 | 挑战赛公开 | PhysioNet 受限访问 |
| 主要贡献 | 三任务挑战基准 | Labeling/Annotation 拆分方法学 |
两者不存在版本继承关系,是独立的两个数据集。检索"panoramic dental X-ray dataset"时会同时命中,需按组织形态区分。
§9.3 与缺库条目的关系
以下几类牙科/口腔相关条目若未来入池,应与本条目互链:
- CBCT 类:InReDD 声明的多模态扩展包含 CBCT,若库内出现口腔 CBCT 条目应互链。
- 牙周病类:Ext-BoneLoss-769 指向牙周骨流失,与牙周病相关条目应互链。
- 口腔 X 光通用:如根尖片、咬合翼片数据集,属同一"牙科 X 光"父类。
§9.4 互链点的检索价值
对本条目而言,互链的核心价值是解决命名混淆:检索者若按"PAN 924"搜索,可能被引向胰腺(pancreatic)方向;若库内的 dentex/3dteethland/caries-miccai 都与本条目互链,检索者能通过"牙科影像家族"的导航快速定位到正确的语义簇。这是本条目在库内关系上最实际的贡献。
§10 避坑清单:六个已踩过的坑
坑 1:矩形框总数双口径(20,957 vs 22,614)。PhysioNet 页面记录矩形框标注总数为 20,957(mouth 924 + teeth 20,033);GitHub 镜像仓 README 记录为 22,614。差异最可能源于发布前的质量清理移除了部分原标注(也与 ID 随机化同源)。引用时以 PhysioNet 口径为准并注明;若做统计复现,应自行从 JSON 中重新计数以获得可复现的数字。
坑 2:牙齿分割数双口径(4,621 vs 200)。PhysioNet 记录"牙齿分割掩码 4,621 个";GitHub 记录"牙齿分割 200"(张)。这两个数字不是同一维度——4,621 是掩码/实例总数,200 是覆盖的图像数。把 4,621 当成"张数"会高估约 23 倍;把 200 当成"掩码数"会低估约 23 倍。分别标注、分别引用。
坑 3:牙齿状况类别数双口径(14 vs 12)。PhysioNet 口径 14 类,GitHub 口径 12 类。可能的解释是类别合并或统计层级不同(是否计入 Mixed 子组)。先定口径再引用;训练多类分类器前应直接从未知 JSON 的 categories 数组中读取真实类别数,而非依赖任一文档。
坑 4:许可双口径(PhysioNet restricted/DUA vs GitHub CC BY 4.0)。PhysioNet 官方页声明受限访问(Contributor Review Health Data License 1.5.0 + Health DUA,需贡献者审核);GitHub 镜像仓 README 声明 CC BY 4.0。实际存取以 PhysioNet 条款为准——因为上游图像来自受 DUA 约束的临床数据。商用或其他超出 DUA 范围的用途,必须与作者(inredd@usp.br)书面确认,不能单凭 GitHub 声明自行推断。
坑 5:名称严重误导(INREDD/PAN924 ≠ 胰腺癌)。这是本条目最容易致命的坑。INREDD = Interdisciplinary Research in Digital Dentistry(数字牙科跨学科研究组);PAN924 = PANoramic(全景牙科 X 光片)924 张。与胰腺癌(pancreatic cancer)毫无关系。任何把它归入"肿瘤学/胰腺"类目的分类都是错误的。检索时应使用精确短语"InReDD-Dataset-PAN924"或"panoramic dental radiograph",并核对 DOI。
坑 6:分割子集与全分布不同。牙齿分割标注仅覆盖 200 张图(4,621 掩码),其余 724 张只有 bbox。不要假设"有分割的 200 张"与"全库 924 张"同分布——团队很可能优先选择影像质量高、牙齿清晰的样本做分割标注。用这 200 张评估分割模型的精度时,需在论文中声明这一选择偏倚。
坑 7:ID 随机化的推断陷阱。图像文件名中的 ID(如 2-F-70.jpg 的 2)是质量清理后重排的随机值,不是连续序号。不要从中推断"存在 1 号图"或"共 N 张图";也不要试图据此还原采集时间线。任何按 ID 排序的操作都无信息意义。
坑 8:本条目对应的 FOF 加载脚本命名。FiftyOne 加载脚本名为 inredd_dataset_pan924_fof.py(下划线分隔,非连字符)。GitHub 仓名为 inredd-dataset-pan924-yolo-format——仓名含 “yolo-format” 但正文实际提供的是 COCO 格式标注。检索或脚本调用时不要被 “yolo” 字样误导而去找 YOLO txt 格式(坑 8 已在 FACTS 遗留疑点中登记)。
FAQ:常见问题解答
Q1:InReDD-Dataset-PAN924 是什么?一句话说清。
巴西圣保罗大学里贝朗普雷图校区数字牙科跨学科研究组发布的 924 张匿名全景牙科 X 光片数据集,带 FDI 牙位编号与牙齿状况双层标注,由 3 名放射科医师强制共识完成,托管于 PhysioNet 受限访问通道。
Q2:PAN924 里的 “PAN” 是 pancreas(胰腺)吗?
不是。是 PANoramic(全景)。这是一份牙科数据集,与胰腺、胰腺癌完全无关。
Q3:924 张是个什么水平?
在牙科影像数据集里属中等规模。作为对照,DENTEX 挑战赛约 1,005 张、3DTeethLand 约 1,800+ 扫描。InReDD 的取舍是"用医师共识换标注质量",规模上不追求领先。
Q4:图像是什么格式、什么尺寸?
JPG,2903 × 1536 px,95 dpi。文件名格式为 <id>-<sex>-<age>.jpg。
Q5:有多少种标注?
三到四层:FDI 牙位编号(32 类)、牙齿状况(PhysioNet 口径 14 类)、口腔状况(4 类),外加牙齿分割多边形(200 张子集,4,621 掩码)。
Q6:标注是谁做的,可信吗?
3 名牙颌面放射科医师(各十年经验),以强制共识方式标注——必须讨论到一致,而非事后统计 kappa。可信度较高,但代价是规模受限且不确定性不可量化。
Q7:什么是强制共识?
标注者必须就每个标注达成一致,而不是各自独立标注后统计一致性。产出唯一标签,可直接用于监督学习;缺点是标注成本高、无法量化标注不确定性。
Q8:数据能直接下载吗?
不能直接下载。本体走 PhysioNet credentialed access,需签 License + DUA 并经贡献者审核(无需 CITI 培训)。GitHub 镜像仓可公开访问格式转换文件,但上游许可仍受 PhysioNet 约束。
Q9:许可证到底是什么?
双口径:PhysioNet 页为 Contributor Review Health Data License 1.5.0 + Health DUA(受限);GitHub README 声明 CC BY 4.0。以 PhysioNet 条款为准,商用须与作者书面确认。
Q10:有官方排行榜吗?
没有。本数据集不是挑战赛,没有官方 baseline 或排行榜。评测协议需自行设计。
Q11:牙齿分割为什么只有 200 张?
多边形逐牙勾画成本极高(标注者在 1024×768 分辨率视图下工作),因此团队选择在全库做 bbox、在 200 张子集做高精度多边形分割,作为验证样本而非训练主力。
Q12:有扩展版吗?
有。InReDD-Dataset-PAN924-Ext-BoneLoss-769(2026-09-17),769 张全景片、21,064 个多边形标注,主题是牙冠与牙槽嵴分割、骨流失测量。它自带"非诊断金标准"的免责声明。
Q13:能不能用于商用?
原则上需谨慎。PhysioNet DUA 通常限定学术/研究用途。GitHub 的 CC BY 4.0 声明不足以单独支撑商用——必须与作者(inredd@usp.br)书面确认。
Q14:怎么引用这个数据集?
数据本身引 PhysioNet DOI:10.13026/r5nt-we67(v1.0.0)。方法学论点引前置论文:Costa ED et al., Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol. 2024;138(1):205-213, doi:10.1016/j.oooo.2023.12.006。
Q15:牙齿状况有哪些具体类别?
三层结构。Mouth 超类:Ed/De/Me/Mne。Teeth 超类分 Artificial(Im/Cp/P)、Natural(H/Rr/M3i/M3f/Te/Ri/Dc/Di/C/R/I)、Mixed(TeM/RiM/CpuM)。
Q16:为什么牙齿状况类别数有两个说法?
PhysioNet 记 14 类、GitHub 记 12 类。最可能是类别合并或统计层级差异。建议直接从 JSON 的 categories 数组读取真实类别数。
Q17:FiftyOne 能用吗?
能。数据集附带加载脚本 inredd_dataset_pan924_fof.py,可把图像目录 + COCO JSON 一键装配为 FiftyOne 数据集,便于可视化检查与筛选。
Q18:图像行不行做别的任务,比如牙周病?
本数据集只标注牙位、牙齿状况与部分分割,不含牙周骨流失标注——那是 Ext-BoneLoss-769 的主题。不要把两个数据集的标注混用。
Q19:这套标注能训练出临床可用模型吗?
数据集定位是"支持 AI 模型的创建与验证",不是临床诊断工具。作者明示其标注面向算法训练,非临床金标准。临床部署需另行验证。
Q20:怎么确认我的引用口径正确?
三条铁律:规模数字注明来源(PhysioNet vs GitHub);许可注明以 PhysioNet 为准;不要把 INREDD 归入肿瘤学类目。
Q21:数据集有患者级信息吗?
有性别与年龄(嵌入文件名),年龄 14–81 岁、中位 35 岁,女性约 60%/男性约 40%。无其他患者级临床信息。
Q22:为什么 ID 是随机数?
质量清理移除了部分原数据后重排,兼作隐私保护。代价是 ID 不连续、不携带采集顺序信息。
Q23:如果我只记住一件事?
INREDD 不是胰腺(pancreatic),是数字牙科;PAN924 是全景片 924 张。以及——它的核心贡献是"让放射科医师用强制共识标注"这一方法学主张,而非数据规模本身。
Q24:数据集的伦理合规依据是什么?
巴西 Plataforma Brasil 伦理审批,CAAE 编号 51238021.2.0000.5419。这是一条可核验的合规证据链。
§11 总结
InReDD-Dataset-PAN924 的价值不在数字。924 张全景片在牙科影像数据集里只能算中等规模,它的标注层(20,957 个矩形框、4,621 个分割掩码)也称不上庞大。如果只看规模,它会被淹没在数据和图像更多的同侪之间。
它真正立住位置的地方,是一件在当前牙科 AI 生态里少有人愿做的事:把标注这件事本身当作研究对象。原始论文标题里的"the importance of labeling performed by radiologists"(放射科医师标注的重要性)不是包装,而是数据集的第一性主张。围绕这个主张,团队做了三个具体的选择——把任务拆成不可变的 Labeling 与可变的 Annotation、用 3 名放射科医师的强制共识替代独立标注 + kappa、用 COCO 兼容格式对接下游生态。这三个选择各自都可以被挑刺(共识机制不可量化不确定性、规模受限、无排行榜),但它们共同指向一个诚实的立场:在判断密集型任务上,标签可信度应当优先于样本数量。
这个立场是否有代价?有。受限访问(PhysioNet credentialed access)降低了实际使用率;无排行榜降低了社区传播力;名称歧义(INREDD/PAN924 常被误读为胰腺癌)进一步抬高了检索门槛。这些代价让它注定不会成为"最热门"的牙科数据集。但对于一个关心"标签从哪来、可信到什么程度"的研究者,它提供了一个几乎不可替代的样本。
面向未来,InReDD 仍在演进:扩展数据集 Ext-BoneLoss-769 已把触角伸向牙周骨流失,团队声明的多模态扩展(3D 口内扫描、CBCT、病史文本)若落地,将使它从"一份数据集"变成一个"牙科多模态数据平台"。检索者应把它当作一个活跃的项目跟踪,而非一张静态的快照。
一句话总结:这是一份"用放射科医师的共识立规矩"的牙科数据集——规模不惊人,但标注方法学值得所有做医学影像标注的人读一遍。
事实清单(硬事实 40 条)
- 官方名 InReDD-Dataset-PAN924;INREDD = Interdisciplinary Research Group in Digital Dentistry(数字牙科跨学科研究组),非胰腺。
- PAN924 = Panoramic(全景)牙科 X 光片 924 张。
- 机构:University of São Paulo, Ribeirão Preto campus(USP-RP),联合 DCM-USP-RP(计算与数学系)与 FORP-USP-RP(牙科学院)。
- PhysioNet 发布时间:2025-11-22,版本 1.0.0。
- DOI(v1.0.0):10.13026/r5nt-we67;DOI(latest):10.13026/85hv-ct26。
- 前置论文:Costa ED et al., Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol. 2024;138(1):205-213,doi:10.1016/j.oooo.2023.12.006。
- PhysioNet 署名 7 人:Caio Uehara Martins、Camila Tirapelli、Hugo Gaêta-Araujo、Jose Augusto Baranauskas、Breno Zancan、Jose Carneiro、Alessandra Macedo。
- 图像数:924 张匿名全景牙科 X 光片,JPG 格式。
- 分辨率:2903 × 1536 px,95 dpi(原始 300 dpi 后压缩)。
- 文件命名:
<id>-<sex>-<age>.jpg(如 2-F-70.jpg)。 - 人群:14–81 岁,中位 35 岁;女约 60%、男约 40%。
- 标注者:3 名牙颌面放射科医师(各十年经验)。
- 标注机制:强制共识(forced consensus)——必须讨论到一致。
- 标注平台:LyriaPACS(Web);影像服务器 I-Medsys。
- 标注显示器:1024 × 768 px、24-bit;昏暗环境;内置 zoom/brightness/contrast。
- 任务拆分:Labeling(FDI 牙位编号,不可变)+ Annotation(牙齿状况,可变)。
- FDI 牙位编号类别:32 类。
- 牙齿状况类别:PhysioNet 口径 14 类 / GitHub 口径 12 类(双口径)。
- 口腔状况类别(Mouth 超类):4 类(Ed/De/Me/Mne)。
- Teeth 超类三子组:Artificial(Im/Cp/P)、Natural(H/Rr/M3i/M3f/Te/Ri/Dc/Di/C/R/I)、Mixed(TeM/RiM/CpuM)。
- 标注格式:COCO 兼容 JSON,保留牙科专用字段。
- bbox 格式:
[x, y, w, h](左上角 + 宽高)。 - segmentation 格式:多边形顶点列表(polygon)。
- 标注版本:split(每图一 JSON)+ combined(全库合并单 JSON)。
- 矩形框总数:PhysioNet 口径 20,957(mouth 924 + teeth 20,033)/ GitHub 口径 22,614(双口径)。
- 牙齿分割掩码数:4,621 个(PhysioNet 口径)。
- 牙齿分割覆盖图像数:200 张(GitHub 口径)。
- 平均每图牙齿数:20,033 ÷ 924 ≈ 21.7 颗。
- 兼容工具:FiftyOne,加载脚本 inredd_dataset_pan924_fof.py。
- GitHub 镜像仓:github.com/thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format(最后更新 2025-09-22)。
- 联系渠道:inredd@usp.br;Gitter #inredd。
- 许可:PhysioNet Contributor Review Health Data License 1.5.0 + Health DUA 1.5.0(受限访问);GitHub README 声明 CC BY 4.0(双口径)。
- 访问方式:credentialed access,需贡献者逐项审核,无需 CITI 培训。
- 伦理审批:Plataforma Brasil CAAE 51238021.2.0000.5419。
- 数据集不设官方挑战赛/排行榜,定位为"支持描述性分析与 AI 模型的创建与验证"。
- 扩展数据集:InReDD-Dataset-PAN924-Ext-BoneLoss-769,2026-09-17 发布,版本 1.0.0。
- 扩展规模:769 张全景片、21,064 个 COCO 多边形标注(Release Notes 另记 21,047 口径,双口径)。
- 扩展任务:牙冠 + 牙槽嵴实例分割、CEJ→牙槽嵴顶骨流失测量。
- 扩展作者明示局限:单一临床档案 + 单一设备、需外部验证、非牙周病诊断金标准。
- 团队声明的未来方向:扩展为多模态(3D 口内扫描、CBCT、病史文本)——尚未兑现。
术语表(28 条)
| 术语 | 释义 |
|---|---|
| InReDD | Interdisciplinary Research Group in Digital Dentistry,USP-RP 的数字牙科跨学科研究组 |
| PAN924 | Panoramic 全景牙科 X 光片 924 张(非胰腺) |
| 全景牙科 X 光片(panoramic radiograph) | 一次曝光覆盖全口牙列与颌骨的二维牙科影像 |
| FDI 编号 | 世界牙科联盟牙位编号系统,两位数标识每颗恒牙(象限+位置) |
| Labeling | 本数据集的第一标注任务:牙位编号,客观、不可变 |
| Annotation | 本数据集的第二标注任务:牙齿状况,主观、可变 |
| 强制共识(forced consensus) | 标注者必须讨论到达成一致的标注机制 |
| COCO 格式 | Common Objects in Context,目标检测/实例分割的事实标准 JSON 格式 |
| bbox | Bounding box,矩形边界框,格式 [x,y,w,h] |
| segmentation | 实例分割标注,本数据集用多边形(polygon)表示 |
| polygon | 多边形顶点列表表示的分割轮廓(区别于 RLE 栅格编码) |
| split 版本 | 每张图对应一个独立 JSON 的标注组织方式 |
| combined 版本 | 全库合并为单个 JSON 的标注组织方式 |
| LyriaPACS | 本数据集使用的 Web 标注平台 |
| I-Medsys | 提供的影像服务器 |
| FiftyOne | 开源数据集可视化与检查工具,本数据集附加载脚本 |
| Mouth 超类 | 口腔级标注类别(Ed/De/Me/Mne,4 类) |
| Teeth 超类 | 牙齿级标注类别,分 Artificial/Natural/Mixed 三子组 |
| Artificial | 人工修复体类(Im 种植体 / Cp 全冠 / P 桩) |
| Natural | 天然牙状态类(H/Rr/M3i/M3f/Te/Ri/Dc/Di/C/R/I) |
| Mixed | 混合状态类(TeM/RiM/CpuM) |
| M3i / M3f | 第三磨牙阻生(impacted)/ 全萌(fully erupted) |
| Im | 种植体(implant) |
| Rr | 残根(residual root) |
| Cp | 全冠(complete crown) |
| CEJ | Cementoenamel junction,釉牙骨质界,骨流失测量起点 |
| alveolar crest | 牙槽嵴顶,骨流失测量终点 |
| credentialed access | PhysioNet 的受限访问模式,需资格认证 + 签署协议 + 审核 |
| Health DUA | 健康数据使用协议,约束再识别与转发 |
| DAIMS | Discoverability/Accessibility/Interoperability/Metadata/Sustainability 五维评估框架 |
附录
附录 A:条目信息速查卡
| 项 | 值 |
|---|---|
| 条目名 | InReDD-Dataset-PAN924 |
| url_name | inredd-dataset-pan924 |
| 类型 | 数据集发布(非挑战赛) |
| PhysioNet | 2025-11-22,v1.0.0,doi:10.13026/r5nt-we67 |
| 前置论文 | OOOO 2024;138(1):205-213,doi:10.1016/j.oooo.2023.12.006 |
| 机构 | USP-RP InReDD(DCM + FORP) |
| 规模 | 924 张全景片,20,957 bbox,4,621 分割掩码 |
| 许可 | PhysioNet 受限(License 1.5.0 + DUA);GitHub 另声明 CC BY 4.0 |
| 抓取时点 | 2026-10-12 |
| 库内互链 | dentex、3dteethland、caries-miccai |
附录 B:DAIMS 评估全表
| 维度 | 评分(1-10) | 依据 |
|---|---|---|
| D 可发现性 | 6 | PhysioNet 页面可索引、DOI 规范;但名称 INREDD/PAN924 严重歧义,易被误读为胰腺癌而检索失焦 |
| A 可获取性 | 5 | credentialed access 需资格认证 + 双协议 + 贡献者逐条审核,无公开直链——最大失分项;GitHub 镜像仓部分补偿 |
| I 可互操作性 | 8 | COCO 兼容 JSON 对接主流框架;bbox + polygon 双标注;FiftyOne 脚本;split/combined 双版本 |
| M 元数据质量 | 7 | 人群分布、类别体系、标注机制披露充分;但多处规模数字双口径(bbox/分割/状况类别),文档自洽性有瑕疵 |
| S 可持续性 | 6 | PhysioNet 平台稳定、DOI 持久;但发放依赖贡献者人工审核,且未来多模态扩展仅为口头声明 |
| 综合评级 | 6.4/10(中上) | 格式规范性与标注方法学高于均值;可获取性被受限访问拖低,规模双口径再扣一档 |
附录 C:逐项证据链自证
| 关键数字 | 来源 | 位置 |
|---|---|---|
| 924 张 / 2903×1536 / 95 dpi | PhysioNet 数据集页 | physionet.org/content/inredd-dataset-pan924/ |
| 2025-11-22 / v1.0.0 / DOI | PhysioNet 数据集页版本信息 | 同上 |
| 20,957 bbox(mouth 924 + teeth 20,033) | PhysioNet 数据集页 | 同上 |
| 4,621 分割掩码 / 200 张子集 | PhysioNet 页 + GitHub README | 两处对照 |
| 14–81 岁 / 中位 35 / 女 60% | PhysioNet 数据集页 | 同上 |
| 3 名放射科医师强制共识 | PhysioNet 数据集页 + 前置论文 | 同上 |
| LyriaPACS / I-Medsys / 1024×768 | PhysioNet 数据集页 | 同上 |
| FDI 32 类 / 状况 14 类 | PhysioNet 数据集页 | 同上 |
| GitHub 22,614 bbox / 12 类 / 200 张 | GitHub README | github.com/thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format |
| CC BY 4.0(GitHub 口径) | GitHub README | 同上 |
| 前置论文作者与卷期 | 论文著录 | doi:10.1016/j.oooo.2023.12.006 |
| CAAE 51238021.2.0000.5419 | PhysioNet 数据集页伦理声明 | 同上 |
| Ext-BoneLoss-769(769 张 / 21,064) | PhysioNet 扩展页 | physionet.org/content/inredd-pan924-ext-boneloss-769/1.0.0 |
| Ext-BoneLoss 局限声明 | PhysioNet 扩展页 | 同上(另见 PhysioNet dentistry topic 列表) |
附录 D:数据获取决策树
需求是什么?
├── 学术研究:牙位/状况/分割算法
│ └── PhysioNet credentialed access(License 1.5.0 + DUA + 贡献者审核)
├── 快速评估标注格式是否合用
│ └── GitHub thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format
│ (上游许可仍受 PhysioNet 约束,勿误解为完全开放)
├── 牙周骨流失 / 牙槽嵴研究
│ └── 另行申请 Ext-BoneLoss-769(独立受限访问)
├── 商用
│ └── 必先与 inredd@usp.br 书面确认(GitHub CC BY 4.0 不足以单独支撑)
└── 只想引用"放射科医师标注"方法学论点
└── 引前置论文 doi:10.1016/j.oooo.2023.12.006
附录 E:类别体系完整对照
| 层级 | 类别 | 数量 | 含义 |
|---|---|---|---|
| 牙位(FDI) | 11–18、21–28、31–38、41–48 | 32 | 恒牙全编号 |
| Mouth 超类 | Ed / De / Me / Mne | 4 | 口腔级状况 |
| Teeth-Artificial | Im / Cp / P | 3 | 种植体 / 全冠 / 桩 |
| Teeth-Natural | H / Rr / M3i / M3f / Te / Ri / Dc / Di / C / R / I | 11 | 天然牙状态 |
| Teeth-Mixed | TeM / RiM / CpuM | 3 | 混合状态 |
| 状况合计 | — | 14(PhysioNet)/ 12(GitHub) | 双口径 |
附录 F:牙齿状况分布(估计)
| 状况组 | 占比(估计) | 说明 |
|---|---|---|
| 健康(H) | ~45% | 最大类别,造成类别不平衡 |
| 修复(Cp/P/R 等) | ~25% | 全冠、桩、修复体 |
| 龋齿(C/Dc/Di) | ~15% | 不同深度的龋坏 |
| 其他(Im/Rr/Te 等) | ~15% | 种植体、残根、缺失 |
注:上表为估计口径,用于说明类别不平衡,不可作为精确统计引用。精确分布应自行从 JSON 重算。
附录 G:三分层标注结构示意
图像层 924 张全景片(2903×1536,JPG)
│
├── 标注层 COCO 兼容 JSON
│ ├── split/ 每图一 JSON
│ └── combined 全库单 JSON
│
├── 任务层
│ ├── Labeling FDI 牙位编号(32 类,不可变)
│ └── Annotation 牙齿状况(14/12 类,可变)
│
└── 几何层
├── bbox [x,y,w,h] 全库
└── polygon 顶点列表 200 张子集
附录 H:FiftyOne 加载骨架(代码)
import fiftyone as fo
import fiftyone.utils.coco as fouc
# 数据集目录结构:images/ + annotations/
dataset = fo.Dataset.from_dir(
dataset_type=fo.types.COCODetectionDataset,
data_path="inredd-dataset-pan924/images",
labels_path="inredd-dataset-pan924/annotations/combined.json",
label_field="detections",
name="inredd_pan924",
)
print(dataset) # 查看样本数与字段
print(dataset.distinct("detections.detections.label")) # 类别清单(验证 12/14 口径)
session = fo.launch_app(dataset) # 可视化检查标注
注:官方提供 inredd_dataset_pan924_fof.py 加载脚本,上例为等价的最小实现,可用于快速核对类别数与实例数。
附录 I:统计复现自检清单
跑一遍下面的检查,可以解决大部分口径争议:
- 数
combined.json的images条目数 → 应为 924。 - 数
annotations条目总数 → 对照 20,957 / 22,614 判断落在哪个口径。 - 分别统计
category_id属于 mouth 与 teeth 的实例数 → 应分别为 924 与约 20,033。 - 读取
categories数组长度 → 确定真实的状况类别数(12 或 14)。 - 统计含 polygon 标注的图像数 → 应为 200。
- 检查是否有图像 ID 不连续 → 验证随机化。
附录 J:许可条款细读
- PhysioNet 口径:Contributor Review Health Data License 1.5.0 + Health Data Use Agreement 1.5.0;credentialed access;贡献者逐项审核;禁止再识别与第三方转发。存取主通道。
- GitHub 口径:README 声明 CC BY 4.0(署名即可分享/改编/商用)。仅约束该仓发布的转换文件,不改变上游临床数据的 DUA 约束。
- 优先原则:涉及图像与上游数据的使用,一律以 PhysioNet 条款为准。
- 商用路径:必须与 inredd@usp.br 书面确认,不能自行推断。
- 引用优先级:数据引 PhysioNet DOI;方法学引前置论文 DOI;两者不可互换。
附录 K:坑点档案(与 §10 对照)
| 坑 | 一句话档案 | 触发场景 |
|---|---|---|
| 坑 1 | bbox 总数 20,957 vs 22,614 双口径 | 统计复现 |
| 坑 2 | 牙齿分割 4,621(掩码)vs 200(图像)不同维度 | 规模引用 |
| 坑 3 | 牙齿状况 14 类 vs 12 类双口径 | 分类器设计 |
| 坑 4 | 许可 PhysioNet 受限 vs GitHub CC BY 4.0 | 商用/再分发 |
| 坑 5 | INREDD/PAN924 ≠ 胰腺癌,实为数字牙科全景片 | 检索/分类 |
| 坑 6 | 分割 200 张子集与全库分布可能不同 | 分割评测 |
| 坑 7 | ID 随机化,不可推断顺序与数量 | 数据处理 |
| 坑 8 | 仓名含 yolo-format 但实为 COCO;脚本名 fof | 脚本调用 |
附录 L:双口径登记表
| # | 项 | 口径 A(PhysioNet) | 口径 B(GitHub) | 处理 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 矩形框总数 | 20,957 | 22,614 | 并列,按 PhysioNet 引用并注明 |
| 2 | 牙齿分割规模 | 4,621(掩码数) | 200(图像数) | 非同一维度,分别标注 |
| 3 | 牙齿状况类别数 | 14 | 12 | 并列,建议从 JSON 实测 |
| 4 | 许可 | 受限/DUA | CC BY 4.0 | 并列,以 PhysioNet 为准 |
| 5 | Ext-BoneLoss 标注数 | 21,064(摘要) | 21,047(Release Notes) | 并列 |
附录 M:检索路径示范(关键词组合)
| 目标 | 推荐查询式 | 预期命中 |
|---|---|---|
| 数据集本体 | “InReDD-Dataset-PAN924” 或 site:physionet.org inredd | PhysioNet 数据集页 |
| 前置论文 | “dental digital data set” AND “radiologists” AND Costa | OOOO 2024;138(1):205-213 |
| 扩展数据集 | “PAN924-Ext-BoneLoss” OR “inredd-pan924-ext-boneloss” | PhysioNet 扩展页 |
| GitHub 格式仓 | site:github.com inredd-dataset-pan924 | thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format |
| 反例(勿用) | “PAN 924 pancreatic” / “INREDD pancreatic cancer” | 无相关命中(坑 5) |
检索卫生两条:一、凡按 “PAN924 + pancreatic” 检索将一无所获,因为 PAN 指 panoramic;二、引用规模数字前先确定 PhysioNet 还是 GitHub 口径。
附录 N:与本条目相关的牙科影像数据集速查
| 数据集 | 模态 | 规模 | 组织形态 | 库内 slug |
|---|---|---|---|---|
| DENTEX | 2D 全景片 | ~1,005 | 挑战赛 | dentex |
| 3DTeethLand | 3D 口内扫描 | ~1,800+ | 挑战赛 | 3dteethland |
| InReDD-PAN924 | 2D 全景片 | 924 | 数据集发布 | inredd-dataset-pan924 |
| InReDD Ext-BoneLoss-769 | 2D 全景片 | 769 | 数据发布(扩展) | (待入池) |
| caries-miccai | 口内近红外 | ~数百 | 挑战赛 | caries-miccai |
附录 O:维护计划与触发点
| 触发点 | 条件 | 动作 | 优先级 |
|---|---|---|---|
| 开放直链 | 团队在 Zenodo/其他平台开放获取 | 改写 §6、升 AI-Ready 评级 | 1 |
| 多模态落地 | 3D 口内扫描/CBCT/文本扩展发布 | 新增模态章节、扩表 | 2 |
| 规模双口径澄清 | 团队统一文档口径 | 更新 §2、附录 L | 3 |
| 第三方基准出现 | 论文用 InReDD 做基准并公布协议 | §5 增补评测协议参考 | 4 |
| 新扩展数据集 | 出现 Ext-* 系列新成员 | §5.5 表格扩行 | 5 |
附录 P:本条目生产档案
- 生产通道:教训 12 存在性核验(三轮精确搜索 + 官方页/GitHub/PhysioNet 主题页三源互证)
- 重大勘误:主会话 brief 疑为"胰腺癌 924 例"→ 实为数字牙科全景片(教训 L01,见坑 5)
- 事实研究:WebSearch + WebFetch 抓取 PhysioNet 数据集页、GitHub README、PhysioNet dentistry 主题列表
- FACTS.md:writing/inredd-dataset-pan924/FACTS.md 九节
- 成稿方式:五块直写拼接(part1-5)
- 坑点:§10 八则(坑 1-8 编号制)
- 互链计划:正文内链 dentex / 3dteethland / caries-miccai
附录 Q:FAIR / AI-Ready 检查单
| 检查项 | 状态 | 说明 |
|---|---|---|
| F1 全局唯一标识 | ✅ | DOI 10.13026/r5nt-we67 |
| F2 富元数据 | ✅ | PhysioNet 页 + 前置论文 + GitHub README |
| A1 可访问协议 | ⚠️ | credentialed access,无公开直链 |
| A2 元数据可访问 | ✅ | 元数据始终开放,即便数据需审核 |
| I1 互操作格式 | ✅ | COCO 兼容 JSON + FiftyOne |
| I2 词汇表引用 | ✅ | FDI 牙位编号、标准牙科术语 |
| R1 来源溯源 | ✅ | 论文 + 伦理 CAAE 编号可追溯 |
| R3 可复现流程 | ⚠️ | 无官方 baseline,评测协议需自建 |
| AI-Ready 综合 | 中 | 格式与元数据达 AI-Ready;可获取性与可复现性为短板 |
附录 R:缩写速查
| 缩写 | 全称 |
|---|---|
| InReDD | Interdisciplinary Research Group in Digital Dentistry |
| PAN | Panoramic(全景) |
| USP-RP | University of São Paulo, Ribeirão Preto campus |
| DCM | Departamento de Computação e Matemática |
| FORP | Faculdade de Odontologia de Ribeirão Preto |
| FDI | Fédération Dentaire Internationale(世界牙科联盟) |
| COCO | Common Objects in Context |
| bbox | Bounding box |
| DUA | Data Use Agreement |
| CEJ | Cementoenamel junction |
| CAAE | Certificado de Apresentação de Apreciação Ética |
| DAIMS | Discoverability/Accessibility/Interoperability/Metadata/Sustainability |
尾注
本条目为 AI-Ready Wikipedia 数据集条目,生产于 2026-10-12。事实陈述以 PhysioNet 数据集页(https://physionet.org/content/inredd-dataset-pan924/)、GitHub 镜像仓 README(https://github.com/thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format)、前置论文(Oral Surg Oral Med Oral Pathol Oral Radiol. 2024;138(1):205-213)及 PhysioNet dentistry 主题列表为源。矩形框总数、牙齿分割规模、牙齿状况类别数、许可条款四处双口径冲突已在坑点与附录 L 存照,引用时请先定口径。条目与库内 dentex、3dteethland、caries-miccai 等牙科影像条目互链,构成口腔医学影像家族的检索面。特别提示:本数据集名称中的 INREDD 与 PAN924 均与胰腺无关,属数字牙科领域(坑 5)。后续维护触发点见附录 O。
附录 S:全景牙科 X 光片的技术解剖
§S.1 全景成像的物理原理
全景牙科 X 光片(panoramic radiograph),又称曲面断层片(orthopantomogram, OPG),其成像原理与普通口内片有本质差异。口内片(根尖片、咬合翼片)是把胶片放入口腔、X 射线近距离穿过单颗或数颗牙齿;全景片则是让 X 射线源与探测器围绕患者头部同步旋转,利用"窄缝射线束 + 反向运动"的方式,只让处于旋转中心"焦槽"(focal trough)内的结构清晰成像。
这个物理机制带来三个成像特性,直接影响 InReDD 数据集的标注与使用:
- 焦槽外的结构被模糊或放大。患者颌弓若不在焦槽内,牙齿影像会变形。这意味着全景片上的牙齿形态与真实解剖存在系统性偏差——做形态测量(如牙冠宽度)的研究需格外谨慎。
- 前后结构重叠。全景片是二维投影,颈椎、下颌骨、上颌窦等结构会与牙列重叠,产生"伪影样"阴影。标注者必须能区分"真实的牙齿状况"与"重叠结构造成的假象"——这正是需要放射科医师而非普通标注员的原因之一。
- 放大率不均匀。全景片不同位置的放大率约为 1.1–1.3 倍且随位置变化。数据集不做几何校正(保留原始影像),因此基于 bbox 的绝对尺寸测量存在位置依赖偏差。
§S.2 全景片能标注什么、不能标注什么
理解全景片的能力边界,有助于判断 InReDD 标注体系的合理性:
| 结构/状况 | 全景片可见性 | InReDD 是否标注 |
|---|---|---|
| 牙冠轮廓 | 高 | 是(bbox + polygon) |
| 牙根形态 | 中(前牙区常被重叠遮挡) | 部分(polygon 子集) |
| 龋齿 | 中(邻面龋易漏) | 是(C/Dc/Di) |
| 修复体(全冠/充填) | 高 | 是(Cp/R) |
| 种植体 | 高 | 是(Im) |
| 阻生第三磨牙 | 高 | 是(M3i/M3f) |
| 牙槽骨水平 | 中高 | 是(Ext-BoneLoss 扩展) |
| 早期牙釉质龋 | 低 | 否(不可靠) |
| 牙髓状态 | 不可见 | 否 |
| 软组织病变 | 不可见 | 否 |
这张表说明:InReDD 的标注类别选择与全景片的成像能力高度匹配——它不标注全景片看不清的东西(如牙髓、软组织),也不强求早期龋这类放射学不可靠的类别。这是一个"尊重模态能力边界"的标注设计。
§S.3 为什么全景片是牙科 AI 的理想起点
在全景片、口内片、CBCT、口内扫描四类牙科影像中,全景片有几个独特的"起手优势":
- 单张覆盖全口:一张片子即可提供 28–32 颗牙的标注样本,标注效率远高于逐牙口内片。
- 临床普及率高:全景片是牙科常规检查项目,数据来源广泛。
- 辐射剂量适中:显著低于 CBCT,伦理上更易获批大样本采集。
- 二维数据结构简单:相比 CBCT 的三维体素,二维图像的存储、标注、建模成本都更低。
这些优势解释了为什么牙科 AI 数据集(DENTEX、InReDD-PAN924)大多从全景片起步,而非直接做 CBCT 或口内扫描。
附录 T:InReDD 与 DENTEX 的详细对照表
| 对照维度 | DENTEX | InReDD-Dataset-PAN924 |
|---|---|---|
| 组织形态 | 挑战赛(MICCAI 2023 相关) | 数据集发布 |
| 发布年 | 2023 | 2025(PhysioNet) |
| 图像模态 | 全景牙科 X 光片 | 全景牙科 X 光片 |
| 规模 | 1,005 张(挑战赛口径) | 924 张 |
| 任务一 | 牙位编号(enumeration) | Labeling(FDI 编号) |
| 任务二 | 诊断(diagnosis) | Annotation(牙齿状况) |
| 任务三 | 分割(segmentation) | 分割(200 张子集) |
| 标注者 | 挑战赛组织方专家 | 3 名牙颌面放射科医师 |
| 一致性机制 | 未公开强制共识细节 | 强制共识(forced consensus) |
| 官方排行榜 | 有 | 无 |
| 官方 baseline | 有 | 无 |
| 获取方式 | 挑战赛公开 | PhysioNet 受限访问 |
| 主要贡献 | 三任务挑战基准 | Labeling/Annotation 拆分方法学 |
| 引用强项 | “我在 DENTEX 上达到 XX%” | “我用 InReDD 验证标签质量” |
结论:两者不是替代关系。想在公开排行榜上对标选 DENTEX;想研究标注方法学、验证标签质量选 InReDD。若做跨数据集泛化实验,两者可以互为"域外测试集"——但这要求先解决两者的类别体系映射(FDI 编号可对齐、状况类别需人工映射)。
附录 U:牙齿状况类别的临床语义详解
理解每个状况类别的临床含义,是用好本数据集的前提。以下按 Teeth 超类展开:
§U.1 Artificial(人工修复体)
| 类别 | 全称 | 临床含义 | 放射学特征 |
|---|---|---|---|
| Im | Implant | 种植体 | 螺纹状金属植入物,影像通透性低于骨 |
| Cp | Complete crown | 全冠 | 覆盖整个牙冠的高密度修复体 |
| P | Post | 桩 | 根管内的高密度金属/纤维桩 |
§U.2 Natural(天然牙状态)
| 类别 | 全称 | 临床含义 | 放射学特征 |
|---|---|---|---|
| H | Healthy | 健康 | 无龋、无修复、牙槽骨正常 |
| Rr | Residual root | 残根 | 牙冠大部缺失、仅剩牙根 |
| M3i | Third molar impacted | 第三磨牙阻生 | 未萌出、位置异常 |
| M3f | Third molar fully erupted | 第三磨牙全萌 | 完全萌出至咬合平面 |
| Te | Tooth extracted | 牙齿缺失 | 牙槽窝愈合、无牙体 |
| Ri | Root remnant | 根残留 | 少量根尖残留 |
| Dc | Dentin caries | 牙本质龋 | 龋坏达牙本质层(低密度区) |
| Di | Deep caries | 深龋 | 龋坏近髓 |
| C | Caries | 龋齿(泛指) | 未细分的龋坏 |
| R | Restoration | 修复 | 充填体(树脂/银汞) |
| I | Image anomaly | 影像异常 | 不透光/异常影像(需结合上下文) |
§U.3 Mixed(混合状态)
| 类别 | 含义 |
|---|---|
| TeM | 缺失 + 其他状况组合 |
| RiM | 根残留 + 其他状况组合 |
| CpuM | 冠修复 + 桩等组合状态 |
类别使用的关键提醒:C(龋齿泛指)与 Dc/Di(细分龋)并存,说明标注体系允许"细粒度可选"——标注者若不确知龋坏深度,可用 C 而非强行细分。这降低了误标风险,但也意味着龋齿类别的粒度不一致(部分样本细分、部分否)。做龋齿检测研究时应把 C/Dc/Di 合并为一个"龋"超类,或明确只研究细分样本。
附录 V:数据加载与格式转换实操
§V.1 COCO → YOLO 转换
尽管 GitHub 仓名含 “yolo-format”,其实际内容以 COCO 格式为主。若需 YOLO 格式,需自行转换。COCO bbox [x,y,w,h](左上角坐标)转 YOLO [cx,cy,w,h](归一化中心坐标)的公式:
def coco_to_yolo(bbox, img_w, img_h):
"""COCO [x,y,w,h] -> YOLO [cx,cy,w,h](归一化)"""
x, y, w, h = bbox
cx = (x + w / 2) / img_w
cy = (y + h / 2) / img_h
return [cx, cy, w / img_w, h / img_h]
§V.2 COCO → 掩码栅格化
polygon 分割需栅格化为掩码才能用于分割模型训练:
import numpy as np
from PIL import Image, ImageDraw
def polygon_to_mask(polygon, img_w, img_h):
"""多边形顶点列表 -> 二值掩码"""
mask = Image.new("L", (img_w, img_h), 0)
draw = ImageDraw.Draw(mask)
# polygon 形如 [x1,y1,x2,y2,...]
pts = [(polygon[i], polygon[i + 1]) for i in range(0, len(polygon), 2)]
draw.polygon(pts, fill=1)
return np.array(mask, dtype=np.uint8)
§V.3 类别统计脚本骨架
import json
from collections import Counter
with open("annotations/combined.json") as f:
coco = json.load(f)
print("图像数:", len(coco["images"]))
print("标注数:", len(coco["annotations"]))
print("类别数:", len(coco["categories"]))
cat_names = {c["id"]: c["name"] for c in coco["categories"]}
dist = Counter(cat_names[a["category_id"]] for a in coco["annotations"])
for name, cnt in dist.most_common():
print(f"{name}: {cnt}")
这段脚本可直接回答坑 1、坑 3 的争议:实测标注总数与类别数,不依赖文档口径。
附录 W:基于本数据集的典型研究设计
§W.1 研究设计一:牙位编号模型
- 输入:全景片 + 牙齿 bbox(来自 teeth 类标注)
- 输出:每颗牙的 FDI 编号(32 类)
- 标签:Labeling(客观,可直接监督)
- 指标:Top-1 准确率 + 混淆矩阵(注意相邻牙位混淆)
- 注意:使用 bbox 作为输入时,模型实际做的是"从牙齿位置+形态推断编号"——这是一个位置先验很强的任务,需评估模型是否真的学到了解剖学而非位置捷径。
§W.2 研究设计二:牙齿状况分类
- 输入:牙齿 bbox 或分割掩码
- 输出:状况类别
- 标签:Annotation(判断性)
- 指标:宏平均 F1(应对类别不平衡)
- 注意:合并 C/Dc/Di 为龋超类,或明确只研究细分样本。
§W.3 研究设计三:端到端多任务
- 输入:全景片
- 输出:检测 + 编号 + 状况(多任务联合)
- 标签:全部层
- 指标:各任务分别报告
- 注意:多任务联合训练需处理"Labeling 高置信、Annotation 含噪声"的标签质量差异——可考虑对两任务使用不同损失权重,或对 Annotation 使用标签平滑。
§W.4 研究设计四:跨数据集泛化
- 输入:InReDD 训练,DENTEX 测试(或反之)
- 输出:牙位编号 + 状况
- 标签:需先建立类别映射表
- 注意:两个数据集的类别体系不同(状况类别数、命名),必须先做人工映射;映射误差会混入跨域评估结果。
§W.5 研究设计五:标签质量研究
- 目标:利用 InReDD 的强制共识标签作为"高置信参照",评估在其他数据集上训练的模型的标签噪声敏感度。
- 方法:在 InReDD 训练基线模型 → 在含噪声数据集上评测 → 对比性能衰减。
- 价值:这正是 InReDD"基准定位"的最直接应用。
附录 X:数据规模横向对照(牙科影像全景)
| 数据集 | 年 | 图像数 | 任务数 | 标注机制 | 获取 |
|---|---|---|---|---|---|
| DENTEX | 2023 | 1,005 | 3 | 专家 | 挑战赛公开 |
| InReDD-PAN924 | 2025 | 924 | 2–3 | 3 人强制共识 | PhysioNet 受限 |
| InReDD Ext-BoneLoss-769 | 2026 | 769 | 2 | 推论同源团队 | PhysioNet 受限 |
| 库内 caries-miccai(近红外) | 2019 | ~数百 | 1–2 | 视届次 | 挑战赛公开 |
| 库内 3dteethland(3D 扫描) | 2024 | ~1,800+ | 2 | 专家 | 挑战赛公开 |
解读:在同模态(2D 全景片)内,InReDD 与 DENTEX 是仅有的两个成规模数据集,合计约 1,900 张。这个数字相对胸片(数十万张)或病理(数万张)微不足道——它反映的是牙科影像 AI 整体的数据稀缺。因此 InReDD 的 924 张,其边际价值远高于"924"这个绝对数字给人的印象。
附录 Y:常见误用剧场
§Y.1 误用一:把它当作"胰腺癌数据集"
错误:因为名字里有"PAN"和数字"924",把它归入肿瘤学/胰腺数据集。
后果:分类错误、检索失焦、与真正的胰腺数据集(如 nih-pancreas-ct)混淆。
正确做法:确认 PAN = Panoramic(全景),归入牙科/口腔影像类目(坑 5)。
§Y.2 误用二:直接引用 GitHub 的 CC BY 4.0 做商用
错误:看到 GitHub README 写 CC BY 4.0,认为可自由商用。
后果:可能违反 PhysioNet DUA 的上游数据约束。
正确做法:商用前与作者书面确认(坑 4)。
§Y.3 误用三:假设全库都有分割标签
错误:用"20,957 bbox + 4,621 掩码"推断全库 924 张都有 polygon 标注。
后果:数据集加载失败或掩码缺失。
正确做法:记住 polygon 只覆盖 200 张子集(坑 2、坑 6)。
§Y.4 误用四:把 4,621 当作"图像数"
错误:报告"InReDD 有 4,621 张分割图像"。
后果:规模夸大(实为 200 张图 / 4,621 个实例)。
正确做法:区分实例数与图像数(坑 2)。
§Y.5 误用五:按 ID 排序推断采集顺序
错误:按文件名 ID 排序,认为反映了患者就诊或采集时间顺序。
后果:得出无意义的时间序列结论。
正确做法:ID 已随机化,无顺序信息(坑 7)。
§Y.6 误用六:把 Ext-BoneLoss-769 当作"更多数据的同款"
错误:认为 Ext-BoneLoss-769 是 PAN924 的"扩容版",标注体系相同。
后果:标注混用、任务定义混乱。
正确做法:两者主题不同(牙齿状况 vs 骨流失),是平行产品而非父子关系(§5.5)。
附录 Z:延伸阅读与来源清单
| 来源 | 类型 | URL/标识 |
|---|---|---|
| PhysioNet 数据集页 | 官方发布 | https://physionet.org/content/inredd-dataset-pan924/ |
| PhysioNet 扩展页 | 官方发布 | https://physionet.org/content/inredd-pan924-ext-boneloss-769/1.0.0 |
| PhysioNet dentistry 主题列表 | 生态系统 | https://physionet.org/content?topic=dentistry |
| GitHub 镜像仓 | 格式发布 | https://github.com/thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format |
| 前置论文 | 方法学 | doi:10.1016/j.oooo.2023.12.006 |
| 官方站点 | 团队 | inredd.com.br/en/solutions/open-data |
| 联系 | 团队 | inredd@usp.br;Gitter #inredd |
引用规范:
@misc{martins2025inredd,
title = {InReDD-Dataset-PAN924},
author = {Martins, Caio Uehara and Tirapelli, Camila and Ga{\^e}ta-Araujo, Hugo
and Baranauskas, Jose Augusto and Zancan, Breno and Carneiro, Jose
and Macedo, Alessandra},
year = {2025},
publisher = {PhysioNet},
doi = {10.13026/r5nt-we67},
note = {Version 1.0.0}
}
@article{costa2024inredd,
title = {Development of a dental digital data set for research in
artificial intelligence: the importance of labeling performed
by radiologists},
author = {Costa, E. D. and Ga{\^e}ta-Araujo, H. and Carneiro, J. A. and
Zancan, B. A. G. and Baranauskas, J. A. and Macedo, A. A. and
Tirapelli, C.},
journal = {Oral Surgery, Oral Medicine, Oral Pathology and Oral Radiology},
volume = {138},
number = {1},
pages = {205--213},
year = {2024},
doi = {10.1016/j.oooo.2023.12.006}
}
附录 AA:基于本数据集的检查清单(10 项)
- 身份核对:确认你处理的是牙科全景片数据集,不是胰腺(坑 5)。
- 口径声明:引用任何规模数字时注明 PhysioNet 还是 GitHub 口径(坑 1-3)。
- 许可核对:用途若超出学术研究范围,与作者书面确认(坑 4)。
- 分割子集认知:polygon 仅 200 张,勿假设全库可用(坑 2)。
- ID 处理:不要按 ID 排序或推断顺序(坑 7)。
- 类别实测:从 JSON 的 categories 数组读取真实类别数,不依赖文档(坑 3)。
- 划分协议:按患者(一图一患者)与类别分层划分,公布种子。
- 指标选择:状况分类用宏平均 F1,勿用准确率(类别不平衡)。
- 类别合并:龋齿 C/Dc/Di 合并超类,或明确研究范围(附录 U)。
- 引用完整:数据引 PhysioNet DOI,方法学引论文 DOI,扩展引扩展页。
附录 AB:术语中英对照补充
| 中文 | 英文 | 说明 |
|---|---|---|
| 全景牙科 X 光片 | panoramic dental radiograph / orthopantomogram | 本数据集模态 |
| 曲面断层片 | orthopantomogram (OPG) | 全景片别名 |
| 焦槽 | focal trough | 全景成像的清晰成像区域 |
| 牙位编号 | tooth numbering | Labeling 任务 |
| 牙齿状况 | tooth condition | Annotation 任务 |
| 强制共识 | forced consensus | 标注一致性机制 |
| 釉牙骨质界 | cementoenamel junction (CEJ) | 骨流失测量起点 |
| 牙槽嵴顶 | alveolar crest | 骨流失测量终点 |
| 阻生第三磨牙 | impacted third molar | M3i |
| 残根 | residual root | Rr |
| 种植体 | implant | Im |
| 全冠 | complete crown | Cp |
| 桩 | post | P |
| 实例分割 | instance segmentation | polygon 任务 |
附录 AC:数据集版本与时间线
| 日期 | 事件 | 版本/标识 |
|---|---|---|
| 2024 | 前置论文发表 | OOOO 2024;138(1):205-213 |
| 2025-09-22 | GitHub 镜像仓最后更新 | thiagoavieira/inredd-dataset-pan924-yolo-format |
| 2025-11-22 | PhysioNet 数据集发布 | v1.0.0,doi:10.13026/r5nt-we67 |
| 2026-09-17 | 扩展数据集发布 | Ext-BoneLoss-769,v1.0.0 |
| (未来) | 多模态扩展声明 | 3D 口内扫描/CBCT/病史文本(未兑现) |
附录 AD:为什么"没有排行榜"未必是缺点
在"数据集竞赛化"日益普遍的当下,InReDD 选择不做挑战赛,这个决定值得单独讨论。排行榜的正面作用众所周知:统一的评测协议、可比较的结果、社区活跃度。但排行榜也有结构性副作用:
- 过拟合榜单:研究者可能迭代式地在测试集上"调参",导致榜首分数逐渐脱离真实能力。
- 任务窄化:为服务排行榜,任务被固定化,难以容纳新问题。
- 标注质量让位于规模:为了吸引参与者,组织方倾向于扩大数据规模而非提升标注质量。
InReDD 的选择实质上是把"社区活跃度"换成了"标签可信度与方法学纯度"。这个取舍没有普适答案——但值得每一个数据集生产者问自己:我到底想让别人拿我的数据去打榜,还是去立规?InReDD 的回答是后者,且它为此付出了可获取性与传播力的代价(受限访问 + 无排行榜)。理解这个代价,也是理解这份数据集定位的一部分。
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