PRJNA88041：小鼠趾长伸肌延长收缩后的转录变化

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA88041

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数据说明

一、实验设计：a. 实验类型：时间进程 b. 实验因素：3月龄小鼠接受趾长伸肌（EDL）的延长收缩。在6小时和72小时收集EDL样本，并与未处理的对照进行比较。c. 实验中杂交次数：9次 d. 所有杂交是否使用共同参照：否 e. 质量控制步骤：所有芯片均来自同一批次。每个时间点进行三次重复杂交。二、所用样本、提取物、制备与标记：动物。九只雄性C57BL/6小鼠（3-4月龄，体重27.8 ± 3.3 g，Harlan Sprague-Dawley，印第安纳波利斯，印第安纳州）。肌肉损伤。六只小鼠的趾长伸肌（EDL）接受延长收缩。小鼠用2% avertin（0.015 ml/kg）麻醉，若小鼠对趾捏有反应则给予补充剂量。动物置于维持在37°C的有机玻璃平台上。右后肢股骨远端固定于螺钉之间，足部用胶带固定于平台。

切开暴露EDL远端肌腱，用4-0丝线将其固定于伺服电机（Aurora Scientific，加拿大安大略省列治文山）的杠杆臂上。将针电极置于腓神经附近以刺激踝背屈肌收缩（Grass Instruments，美国罗德岛州西沃里克）。通过在最适长度（Lo）下最大程度刺激踝背屈肌以产生力量，测定最大等长收缩力（Po）。为诱导肌肉损伤，以0.25 Hz的频率进行75次拉长收缩，持续5 min。每次拉长收缩时，以150 Hz刺激肌肉，并在刺激开始后100 ms进行牵拉。肌肉牵拉涉及相对于Lo的20%应变。在75次收缩后10 min评估力量缺损，随后用7-0丝线缝合切口。将动物放回笼中恢复，直至处死时。在通过颈椎脱位处死动物之前，将动物

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。