健康小鼠正常主动脉中膜血管平滑肌细胞单细胞RNA测序
该数据集为健康小鼠正常主动脉中膜血管平滑肌细胞的单细胞RNA测序数据，来源于NCBI。数据覆盖健康动脉中血管平滑肌细胞的转录组多样性，可用于解析细胞亚群的功能异质性、分化状态及发育差异，并支持对Rgs5高表达亚群等特定细胞群体的识别与研究，为血管稳态与重塑相关机制探索提供数据基础（来源 ncbi.n
基本信息
资源简介
健康小鼠正常主动脉中膜血管平滑肌细胞单细胞RNA测序
PRJNA799355 数据集收录的是健康小鼠正常主动脉中膜血管平滑肌细胞的单细胞RNA测序数据，来源为NCBI（ncbi.nlm.nih.gov）。该数据聚焦健康动脉中血管平滑肌细胞的转录组多样性，可用于解析细胞亚群的功能异质性、分化状态及发育差异，并支持对Rgs5高表达亚群等特定细胞群体的识别与研究，为血管稳态与重塑相关机制探索提供数据基础。数据集主题标签为转录组或基因表达，本站将其归入损伤、中毒及外因/其他分类。
【数据集背景】
血管平滑肌细胞（VSMC）亚群与血管疾病及损伤修复相关，此前已在健康血管和动脉粥样硬化相关研究中得到描述。然而，健康动脉中是否存在与血管稳态相关的VSMC亚群，以及这些亚群在血管重塑中的性质与命运，仍不清楚。该数据集正是针对这一问题，采用单细胞RNA测序（scRNA-seq）以无偏方式检测VSMC的功能异质性，从而揭示健康动脉中VSMC亚群的转录组多样性，以及各亚群在分化状态和发育上的显著异质性。源站描述特别提到，研究检测到一个独立的高表达G蛋白信号调节因子5（Rgs5）的VSMC亚群，与对照相比，该亚群上调了与抑制细胞增殖和细胞骨架构建相关的基因。
【数据内容】
该数据集为健康小鼠正常主动脉中膜血管平滑肌细胞的单细胞RNA测序数据，主题标签为转录组或基因表达。数据覆盖健康动脉中血管平滑肌细胞的转录组多样性，可用于解析细胞亚群的功能异质性、分化状态及发育差异，并支持对Rgs5高表达亚群等特定细胞群体的识别与研究。关于样本数量、测序平台、细胞数、基因数、数据文件格式与大小等具体信息，源站未提供。
【采集与来源】
数据来源于NCBI，数据集英文名称为PRJNA799355: Single-cell RNA sequencing of medial vascular smooth muscle cells of normal aorta from healthy mouse。研究对象为健康小鼠正常主动脉中膜血管平滑肌细胞，采用单细胞RNA测序技术获取转录组信息。除上述来源与对象信息外，采样地点、采样时间、伦理审批等细节源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于血管平滑肌细胞异质性研究，可用于识别健康动脉中不同的VSMC亚群，分析其分化状态与发育差异；适用于Rgs5高表达亚群等特定细胞群体的识别与特征研究；也可为血管稳态与重塑相关机制探索提供数据基础。此外，基于其转录组或基因表达主题，可用于相关基因表达模式的分析。关于该数据在具体疾病模型或临床场景中的直接应用，源站未提供。
【使用方法】
该数据集为单细胞RNA测序数据，使用时应以单细胞转录组分析的一般流程进行，包括数据获取、质量控制、细胞聚类、亚群注释、差异表达分析及特定标记基因（如Rgs5）表达特征分析等。具体的数据下载方式、文件组织、分析参数与配套代码，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于NCBI，研究对象为健康小鼠正常主动脉中膜血管平滑肌细胞，样本类型与物种范围有限。关于测序深度、细胞存活率、批次效应、数据完整性等质量指标，源站未提供。使用时应考虑其仅反映健康小鼠主动脉中膜VSMC的转录组特征，不宜直接外推至其他物种、其他血管部位或疾病状态。
【引用与许可】
该数据集来自NCBI，引用时应遵循NCBI相关数据使用与引用规范，具体引用文献、作者信息及许可条款源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA799355
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
血管平滑肌细胞（VSMC）亚群与血管疾病及损伤修复相关，已在健康血管和动脉粥样硬化特征中被描述。然而，与血管稳态相关的VSMC亚群是否存在于健康动脉中，以及它们在血管重塑中的性质和命运如何，仍不清楚。在此，我们利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）以无偏倚的方式检测VSMC的功能异质性，结果表明健康动脉中的VSMC亚群呈现转录组多样性，且各亚群内分化状态和发育存在显著异质性。值得注意的是，我们检测到一个独立的VSMC亚群，其高表达G蛋白信号调节因子5（Rgs5），与一般亚群相比上调了与抑制细胞增殖和细胞骨架构建相关的基因，且主要富集于降主动脉。此外，在新内膜形成、腹主动脉瘤和动脉粥样硬化的血管组织中，Rgs5+ VSMC的比例显著降低或几乎消失。
Rgs5+血管平滑肌细胞亚群的特定时空特征表明，该亚群与血管稳态相关。综合我们的分析，我们识别出健康动脉中血管平滑肌细胞亚群与稳态相关的转录特征，这在一定程度上可能解释区域血管对动脉粥样硬化的抵抗力。总体设计：通过单细胞RNA测序检测正常小鼠主动脉组织中膜细胞层血管平滑肌细胞的功能异质性。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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