人拉伸性瘢痕与枕部健康真皮表达数据
该数据集来自 NCBI,包含人拉伸性瘢痕真皮与患者匹配的枕部头皮健康真皮的表达数据,主题为转录组或基因表达。源站描述围绕毛发移植中的皮肤松弛悖论,说明机械张力与瘢痕增宽的关系,并提及 Strip FUT 手术及部分患者术后瘢痕增宽现象

基本信息
资源简介
人拉伸性瘢痕与枕部健康真皮表达数据
该数据集来自 NCBI,英文名称为 PRJNA683787: Expression data from the dermis of human stretched scars and patient-matched healthy dermis from occipital scalps,收录于“损伤、中毒及外因 / 其他”分类之下,主题标签为转录组或基因表达。数据集包含人拉伸性瘢痕真皮与患者匹配的枕部头皮健康真皮的表达数据,其源站描述围绕毛发移植领域中的皮肤松弛悖论展开,说明机械张力与瘢痕增宽之间的关系,并提及 Strip FUT 手术及部分患者术后瘢痕增宽现象。整体而言,该数据集为研究皮肤机械张力、瘢痕形成与增宽机制提供了来自人体真皮组织的基因表达层面的资料。
【数据集背景】
源站描述指出,学界普遍认为愈合伤口周围皮肤机械张力升高会刺激纤维化级联事件,并导致瘢痕尺寸增大。然而,毛发移植领域的“松弛悖论”描述了与这一观点相反的现象。在 Strip Follicular Unit Transplantation(Strip FUT)手术中,外科医生从枕部头皮取下一条约 5 cm x 10 cm 的头皮皮肤条(具体尺寸取决于所需毛囊数量),随后从中获取毛囊并移植到秃发的前额头皮。多数头皮皮肤松弛度正常的患者愈合后形成狭窄的正常营养性瘢痕;而少数头皮非常松弛、残余皮肤张力较低的患者(14%)愈合后出现术后瘢痕增宽(4 - 12 mm)。这些在毛发移植领域被称为拉伸性瘢痕的瘢痕,往往……(源站描述在此处截断)。该数据集正是在这一临床现象背景下,针对拉伸性瘢痕真皮与患者匹配的健康枕部头皮真皮开展表达数据采集。
【数据内容】
该数据集的主题标签为转录组或基因表达,内容为人拉伸性瘢痕真皮与患者匹配的枕部头皮健康真皮的表达数据。数据以患者自身匹配的方式组织,即同一患者的拉伸性瘢痕真皮样本与其枕部头皮健康真皮样本相对应,便于在个体内比较瘢痕组织与健康组织的基因表达差异。关于样本数量、测序平台、具体基因数量或差异表达结果等信息,源站未提供。
【采集与来源】
数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称明确指向人拉伸性瘢痕真皮与患者匹配的枕部头皮健康真皮的表达数据。样本取材部位为枕部头皮,涉及拉伸性瘢痕真皮与健康真皮两类组织。源站描述提及 Strip FUT 手术中从枕部头皮取下皮肤条的操作,说明样本与毛发移植临床场景相关。关于具体的采集时间、伦理审批、样本处理流程与测序方法等细节,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题与样本设计,该数据集适用于转录组或基因表达层面的研究,尤其是围绕皮肤机械张力、伤口愈合、纤维化级联以及瘢痕增宽机制的分析。由于数据包含患者匹配的拉伸性瘢痕真皮与健康真皮,可用于个体内对照比较,探索拉伸性瘢痕形成相关的基因表达特征。此外,结合源站描述的毛发移植中皮肤松弛悖论,该数据集也可为理解低残余皮肤张力条件下瘢痕增宽现象提供表达数据支持。关于具体的分析应用案例或验证结论,源站未提供。
【使用方法】
该数据集来自 NCBI,可通过其公共数据平台获取与检索。使用时可将同一患者的拉伸性瘢痕真皮样本与枕部头皮健康真皮样本进行配对比较,围绕转录组或基因表达主题开展差异分析。关于数据下载格式、分析流程、软件工具与参数设置等具体使用指引,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集基于患者匹配设计,样本来自人枕部头皮的拉伸性瘢痕真皮与健康真皮,具有临床现象关联性。源站描述中提及部分患者术后瘢痕增宽的比例(14%)与瘢痕增宽范围(4 - 12 mm),但数据集本身的样本规模、测序深度、数据完整性及质量控制指标等信息,源站未提供。此外,源站描述在“These scars, referred to as stretched scars in the hair transplantation field, ofte”处截断,相关背景信息不完整。使用时应结合源站原始记录核实数据范围与适用条件。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov,英文名称为 PRJNA683787: Expression data from the dermis of human stretched scars and patient-matched healthy dermis from occipital scalps。关于引用方式、许可条款与使用限制,源站未提供。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA683787
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
众所周知,愈合伤口周围皮肤机械张力增高会刺激纤维化级联反应,并导致瘢痕面积增大。毛发移植领域中的松弛悖论描述了与此观点相反的现象。在条带式毛囊单位移植术(Strip FUT)中,外科医生从枕部头皮切取一条头皮皮肤(约5 cm x 10 cm,取决于所需毛囊数量),随后用于获取毛囊,并将其移植到秃发的额部头皮。大多数头皮皮肤松弛度正常的患者愈合后形成狭窄的正常营养性瘢痕,而少数头皮非常松弛、因此残余皮肤张力较低的患者(14%)愈合后则出现术后瘢痕增宽(4 - 12 mm)。这些瘢痕在毛发移植领域被称为牵拉性瘢痕,通常需要修复手术或向瘢痕内进行二次毛发移植。我们假设,牵拉性瘢痕具有不同于其他类型瘢痕的独特转录特征。
为确定牵拉性瘢痕的基因表达谱,我们使用Affymetrix微阵列对纤维化真皮及患者自身匹配的健康真皮进行了表达谱分析。总体设计:我们从3名因美观原因切除牵拉性瘢痕的患者中采集了全层皮肤样本。样本大小约为1 cm×2 cm,包含成熟(至少4年)且宽大(至少5 mm)的瘢痕及其周围健康皮肤。所有瘢痕均形成于毛囊单位移植(FUT)手术中为获取毛囊而切除皮肤后枕部头皮的手术部位。从样本的20 µm厚切片中分离瘢痕和健康真皮,并使用RNeasy Plus Mini Kit(Qiagen)提取RNA。利用RNA,使用Nugen Ovation V2合成第一链互补DNA(cDNA)。随后将其转化为双链
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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