PRJNA422197:TLR2与TLR4激活的SZ95皮脂腺细胞全基因组分析

该数据集来自NCBI,为TLR2与TLR4激活的SZ95皮脂腺细胞全基因组基因表达谱分析,包含TLR1/2(PAM3CSK4)和TLR4(LPS)激活后的差异表达基因及功能聚类数据

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基因组分类Transcriptome or Gene expression
PRJNA422197: Genome wide analysis of TLR2- and TLR4-activated SZ95 sebocytes

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-20

资源简介

PRJNA422197:TLR2与TLR4激活的SZ95皮脂腺细胞全基因组分析

该数据集来自NCBI,为TLR2与TLR4激活的SZ95皮脂腺细胞全基因组基因表达谱分析,包含TLR1/2(PAM3CSK4)和TLR4(LPS)激活后的差异表达基因及功能聚类数据。数据覆盖早期(6小时)炎症相关基因调控和晚期(24小时)脂质代谢变化,可用于研究Toll样受体在皮脂腺细胞中的作用机制、痤疮发病相关的炎症与脂质代谢通路,以及皮脂腺细胞免疫应答的转录组特征分析(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):Toll样受体(TLR)2和4在皮脂腺中活跃,在痤疮的发展中起核心作用。然而,关于它们对皮脂腺细胞的影响,目前所知有限。在这项工作中,我们对TLR1/2(PAM3CSK4)和TLR4(脂多糖[LPS])激活的SZ95皮脂腺细胞的差异调控基因进行了全局基因表达谱分析和功能聚类。TLR1/2和TLR4激活均以相似方式在早期时间点(6小时)促进炎症,调控涉及趋化性、伤口愈合和细胞增殖的基因,从而反映出比先前已知更复杂的细胞因子和趋化因子调控。重要的是,脂质代谢作为皮脂腺细胞的主要特征,仅在较晚时间点(24小时)受到影响,表明皮脂腺细胞在面对d时优先发挥促炎表型

【主题与分类】

主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:损伤、中毒及外因。

【获取与许可】

源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA422197

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    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
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数据说明

Toll样受体(TLR)2和4在皮脂腺中具有活性,在痤疮的发生发展中发挥核心作用。然而,关于其对皮脂腺细胞影响的认识仍然有限。本研究对TLR1/2(PAM3CSK4)和TLR4(脂多糖[LPS])激活的SZ95皮脂腺细胞中差异调控基因进行了全基因组表达谱分析及功能聚类分析。TLR1/2和TLR4激活均能在早期时间点(6小时)以相似方式促进炎症反应,调控参与趋化、伤口愈合和细胞增殖的基因,从而反映出比以往所知更为复杂的细胞因子和趋化因子调控网络。重要的是,脂质代谢——皮脂腺细胞的主要特征——仅在较晚时间点(24小时)受到影响,表明皮脂腺细胞在面对危险信号时优先发挥促炎表型。一项荟萃分析显示,上调最为显著的基因在痤疮中同样呈上调表达,进一步支持了本研究结果的生物学相关性。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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