PRJNA266631：巨大戟醇甲基丁烯酸酯在未受累皮肤与光化性角化病皮肤中诱导强烈炎症与创伤愈合反应

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA266631

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们研究了光化性角化病（AK）皮肤的转录组谱，并将其与未经治疗及经巨大戟醇甲基丁烯酸酯凝胶治疗后的未受累皮肤（US）匹配样本进行比较。我们发现AK具有独特的mRNA谱，可将其与未受累皮肤区分开来。特别是，许多与表皮发育和角质形成细胞分化相关的基因，如LCE3D、SPRR1A、PI3以及角蛋白家族中的若干基因，在AK0皮肤中高表达，而在US0中不表达，这与AK的角化过度特征相一致。局部应用巨大戟醇甲基丁烯酸酯对基因表达谱产生了深远影响，有趣的是，US中受影响的基因数量远多于AK。富集分析显示，US和AK对巨大戟醇甲基丁烯酸酯治疗的主要反应均为炎症反应、对创伤的反应以及伤口愈合。总体设计：分析了30份皮肤活检样本；6名AK患者每人5份。在开始治疗前，从一处AK皮损（AK0）和未受累皮肤（US0）采集基线活检样本。第三份活检样本在应用巨大戟醇甲基丁烯酸酯第1天后从一处AK皮损（AK1）采集。

第四次和第五次活检分别在第二次局部应用巨大戟醇甲基丁烯酸酯后一天，从一处光化性角化病病变（AK2）和未受累皮肤（US2）获取。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。