PRJNA1536382：整合bulk-RNA分析与网络毒理学识别环境内毒素诱导声带损伤的分子指标与治疗候选物
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1536382），主题为转录组或基因表达，属于损伤、中毒及外因/其他分类
基本信息
资源简介
PRJNA1536382：整合bulk-RNA分析与网络毒理学识别环境内毒素诱导声带损伤的分子指标与治疗候选物
PRJNA1536382 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的生物学研究项目，其完整英文标题为“Integrated bulk-RNA analysis and network toxicology identify molecular indicators and therapeutic candidates for environmental endotoxin-induced vocal fold injury”。从标题可以看出，该数据集围绕环境内毒素诱导的声带损伤这一主题，结合了 bulk-RNA 分析与网络毒理学两种研究手段，旨在识别相关的分子指标以及潜在的治疗候选物。该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，即转录组或基因表达，说明其核心数据属于基因表达层面的测量结果。在分类上，该数据集被归入“损伤、中毒及外因 / 其他”类别，与其研究环境内毒素所致声带损伤的定位相符。以下从多个方面对该数据集作进一步介绍。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 1536382。BioProject 是 NCBI 提供的一种资源组织形式，用于汇集与某一项研究计划相关的各类生物学数据。按照 NCBI 的说明，一个 BioProject 记录源自单一机构或联合体，围绕同一项研究倡议而建立，并为用户提供一个统一的入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。因此，PRJNA1536382 并非单一的一次测序实验，而是一个研究项目的汇总记录，其下可能关联转录组或基因表达相关的数据。该项目的科学背景是环境内毒素诱导的声带损伤，研究将 bulk-RNA 分析与网络毒理学相结合，试图从分子层面揭示损伤机制并寻找治疗靶点或候选药物。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。项目标题中提到的“bulk-RNA analysis”进一步指向基于 bulk RNA 的表达分析，即对样本中混合细胞群体的 RNA 进行测序或定量分析，从而获得基因表达谱。与此同时，项目还涉及“network toxicology”，即网络毒理学分析，用于从系统层面探讨环境内毒素的毒性作用机制。研究目标包括识别分子指标（molecular indicators）和治疗候选物（therapeutic candidates）。除上述信息外，关于样本数量、测序平台、具体基因列表、差异表达结果等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，具体为 NCBI BioProject 数据库中的一条记录，ID 为 1536382。其英文名称为“PRJNA1536382: Integrated bulk-RNA analysis and network toxicology identify molecular indicators and therapeutic candidates for environmental endotoxin-induced vocal fold injury”。源站标题显示为“Integrated bulk-RNA analysis and network toxicolog... (ID 1536382) - BioProject - NCBI”。关于样本采集的具体地点、时间、受试对象、伦理审批信息以及实验操作流程等，源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签与项目标题，该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景，尤其是关注环境内毒素诱导声带损伤的分子机制研究。研究人员可能将其用于探索声带损伤过程中的基因表达变化、筛选潜在的分子指标，或借助网络毒理学思路寻找治疗候选物。此外，对 bulk-RNA 分析方法或网络毒理学方法感兴趣的研究者，也可能参考该项目的设计思路。需要说明的是，以上适用场景系依据项目标题与主题标签所作的合理归纳，具体数据是否可直接用于某一特定分析，取决于源站实际提供的数据类型与规模，而后者源站未提供。
【使用方法】
该数据集托管于 NCBI BioProject，用户可通过 BioProject 记录页面访问该项目，并借助记录中提供的链接查找其关联的多种数据类型。按照 NCBI 对 BioProject 的说明，该记录为用户提供了一个集中位置，以便定位由该项目产生的不同数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开的生物学研究项目记录。其主题标签明确为转录组或基因表达，项目标题也清晰说明了研究内容与方法组合。然而，关于数据质量的具体指标，如测序深度、重复数、数据完整性、质控结果等，源站未提供。此外，该项目的样本量、统计效力、是否经过同行评议或发表等，源站亦未提供。因此，在使用该数据集时，应结合源站记录中的实际数据与相关说明进行评估。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式与许可条款，源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 记录页面所附的相关说明，并遵循 NCBI 及数据提交方所规定的使用条款。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1536382
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
环境内毒素暴露可能促进气道及喉部炎症，但其对声带成纤维细胞的影响仍未完全明确。本研究整合了bulk RNA测序与网络毒理学方法，以界定原代人声带成纤维细胞（VFFs）对脂多糖（LPS）的转录反应，并评估所选特征是否在独立的大鼠有机粉尘提取物（ODE）暴露模型中得以保留。人VFFs暴露于5 µg/mL LPS 24小时，并使用来自对照组和12.5% ODE暴露动物的鼠声带RNA-seq数据进行跨模型比较。该数据集包含来自6个人VFF样本和6个混合鼠声带样本的双端bulk RNA-seq数据。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
