大鼠海绵体组织单细胞RNA测序分析：海绵体神经损伤诱导勃起功能障碍的细胞异质性与分子改变
研究对大鼠海绵体组织进行单细胞RNA测序分析，旨在揭示海绵体神经损伤诱导的勃起功能障碍中的细胞异质性与分子改变。数据覆盖大鼠海绵体组织的单细胞转录组信息，可用于识别不同细胞类型及其在神经损伤条件下的表达变化，帮助理解勃起功能障碍的细胞与分子机制，并可能为相关干预靶点研究提供基础（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
大鼠海绵体组织单细胞RNA测序分析：海绵体神经损伤诱导勃起功能障碍的细胞异质性与分子改变
PRJNA1268208 是一个围绕大鼠海绵体组织单细胞RNA测序分析而建立的生物项目，其英文全称为 Single-Cell RNA-Seq Analysis of Rat Cavernous Tissue Reveals Cellular Heterogeneity and Molecular Alterations in Cavernous Nerve Injury-Induced Erectile Dysfunction。该项目旨在通过单细胞转录组手段，揭示海绵体神经损伤诱导的勃起功能障碍中存在的细胞异质性与分子改变。数据覆盖大鼠海绵体组织的单细胞转录组信息，可用于识别不同细胞类型及其在神经损伤条件下的表达变化，帮助理解勃起功能障碍的细胞与分子机制，并可能为相关干预靶点研究提供基础。该数据集在 NCBI BioProject 中以编号 1268208 登记，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，本站将其归入损伤、中毒及外因 / 其他分类。
【数据集背景】
该数据集来源于 NCBI BioProject，源站标题为 Single-Cell RNA-Seq Analysis of Rat Cavernous Tiss... (ID 1268208) - BioProject - NCBI。BioProject 是围绕单一研究计划或项目汇集生物数据的记录，这些数据来自单一组织或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便找到该项目所产生的多种数据类型。该项目的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心数据类型与转录组或基因表达相关。研究聚焦于大鼠海绵体组织，并关注海绵体神经损伤诱导的勃起功能障碍这一病理条件，试图从单细胞层面解析细胞异质性与分子改变。
【数据内容】
该数据集包含对大鼠海绵体组织进行单细胞RNA测序分析所获得的数据。其内容覆盖大鼠海绵体组织的单细胞转录组信息，可用于识别不同细胞类型及其在神经损伤条件下的表达变化。通过单细胞分辨率，该数据有助于刻画海绵体组织内细胞群体的异质性，并观察在神经损伤诱导的勃起功能障碍状态下，各类细胞在基因表达层面发生的分子改变。主题标签 Transcriptome or Gene expression 进一步说明，数据主要围绕转录组或基因表达展开。除上述信息外，源站未提供更细的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，登记于 NCBI BioProject，项目编号为 1268208。其英文名称明确指向大鼠海绵体组织的单细胞RNA测序分析，研究对象为大鼠海绵体组织，研究背景为海绵体神经损伤诱导的勃起功能障碍。BioProject 作为数据汇集记录，提供指向该项目所生成多种数据类型的链接入口。除来源站、项目编号、标题及主题标签外，源站未提供关于采集地点、采集时间、样本数量、测序平台或具体实验流程的进一步信息。
【适用场景】
该数据集适用于与勃起功能障碍细胞与分子机制相关的研究场景。具体而言，可用于识别大鼠海绵体组织中的不同细胞类型，并分析这些细胞在海绵体神经损伤条件下的表达变化。它有助于理解神经损伤诱导的勃起功能障碍在细胞和分子层面的改变，并可能为相关干预靶点的研究提供基础。由于主题标签为 Transcriptome or Gene expression，该数据也适用于转录组或基因表达分析相关的探索。除上述适用方向外，源站未提供其他具体应用场景。
【使用方法】
该数据集以 NCBI BioProject 记录的形式提供，用户可通过 BioProject 记录这一统一入口，查找该项目所生成的多种数据类型及其链接。源站描述指出，BioProject 记录为用户提供单一位置以发现为该项目生成的不同数据类型。因此，使用该数据集时，可先访问 NCBI BioProject 中编号 1268208 的记录，再根据记录中提供的链接获取相应数据。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析流程或软件工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集登记于 NCBI BioProject，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据质量指标、样本量、测序深度、覆盖度、批次效应、验证程度等具体质量信息，源站未提供。关于该数据集在物种、组织、疾病模型或实验条件方面的限制，源站未提供。用户在使用时应注意，当前可依据的信息仅限于项目标题、主题标签、来源站及 BioProject 的通用说明，更详细的质量评估与限制说明需参考源站记录中可能提供的其他内容。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，项目编号为 1268208，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制或授权要求，源站未提供。用户如需引用或使用该数据集，应直接访问 NCBI BioProject 中对应的记录页面，以获取源站可能提供的引用与许可信息。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1268208
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
继发于海绵体神经损伤(CNI)的勃起功能障碍(ED)是盆腔手术的常见并发症，但其细胞病理生理学特征仍未完全阐明。在此，我们构建了CNI后大鼠海绵体组织的高分辨率单细胞转录组图谱。我们的分析鉴定了关键细胞群体(如成纤维细胞、内皮细胞、平滑肌细胞、施万细胞和巨噬细胞)中与纤维化、血管功能障碍和轴突变性相关的失调基因网络。该数据集为理解CNI介导的ED以及发现神经再生和组织修复的靶点提供了基础。总体设计：为诱导CNIED，进行了双侧海绵体神经损伤。具体而言，将止血钳完全闭合夹持海绵体神经(CN)，位置在主要盆腔神经节(MPG)远端5 mm处，持续1分钟。对照组大鼠接受相同手术操作但不进行神经压迫。使用阿扑吗啡(100 μg/kg)筛选CNIED大鼠。神经损伤4周后采集大鼠阴茎组织用于进一步研究。原始数据见PRJNA1079907
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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