PRJNA1198076:动脉粥样硬化斑块巨噬细胞驱动腹主动脉瘤形成
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,主题为转录组或基因表达,对应研究动脉粥样硬化斑块巨噬细胞驱动腹主动脉瘤形成

基本信息
资源简介
PRJNA1198076:动脉粥样硬化斑块巨噬细胞驱动腹主动脉瘤形成
该数据集来自 ncbi.nlm.nih.gov,主题为转录组或基因表达,对应研究动脉粥样硬化斑块巨噬细胞驱动腹主动脉瘤形成。源站描述显示,研究建立了由吸烟和高胆固醇血症诱导腹主动脉瘤形成、破裂和死亡的新型临床前模型,发现CSF-1依赖性巨噬细胞在斑块内积累并表现组织降解蛋白酶活性,单细胞RNA测序显示小鼠与人类腹主动脉瘤斑块中巨噬细胞反应保守。数据可用于分析腹主动脉瘤相关基因表达与巨噬细胞反应(来源 ncbi.nlm.nih.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):目前尚无有效的药物治疗能够阻止腹主动脉瘤(AAA)的生长和破裂,而AAA是主要死因之一。我们开发了一种新的临床前模型,显示真正的危险因素(即吸烟(CS)和高胆固醇血症)的相互作用诱导了AAA的形成、破裂和死亡。弹性蛋白断裂源于CS诱导的动脉粥样硬化过程加剧,鉴于动脉粥样硬化是动脉内膜层的疾病,而中膜基本保持完整,这一点意义重大。重要的是,动脉损伤由CSF-1依赖性巨噬细胞(Mφ)驱动,这些细胞在发育中的动脉粥样硬化斑块内积累,并在体内表现出组织降解蛋白水解活性。单细胞RNA测序进一步证明,小鼠和人类AAA的动脉粥样硬化斑块中Mφ反应具有保守性。我们的发现推进了对
【主题与分类】
主题标签:Transcriptome or Gene expression。本站分类:损伤、中毒及外因。
【获取与许可】
源站页面:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1198076
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源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1198076
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
目前尚无有效的药物疗法能够预防腹主动脉瘤(AAA)的生长和破裂,而后者是导致死亡的主要原因之一。我们建立了一种新的临床前模型,显示真正的危险因素(即吸烟(CS)和高胆固醇血症)的相互作用可诱导AAA形成、破裂和死亡。弹性蛋白断裂源于CS诱导的动脉粥样硬化过程加剧,这一点具有重要意义,因为动脉粥样硬化是动脉内膜内层的疾病,而中膜基本保持完整。重要的是,动脉损伤是由CSF-1依赖性巨噬细胞(Mφ)驱动的,这些细胞积聚于正在形成的动脉粥样硬化斑块内,并在体内表现出组织降解性蛋白水解活性。单细胞RNA测序进一步证明,小鼠和人类AAA动脉粥样硬化斑块中的Mφ反应具有保守性。我们的发现推进了对动脉粥样硬化病理后遗症的理解,确立了斑块Mφ作为组织损伤的重要介质,并成为预防AAA生长和破裂的潜在靶点。
总体设计:采用单细胞RNA测序(scRNA-seq)以明确主动脉病变中巨噬细胞的异质性
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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