缺血诱导充血与压疮形成的混合方程/Agent-Based模型：预测脊髓损伤患者更易发生溃疡
数据对应一个结合常微分方程与 Agent-Based 模型的混合模拟，用于研究脊髓损伤后皮肤血流、反应性充血与压力性溃疡形成过程
基本信息
资源简介
缺血诱导充血与压疮形成的混合方程/Agent-Based模型：预测脊髓损伤患者更易发生溃疡
Hybrid Equation/Agent-Based Model of Ischemia-Induced Hyperemia and Pressure Ulcer Formation Predicts Greater Propensity to Ulcerate in Subjects with Spinal Cord Injury
该数据集来自 plos.figshare.com，包含 5 个文件（MAT、ZIP、TIF、DOCX 等），配套论文发表于 PLoS Computational Biology（2013）。数据对应一个结合常微分方程与 Agent-Based 模型的混合模拟，用于研究脊髓损伤后皮肤血流、反应性充血与压力性溃疡形成过程。可用于探索压疮发病机制、比较脊髓损伤者与未损伤对照者的溃疡倾向，并辅助治疗策略的模拟分析（来源 figshare，CC BY 4.0 许可）。
【数据集背景】
配套论文《Hybrid Equation/Agent-Based Model of Ischemia-Induced Hyperemia and Pressure Ulcer Formation Predicts Greater Propensity to Ulcerate in Subjects with Spinal Cord Injury》发表于 PLoS Computational Biology（2013），DOI：10.1371/journal.pcbi.1003070。源站首次发布：2013-05-16。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：压力性溃疡对脊髓损伤（SCI）患者而言是代价高昂且危及生命的并发症。SCI 患者在未溃疡皮肤上也表现出差异性的血流特性。我们假设，一个由皮肤血流及对压力的反应性充血数据所驱动的压疮形成过程计算机模拟，能够为 SCI 后压疮的发病机制和有效治疗提供见解。Agent-Based 模型（ABM）在压疮等空间真实性重要的场景中很有用。基于常微分方程（ODE）的模型在建模反应性充血等生理现象时很有用。据此，我们构建了一个混合模型，将血流相关的 ODE 与皮肤损伤、炎症和溃疡形成的 ABM 相结合。压力与 co
【数据结构与技术规格】
文件数 5 个，合计 626.52 KB。数据集 DOI：10.1371/journal.pcbi.1003070。
【主题与分类】
源站学科分类：Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified、Information Systems not elsewhere classified、Developmental Biology、Marine Biology、Cancer。主题标签：post-SCI pressure ulcers、blood flow、Spinal Cord Injury Pressure ulcers、pressure ulcer formation process、non-injured control subjects、reactive hyperemia、blood flow properties、ulcer formation、post-SCI ulcer formation、pressure ulcer formation。本站分类：损伤、中毒及外因。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Molecular Biology、Biological Sciences not elsewhere classified、Information Systems not elsewhere classified、Developmental Biology、Marine Biology、Cancer。
【获取与许可】
源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Hybrid_Equation_Agent_Based_Model_of_Ischemia_Induced_Hyperemia_and_Pressure_Ulcer_Formation_Predicts_Greater_Propensity_to_Ulcerate_in_Subjects_with_Spinal_Cord_Injury_/703959
使用许可：CC BY 4.0（https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/）。
规范引用：Solovyev, Alexey; Mi, Qi; Tzen, Yi-Ting; Brienza, David; Vodovotz, Yoram (2016). Hybrid Equation/Agent-Based Model of Ischemia-Induced Hyperemia and Pressure Ulcer Formation Predicts Greater Propensity to Ulcerate in Subjects with Spinal Cord Injury. PLOS Computational Biology. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-02，引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取（Figshare）
- 源站标题：Hybrid Equation/Agent-Based Model of Ischemia-Induced Hyperemia and Pressure Ulcer Formation Predicts Greater Propensity to Ulcerate in Subjects with Spinal Cord Injury
- DOI：10.1371/journal.pcbi.1003070
- 发布日期：2013-05-16
- 文件数：5 个
- 文件总体积：626.52 KB
- 源站页面：https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Hybrid_Equation_Agent_Based_Model_of_Ischemia_Induced_Hyperemia_and_Pressure_Ulcer_Formation_Predicts_Greater_Propensity_to_Ulcerate_in_Subjects_with_Spinal_Cord_Injury_/703959
命令行下载
curl -L -o "Dataset S1.MAT" "https://ndownloader.figshare.com/files/6651750"
curl -L -o "Dataset S2.ZIP" "https://ndownloader.figshare.com/files/6651759"
curl -L -o "Dataset S3.ZIP" "https://ndownloader.figshare.com/files/6651762"
curl -L -o "Figure S1.TIF" "https://ndownloader.figshare.com/files/6651765"
curl -L -o "Text S1.DOCX" "https://ndownloader.figshare.com/files/6651771"
文件清单
Dataset S1.MAT（137.44 KB）Dataset S2.ZIP（136.36 KB）Dataset S3.ZIP（7.11 KB）Figure S1.TIF（324.79 KB）Text S1.DOCX（20.83 KB）
文件总体积 626.52 KB（源站 API 实测）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据说明
压力性溃疡对脊髓损伤（SCI）患者而言是代价高昂且危及生命的并发症。SCI患者的未溃疡皮肤还表现出不同的血流特性。我们假设，结合皮肤血流及压力反应性充血数据的计算机模拟压力性溃疡形成过程，能够为SCI后压力性溃疡的发病机制及有效治疗提供见解。基于代理的模型（ABM）在压力性溃疡等空间真实性重要的场景中颇为有用。基于常微分方程（ODE）的模型则适用于模拟反应性充血等生理现象。据此，我们构建了一个混合模型，该模型将血流相关的ODE与皮肤损伤、炎症及溃疡形成的ABM相结合。该模型展示了压力与溃疡形成过程之间的关系，以及压力性溃疡形成的其他几种重要特征模式。
该模型中的常微分方程部分已根据未受伤人类受试者在实验性压力反应后血流相关数据，或脊髓损伤患者的数据进行了校准。该模型预测，与未受伤对照组相比，脊髓损伤患者在压力作用下形成溃疡的倾向更高，因此可作为脊髓损伤后溃疡形成的新型诊断平台。
许可
CC BY 4.0
引用
学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pcbi.1003070（source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/_Hybrid_Equation_Agent_Based_Model_of_Ischemia_Induced_Hyperemia_and_Pressure_Ulcer_Formation_Predicts_Greater_Propensity_to_Ulcerate_in_Subjects_with_Spinal_Cord_Injury_/703959）。
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