GSE194390：血管成形术诱导损伤动脉的表观基因组重塑

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源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE194390

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数据说明

新生内膜增生（IH）是狭窄性血管疾病的主要病因。其主要由平滑肌细胞增殖所驱动并持续存在。关于IH的表观基因组学研究仅限于体外模型，IH潜在的表观遗传机制仍知之甚少。本研究整合了IH啮齿动物模型中的体内表观基因组定位、条件性基因敲除、基因转移和药理学信息。来自受损（易发生IH）大鼠动脉的数据显示，H3K27me3（一种基因抑制标记）的全基因组占据率激增。这与损伤后以基因激活而非抑制为主的传统观点相悖，令人意外。进一步分析表明，H3K27me3富集从促增殖基因转移至抗增殖基因，而在促增殖基因处则积累了基因激活标记H3K27ac。与此一致，H3K27ac及其阅读器BRD4在调控Ezh2表达的Ezh2处共富集。此外，H3K27me3书写器EZH2正向调控另一种近期鉴定的促IH染色质调节因子UHRF1。

因此，研究结果揭示了损伤诱导的H3K27me3在表观基因组景观中特定位点的重新分布，涉及BRD4->EZH2->UHRF1的层级调控，并可能指导向治疗IH的转化，鉴于这些因子均为药物靶点。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。