年龄相关性黄斑变性遗传研究

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT00357578

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：年龄相关性黄斑变性。年龄相关性黄斑变性（AMD）是50岁以上患者中最常见的致盲原因。尽管遗传和环境因素似乎都在该病的发病机制中起作用，但尚未发现常见的基因突变。本初步研究旨在测试评估可能与AMD发病机制相关的基因表达模式的可行性。感兴趣的基因涉及伤口修复、细胞损伤和细胞死亡过程。我们希望在非眼部部位采集的组织中，评估AMD患者和非AMD患者这些基因的表达情况。将获取62名患者的皮肤成纤维细胞活检样本和循环单核细胞；其中14名无AMD，14名至少有一个大的（大于125微米）玻璃膜疣、伴有地图样萎缩和/或来自AMD的脉络膜新生血管，10名仅有地图样萎缩，以及20名有脉络膜新生血管和/或盘状瘢痕。

这些组织的基因表达模式将通过多种技术进行检测，包括聚合酶链反应、Northern印迹分析、差异显示和微阵列技术。随后，将AMD患者的基因表达模式与年龄相匹配的对照组受试者进行比较。主要结果是确定从AMD患者获取皮肤和单核细胞样本、从这些样本中提取RNA以及研究基因表达模式的可行性。这项研究将为研究人员提供开展潜在诊断测试后续研究所需的信息。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。