静脉曲张全基因组关联研究数据集

该数据集为静脉曲张全基因组关联研究的汇总统计数据,以表格形式呈现,包含基因变异与疾病关联的统计指标,主要用于遗传流行病学和生物信息学领域,以探索静脉曲张的遗传基础和相关机制。

kaggle
2023-07-05 更新
浏览 8
静脉曲张基因组关联研究

基本信息

大小
0.68 GB
创建/更新时间
2023-07-05

资源简介

该数据集是一个针对静脉曲张的全基因组关联研究(GWAS)的汇总统计数据集合。它包含了通过大规模遗传分析获得的基因变异与静脉曲张疾病关联的统计指标,如p值、效应大小等。数据来源于公开的基因组关联研究,以表格形式存储,主要用于遗传流行病学、疾病遗传机制探索以及生物信息学分析等领域的研究。

原始链接

https://www.kaggle.com/datasets/mariusc/varicose-veins-gwas

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使用方式

数据集获取

方式一:KaggleHub(Python,推荐 AI Agent 使用)

# 前置依赖: pip install kagglehub
import kagglehub

path = kagglehub.dataset_download("mariusc/varicose-veins-gwas")
print("数据已下载至:", path)

方式二:Kaggle CLI(命令行)

# 前置条件: 注册 Kaggle 账号, Settings > API > Create New Token
# 将 kaggle.json 放到 ~/.kaggle/ 并 chmod 600
pip install kaggle
kaggle datasets download -d mariusc/varicose-veins-gwas
unzip varicose-veins-gwas.zip -d varicose-veins-gwas/

数据说明

该数据集是一个针对静脉曲张的全基因组关联研究(GWAS)的汇总统计数据集合。它包含了通过大规模遗传分析获得的基因变异与静脉曲张疾病关联的统计指标,如p值、效应大小等。数据来源于公开的基因组关联研究,以表格形式存储,主要用于遗传流行病学、疾病遗传机制探索以及生物信息学分析等领域的研究。

数据加载示例(表格/文本类)

import pandas as pd, glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))

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