猪脐疝相关基因变异与表达分析数据集

该数据集包含基于全外显子组和转录组测序的猪脐疝相关基因变异与表达分析数据,涵盖SNP和InDel变异列表、基因型、变异注释、功能后果预测以及GO生物过程富集结果等多种模态,主要用于研究猪脐疝的遗传机制、候选基因筛选和功能分析,为动物遗传育种和疾病模型研究提供数据支持。

Ibelli, Adriana Mércia Guaratini; Savoldi, Igor Ricardo; Zanella, Ricardo; Peixoto, Jane de Oliveira; Lagos, Essamai Brizola; Lopes, Jader Silva; Pires, Michele Porto; Ledur, Mônica Corrêa; Mores, Marcos Antônio Zanella; Cantão, Maurício Egídio
Figshare
2021-11-23 更新
猪脐疝遗传机制动物基因组变异分析
创建时间2021-11-14
更新时间2021-11-23
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https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_of_A_joint_analysis_using_exome_and_transcriptome_data_identifiescandidate_polymorphisms_and_genes_involved_with_umbilical_hernia_in_pigs/17007308/1

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资源简介

该数据集是研究猪脐疝遗传机制的关键数据文件,基于全外显子组和转录组测序数据构建。数据包含多个表格和图表,具体包括:正常与脐疝患病猪之间的SNP和InDel变异列表、变异基因型、通过VEP工具预测的变异注释与功能后果、脐疝相关多态性与基因汇总,以及基于DAVID和Panther数据库的GO生物过程富集分析结果。数据来源于实验测序,适用于猪脐疝遗传基础、候选基因筛选、功能富集分析等研究方向,对动物遗传育种和疾病模型研究具有重要价值。

提供机构:Ibelli, Adriana Mércia Guaratini; Savoldi, Igor Ricardo; Zanella, Ricardo; Peixoto, Jane de Oliveira; Lagos, Essamai Brizola; Lopes, Jader Silva; Pires, Michele Porto; Ledur, Mônica Corrêa; Mores, Marcos Antônio Zanella; Cantão, Maurício Egídio

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影像Additional file 1 of A joint analysis using exome and transcriptome data identifies candidate polymorphisms and genes involved with umbilical hernia in pigs