慢性排斥或非同种免疫移植损伤的人肾移植肾切除样本单细胞RNA测序数据
该数据集来自ega-archive.org,包含五例人肾同种异体移植肾切除样本的原始单细胞RNA测序数据,样本涵盖慢性移植排斥、慢性肾盂肾炎合并肾动脉狭窄导致的非同种免疫移植损伤、复发性局灶节段性肾小球硬化,以及真菌性假性动脉瘤和肾静脉血栓对照

基本信息
资源简介
慢性排斥或非同种免疫移植损伤的人肾移植肾切除样本单细胞RNA测序数据
Single-cell RNA sequencing of human kidney transplant nephrectomies with chronic rejection or non-alloimmune graft injury
该数据集来自ega-archive.org,包含五例人肾同种异体移植肾切除样本的原始单细胞RNA测序数据,样本涵盖慢性移植排斥、慢性肾盂肾炎合并肾动脉狭窄导致的非同种免疫移植损伤、复发性局灶节段性肾小球硬化,以及真菌性假性动脉瘤和肾静脉血栓对照。数据可用于研究移植肾慢性损伤的细胞组成与转录特征,比较同种免疫与非同种免疫损伤机制(来源 EGA)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):该数据集包含五个新的肾同种异体移植肾切除样本的原始单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据,用于构建以下研究中所述内容: Genomics Chromium 5’单细胞试剂盒(v2)运行。测序使用Illumina Novaseq仪器进行。样本命名为TXN2(EGAN00002519570,真菌性假性动脉瘤,对照数据集)、TXN3(EGAN00002235628,肾静脉血栓,对照数据集)、TXN5(EGAN00002519573,慢性移植排斥)、TXN6(EGAN00002519572,慢性肾盂肾炎和肾动脉狭窄,非同种免疫移植损伤数据集)、TXN7(EGAN00002519576,复发性局灶节段性肾小球硬化,非同种免疫移植损伤数据集)。
【主题与分类】
主题标签:None。本站分类:泌尿生殖系统疾病。
【获取与许可】
源站页面:https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001015631
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
(2025). Single-cell RNA sequencing of human kidney transplant nephrectomies with chronic rejection or non-alloimmune graft injury [Dataset]. https://ega-archive.org/datasets/EGAD00001015631
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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